60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II1028 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II1028  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  560  1e-158  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000662  hypothetical protein  79.56 
 
 		 274 aa  457  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.281992  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1605  hypothetical protein  64.37 
 
 		 268 aa  353  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0824779 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1331  hypothetical protein  62.98 
 
 		 291 aa  348  4e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  63.43 
 
 		 282 aa  348  5e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3879  hypothetical protein  62.84 
 
 		 287 aa  348  6e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1685  hypothetical protein  63.6 
 
 		 268 aa  348  6e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4487  hypothetical protein  64.98 
 
 		 265 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.954296  normal  0.620728 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0726  hypothetical protein  61.39 
 
 		 274 aa  335  5e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0747  hypothetical protein  61.78 
 
 		 274 aa  335  5.999999999999999e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1274  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  60.77 
 
 		 268 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.303048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1317  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  60.38 
 
 		 268 aa  329  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807022 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3994  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  60 
 
 		 273 aa  328  4e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236352  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1725  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  60 
 
 		 278 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0109136 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1874  hypothetical protein  61.3 
 
 		 269 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21940  hypothetical protein  60.54 
 
 		 269 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000158953 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1104  hypothetical protein  50.38 
 
 		 267 aa  279  3e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0752  hypothetical protein  51.35 
 
 		 268 aa  270  1e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0829  hypothetical protein  50.97 
 
 		 268 aa  267  1e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1398  hypothetical protein  42.8 
 
 		 261 aa  216  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.975132  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1824  hypothetical protein  31.7 
 
 		 278 aa  132  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.044813  normal  0.779057 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1472  hypothetical protein  30.89 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.91 
 
 		 499 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000242867  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.52 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0836  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.16 
 
 		 499 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1497  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.66 
 
 		 558 aa  62.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0276487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1440  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.12 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.64 
 
 		 478 aa  60.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.39 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.83 
 
 		 433 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0270594 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0732  hypothetical protein  25.11 
 
 		 429 aa  53.9  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.368831  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3187  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  20.53 
 
 		 289 aa  52.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.280318  normal  0.0143084 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1449  phosphodiesterase I  25.22 
 
 		 417 aa  52  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.982314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1625  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.52 
 
 		 431 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.018842  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  24.45 
 
 		 713 aa  51.6  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  24.45 
 
 		 417 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1367  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  20.98 
 
 		 431 aa  50.4  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6200  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.77 
 
 		 413 aa  48.9  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0082  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.4 
 
 		 462 aa  48.9  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106273  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0713  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.36 
 
 		 496 aa  48.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9183  hypothetical protein  23.14 
 
 		 350 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1841  phosphodiesterase I  24.66 
 
 		 400 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126105  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47390  predicted protein  27.01 
 
 		 668 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  23.44 
 
 		 1967 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3392  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  20.38 
 
 		 414 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5730  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1707  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.13 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  hitchhiker  4.53263e-17 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0636  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.71 
 
 		 363 aa  44.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.288673 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.41 
 
 		 456 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.579511 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0987  metalloenzyme domain-containing protein  22.96 
 
 		 428 aa  43.9  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0400  Phosphodiesterase I  24.35 
 
 		 422 aa  43.9  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.12 
 
 		 455 aa  43.9  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.34184  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.07 
 
 		 430 aa  42.7  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7345  hypothetical protein  21.16 
 
 		 531 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4617  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.61 
 
 		 422 aa  42.7  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37402  predicted protein  30.95 
 
 		 890 aa  42.7  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.174724  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70997  phosphodiesterase; putative nucleotide pyrophosphatase precursor  22.5 
 
 		 709 aa  42.7  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.42018 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0438  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.08 
 
 		 437 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0368  type I phosphodiesterase  21.08 
 
 		 437 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000500368  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30785  predicted protein  25.88 
 
 		 999 aa  42  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.778067 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>