50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0237 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0237  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 		 510 aa  1037    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.218824  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0470  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.99 
 
 		 559 aa  226  9e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000156785  hitchhiker  0.00144539 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17270  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.93 
 
 		 547 aa  222  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17290  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.85 
 
 		 453 aa  201  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0314  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.91 
 
 		 447 aa  197  5.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3061  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.81 
 
 		 447 aa  190  7e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.73632 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5256  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.13 
 
 		 530 aa  182  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2592  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.48 
 
 		 447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1107  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.36 
 
 		 448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0982  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.78 
 
 		 445 aa  172  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.503939  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1202  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.14 
 
 		 447 aa  171  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.225173  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1960  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.75 
 
 		 534 aa  171  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.151896  hitchhiker  0.00177875 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0906  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.4 
 
 		 449 aa  169  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0766913 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3337  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.21 
 
 		 468 aa  167  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.912336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4307  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.44 
 
 		 468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3025  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.96 
 
 		 532 aa  162  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.605449  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0465  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.54 
 
 		 466 aa  155  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.267369  unclonable  0.000014976 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3443  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.52 
 
 		 537 aa  154  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1125  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.09 
 
 		 562 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2286  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.83 
 
 		 685 aa  139  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2150  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.43 
 
 		 516 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.284263  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3043  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.12 
 
 		 541 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4734  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.22 
 
 		 505 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5113  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.92 
 
 		 545 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.271498  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2285  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.74 
 
 		 724 aa  127  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4593  hypothetical protein  25.44 
 
 		 550 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2241  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.54 
 
 		 517 aa  111  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1510  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.4 
 
 		 424 aa  109  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000184999  normal  0.571853 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0219  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.35 
 
 		 964 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.205054 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3268  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.3 
 
 		 602 aa  104  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1628  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29 
 
 		 590 aa  103  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0675  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.47 
 
 		 438 aa  102  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.562473 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2813  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.81 
 
 		 462 aa  100  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4594  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.72 
 
 		 553 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.59 
 
 		 558 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081009 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3572  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  22.22 
 
 		 506 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2468  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  20.79 
 
 		 434 aa  96.7  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000403556  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0344  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.68 
 
 		 417 aa  91.3  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.828514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1968  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.66 
 
 		 587 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4867  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.23 
 
 		 660 aa  87.4  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1166  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.26 
 
 		 542 aa  77.8  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.284742  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4591  hypothetical protein  25.43 
 
 		 565 aa  77  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0625  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.74 
 
 		 681 aa  71.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0617  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.96 
 
 		 684 aa  68.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4910  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.26 
 
 		 682 aa  67  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2671  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.72 
 
 		 665 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0220  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.08 
 
 		 533 aa  65.5  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000131562  normal  0.0129038 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2343  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.14 
 
 		 628 aa  57  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2730  putative phosphodiesterase-nucleotide pyrophosphatase  23.49 
 
 		 744 aa  50.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.204405  normal  0.277577 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3048  hypothetical protein  26.36 
 
 		 676 aa  43.9  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.489525  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>