49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1628 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1628  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 		 590 aa  1224    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2285  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  40 
 
 		 724 aa  427  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2286  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  37.9 
 
 		 685 aa  375  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0237  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29 
 
 		 510 aa  103  9e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.218824  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4307  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  33.04 
 
 		 468 aa  98.2  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0982  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.72 
 
 		 445 aa  95.9  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.503939  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3337  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.8 
 
 		 468 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.912336 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17290  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.4 
 
 		 453 aa  92  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0906  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.14 
 
 		 449 aa  89.7  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0766913 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0465  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.73 
 
 		 466 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.267369  unclonable  0.000014976 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0470  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.5 
 
 		 559 aa  87  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000156785  hitchhiker  0.00144539 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1107  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.97 
 
 		 448 aa  86.7  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3061  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.77 
 
 		 447 aa  85.1  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.73632 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0314  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.94 
 
 		 447 aa  80.5  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1960  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.06 
 
 		 534 aa  80.1  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.151896  hitchhiker  0.00177875 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0344  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  34.29 
 
 		 417 aa  80.1  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.828514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3025  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.75 
 
 		 532 aa  79  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.605449  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1166  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.18 
 
 		 542 aa  79.3  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.284742  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2468  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  33.57 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000403556  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1202  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30 
 
 		 447 aa  78.6  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.225173  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2592  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.96 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0675  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.39 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.562473 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2813  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.65 
 
 		 462 aa  77  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1968  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.12 
 
 		 587 aa  74.3  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0220  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  20.16 
 
 		 533 aa  72.8  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000131562  normal  0.0129038 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5113  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.1 
 
 		 545 aa  71.6  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.271498  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5256  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.44 
 
 		 530 aa  71.6  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1510  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.48 
 
 		 424 aa  70.5  0.00000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000184999  normal  0.571853 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2343  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  20.74 
 
 		 628 aa  70.1  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0219  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.06 
 
 		 964 aa  70.1  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.205054 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3572  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  31.16 
 
 		 506 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4910  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.4 
 
 		 682 aa  68.2  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2671  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  33.33 
 
 		 665 aa  68.2  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3443  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.42 
 
 		 537 aa  67.4  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17270  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.83 
 
 		 547 aa  65.5  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0617  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.16 
 
 		 684 aa  62  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3268  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.03 
 
 		 602 aa  62  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3043  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.84 
 
 		 541 aa  61.2  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4867  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.17 
 
 		 660 aa  60.5  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1125  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.68 
 
 		 562 aa  58.9  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0625  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.41 
 
 		 681 aa  57.8  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2241  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.75 
 
 		 517 aa  56.2  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2150  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.07 
 
 		 516 aa  49.7  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.284263  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4734  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.1 
 
 		 505 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4593  hypothetical protein  31.25 
 
 		 550 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.95 
 
 		 558 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081009 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4617  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.55 
 
 		 422 aa  44.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1690  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.84 
 
 		 490 aa  44.3  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4594  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.92 
 
 		 553 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>