45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1510 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1510  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 
424 aa  865    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000184999  normal  0.571853 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0344  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  72.34 
 
 
417 aa  649    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.828514  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4307  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  38.79 
 
 
468 aa  270  5e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0982  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.43 
 
 
445 aa  268  2e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.503939  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3337  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  37.38 
 
 
468 aa  264  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.912336 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0465  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  35.27 
 
 
466 aa  231  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.267369  unclonable  0.000014976 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0314  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.1 
 
 
447 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2592  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.18 
 
 
447 aa  153  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3061  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.38 
 
 
447 aa  152  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.73632 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17290  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.29 
 
 
453 aa  143  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0906  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.7 
 
 
449 aa  143  5e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0766913 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1107  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.08 
 
 
448 aa  134  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1202  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.27 
 
 
447 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.225173  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2468  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28 
 
 
434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000403556  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0470  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.5 
 
 
559 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000156785  hitchhiker  0.00144539 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0237  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.4 
 
 
510 aa  109  8.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.218824  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0675  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.67 
 
 
438 aa  108  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.562473 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17270  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.67 
 
 
547 aa  104  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5256  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25 
 
 
530 aa  100  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3572  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  25.33 
 
 
506 aa  97.1  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3025  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.59 
 
 
532 aa  95.9  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.605449  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1968  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.12 
 
 
587 aa  93.6  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5113  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.85 
 
 
545 aa  92  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.271498  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3443  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.47 
 
 
537 aa  90.5  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3043  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.39 
 
 
541 aa  86.3  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2241  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.8 
 
 
517 aa  84.7  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1960  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.57 
 
 
534 aa  83.6  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.151896  hitchhiker  0.00177875 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3268  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.6 
 
 
602 aa  83.6  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2813  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.14 
 
 
462 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2150  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.32 
 
 
516 aa  80.9  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.284263  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1125  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.95 
 
 
562 aa  80.5  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2286  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.64 
 
 
685 aa  77.4  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2285  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.8 
 
 
724 aa  76.6  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1628  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.48 
 
 
590 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0219  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.6 
 
 
964 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.205054 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4867  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.41 
 
 
660 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2343  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.3 
 
 
628 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0220  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.7 
 
 
533 aa  51.2  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000131562  normal  0.0129038 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1166  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.7 
 
 
542 aa  50.1  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.284742  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  20.33 
 
 
558 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081009 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4591  hypothetical protein  22.99 
 
 
565 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1824  hypothetical protein  37.33 
 
 
278 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.044813  normal  0.779057 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2671  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.76 
 
 
665 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4593  hypothetical protein  20.93 
 
 
550 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0617  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.11 
 
 
684 aa  43.5  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>