29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1785 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1785  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 		 574 aa  1191    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2550  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.7 
 
 		 321 aa  104  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.49777  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5637  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.75 
 
 		 489 aa  80.9  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2169  phosphodiesterase I  24.71 
 
 		 433 aa  70.5  0.00000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2080  phosphodiesterase I  24.71 
 
 		 433 aa  69.7  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3195  hemopexin repeat-containing protein  25.23 
 
 		 262 aa  69.3  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000696311  hitchhiker  0.000000000670294 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9183  hypothetical protein  26.67 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4286  hypothetical protein  27.02 
 
 		 678 aa  64.3  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.119503  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29530  uncharacterized AP superfamily protein  23.58 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6789  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.08 
 
 		 415 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0417562 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1007  hypothetical protein  26.42 
 
 		 394 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.764535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0975  hypothetical protein  27.36 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0968  hypothetical protein  27.36 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1644  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.6 
 
 		 519 aa  62.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2638  hypothetical protein  25.83 
 
 		 676 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.828392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  26.2 
 
 		 1967 aa  59.3  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1868  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.97 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1440  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.76 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7345  hypothetical protein  25.93 
 
 		 531 aa  57.4  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3392  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.13 
 
 		 414 aa  54.3  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3187  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.88 
 
 		 289 aa  52.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.280318  normal  0.0143084 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3048  hypothetical protein  26.2 
 
 		 676 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.489525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7531  hypothetical protein  28.48 
 
 		 706 aa  51.2  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.691275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3458  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.9 
 
 		 687 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149528  normal  0.571411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3216  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.03 
 
 		 629 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2969  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.44 
 
 		 558 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00836901  hitchhiker  0.00161075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0126  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.8 
 
 		 279 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  22.94 
 
 		 417 aa  48.5  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3093  PA14 domain protein  21.16 
 
 		 569 aa  47.4  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>