42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0244 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 		 558 aa  1154    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081009 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4593  hypothetical protein  52.48 
 
 		 550 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4594  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  49.55 
 
 		 553 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4591  hypothetical protein  40.93 
 
 		 565 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4734  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.52 
 
 		 505 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0470  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.73 
 
 		 559 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000156785  hitchhiker  0.00144539 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17270  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.5 
 
 		 547 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3025  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.69 
 
 		 532 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.605449  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0237  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.59 
 
 		 510 aa  98.6  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.218824  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5256  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.3 
 
 		 530 aa  91.3  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3268  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.99 
 
 		 602 aa  86.3  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3337  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.4 
 
 		 468 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.912336 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1125  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.33 
 
 		 562 aa  75.1  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5113  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.12 
 
 		 545 aa  74.3  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.271498  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4307  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.22 
 
 		 468 aa  70.1  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17290  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.22 
 
 		 453 aa  66.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2671  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.18 
 
 		 665 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3043  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.45 
 
 		 541 aa  65.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0906  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.75 
 
 		 449 aa  66.2  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0766913 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0465  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.16 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.267369  unclonable  0.000014976 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2592  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.84 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0982  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.17 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.503939  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3443  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.84 
 
 		 537 aa  61.2  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0675  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.41 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.562473 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1960  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.4 
 
 		 534 aa  57  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.151896  hitchhiker  0.00177875 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2285  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.86 
 
 		 724 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0314  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.15 
 
 		 447 aa  53.9  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0344  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.87 
 
 		 417 aa  52.8  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.828514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3061  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.43 
 
 		 447 aa  52.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.73632 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3572  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  22.4 
 
 		 506 aa  51.6  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2150  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.34 
 
 		 516 aa  51.2  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.284263  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1107  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.09 
 
 		 448 aa  50.4  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1510  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  20.33 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000184999  normal  0.571853 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1202  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.54 
 
 		 447 aa  49.3  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.225173  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2286  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.27 
 
 		 685 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4867  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  45.28 
 
 		 660 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0617  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.22 
 
 		 684 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2241  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.68 
 
 		 517 aa  45.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1628  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.95 
 
 		 590 aa  46.2  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1968  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25 
 
 		 587 aa  45.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0219  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  20.83 
 
 		 964 aa  44.3  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.205054 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0220  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.63 
 
 		 533 aa  43.5  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000131562  normal  0.0129038 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>