33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1824 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1824  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.044813  normal  0.779057 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3879  hypothetical protein  34.08 
 
 		 287 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1605  hypothetical protein  32.85 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0824779 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1104  hypothetical protein  31.65 
 
 		 267 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0726  hypothetical protein  32.49 
 
 		 274 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1274  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  34.3 
 
 		 268 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.303048 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1028  hypothetical protein  31.7 
 
 		 268 aa  132  6.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0747  hypothetical protein  33.46 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000662  hypothetical protein  33.6 
 
 		 274 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.281992  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1685  hypothetical protein  31.84 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385005  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1725  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  33.57 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0109136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1317  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  33.57 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807022 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3994  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  33.57 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236352  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.67 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1331  hypothetical protein  31.7 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4487  hypothetical protein  36.4 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.954296  normal  0.620728 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21940  hypothetical protein  33.58 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000158953 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1874  hypothetical protein  33.58 
 
 		 269 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1398  hypothetical protein  30.57 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.975132  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0752  hypothetical protein  27.38 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0829  hypothetical protein  27 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1472  hypothetical protein  29.18 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1497  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.22 
 
 		 558 aa  53.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0276487 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.09 
 
 		 499 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000242867  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  31.2 
 
 		 512 aa  49.7  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.91 
 
 		 478 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9183  hypothetical protein  21.57 
 
 		 350 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1468  hypothetical protein  26.84 
 
 		 393 aa  46.6  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1510  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  37.33 
 
 		 424 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000184999  normal  0.571853 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0987  metalloenzyme domain-containing protein  26.05 
 
 		 428 aa  44.3  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0593  hypothetical protein  31.82 
 
 		 128 aa  43.9  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.91 
 
 		 262 aa  42.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30785  predicted protein  24.8 
 
 		 999 aa  42.4  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.778067 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>