95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2738 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_2738  sulfatase  100 
 
 
427 aa  865    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  33.96 
 
 
478 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0836  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.8 
 
 
499 aa  63.9  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.12 
 
 
499 aa  63.2  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000242867  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  38.24 
 
 
559 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0888  sulfatase  27.33 
 
 
517 aa  57.4  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000191984  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2507  sulfatase  26.29 
 
 
873 aa  57  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0936334  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0869  hypothetical protein  23.98 
 
 
377 aa  55.8  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.543973  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  29.33 
 
 
474 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  30.89 
 
 
493 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  26.79 
 
 
473 aa  54.7  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2284  sulfatase  32.76 
 
 
784 aa  54.3  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2434  sulfatase  35.29 
 
 
564 aa  53.5  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11149  conserved hypothetical protein  29.36 
 
 
565 aa  53.5  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.122121  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0945  sulfatase  31.16 
 
 
517 aa  53.5  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3379  sulfatase  31.16 
 
 
517 aa  53.5  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.760538  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0996  sulfatase  31.16 
 
 
517 aa  53.5  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.884308  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0585  sulfatase domain-containing protein  24.65 
 
 
614 aa  53.5  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1248  sulfatase  35.96 
 
 
501 aa  53.5  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  30.51 
 
 
511 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7372  N-acetylglucosamine-6-sulfatase  31.82 
 
 
513 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.834841 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.94 
 
 
262 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4179  sulfatase  30 
 
 
514 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.10978 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2519  sulfatase  31.67 
 
 
507 aa  50.8  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602817  normal  0.0521471 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0575  sulfatase family protein  23.39 
 
 
608 aa  50.8  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122436  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  33.65 
 
 
512 aa  50.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  30.58 
 
 
535 aa  49.7  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0014  sulfatase  31.09 
 
 
615 aa  50.1  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0637  sulfatase  33.04 
 
 
457 aa  49.7  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0570  sulfatase family protein  28.45 
 
 
602 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1131  sulfatase  31.68 
 
 
593 aa  48.9  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4617  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  42.86 
 
 
422 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25880  Sulfatase protein  29.79 
 
 
717 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1836  sulfatase  30.77 
 
 
514 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  31.37 
 
 
586 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0662  sulfatase  28.57 
 
 
630 aa  48.9  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0999  sulfatase  31.68 
 
 
593 aa  48.5  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.477664  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3181  sulfatase  31.25 
 
 
523 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0174  sulfatase  30.28 
 
 
630 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.326693  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0584  sulfatase family protein  28.45 
 
 
602 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07660  putative alkaline phosphatase  36.25 
 
 
556 aa  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0307929  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3858  sulfatase  30.36 
 
 
519 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0969664  normal  0.154261 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1074  sulfatase  33.64 
 
 
552 aa  48.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0111181 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0432  phosphoglycerol transferase  28.74 
 
 
653 aa  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0126  sulfatase  22.98 
 
 
467 aa  47.4  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2827  sulfatase  28.91 
 
 
545 aa  47.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1708  sulfatase  30.08 
 
 
449 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0122  sulfatase protein  31.73 
 
 
508 aa  47.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7345  hypothetical protein  23.58 
 
 
531 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617386  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3211  sulfatase  27.03 
 
 
612 aa  47.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139741  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3581  hypothetical protein  28.57 
 
 
700 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.377432  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0174  sulfatase  30.86 
 
 
670 aa  47  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0369  sulfatase  28.49 
 
 
628 aa  47  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151431  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  27.43 
 
 
490 aa  47  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47845  predicted protein  29.81 
 
 
620 aa  46.6  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0593792  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0240  sulfatase  27.1 
 
 
678 aa  46.6  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1567  sulfatase  28.28 
 
 
523 aa  46.6  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0183451  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  30.19 
 
 
489 aa  46.6  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1890  sulfatase  32.38 
 
 
493 aa  46.6  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.461915 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3110  sulfatase  29.3 
 
 
492 aa  46.6  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1432  sulfatase  26.98 
 
 
522 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.209793 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42670  hypothetical protein  27.62 
 
 
700 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01110  arylsulfatase A family protein  31.36 
 
 
480 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0826  sulfatase  25.32 
 
 
627 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000772105  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.18 
 
 
312 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  31.5 
 
 
502 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3632  sulfatase  33.33 
 
 
662 aa  45.8  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  34.95 
 
 
537 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3468  sulfatase  32.04 
 
 
466 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0987  metalloenzyme domain-containing protein  34.29 
 
 
428 aa  45.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1843  sulfatase  33.12 
 
 
826 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.10365 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1150  choline sulfatase  30.77 
 
 
496 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02464  phosphoglycerol transferase  25.74 
 
 
645 aa  45.8  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4030  sulfatase  30.63 
 
 
765 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.868128  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2600  sulfatase  27.4 
 
 
447 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003619  phosphoglycerol transferase I  27.72 
 
 
649 aa  44.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878946  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3685  sulfatase  31.91 
 
 
1009 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0329595  hitchhiker  0.00309505 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2135  sulfatase  27.66 
 
 
429 aa  44.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3900  sulfatase  29.29 
 
 
489 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2242  sulfatase  31.9 
 
 
512 aa  44.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5375  sulfatase  27.68 
 
 
560 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1306  sulfatase  29.73 
 
 
498 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07634  conserved hypothetical protein  25.69 
 
 
562 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.89066 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04770  arylsulfatase A family protein  32.41 
 
 
478 aa  44.3  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0377  sulfatase  29.17 
 
 
671 aa  44.3  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000264889  hitchhiker  0.0000000000000148489 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4186  sulfatase  29.46 
 
 
519 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360689  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2716  sulfatase domain-containing protein  28.4 
 
 
665 aa  44.3  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.324091  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0182  sulfatase  25.45 
 
 
653 aa  43.5  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1399  sulfatase  27.38 
 
 
670 aa  43.5  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2202  sulfatase  27.36 
 
 
596 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0565  sulfatase  26.19 
 
 
581 aa  43.5  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28180  arylsulfatase A family protein  25.16 
 
 
480 aa  43.5  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2095  sulfatase  25.95 
 
 
594 aa  43.1  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2686  twin-arginine translocation pathway signal  30.15 
 
 
490 aa  43.1  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1069  sulfatase  27.08 
 
 
641 aa  43.1  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>