296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0240 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_0174  sulfatase  72.24 
 
 
670 aa  992    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4628  sulfatase  72.85 
 
 
660 aa  1011    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3456  sulfatase  53.94 
 
 
657 aa  700    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383156  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3507  sulfatase  67.6 
 
 
646 aa  944    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003619  phosphoglycerol transferase I  56.08 
 
 
649 aa  731    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878946  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4012  sulfatase  72.69 
 
 
654 aa  984    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3803  sulfatase  73.2 
 
 
654 aa  982    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1915  sulfatase  52.42 
 
 
654 aa  673    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256965  normal  0.471265 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3562  sulfatase  68.37 
 
 
682 aa  982    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4201  sulfatase  74.33 
 
 
654 aa  1004    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000207245  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3632  sulfatase  69.59 
 
 
662 aa  960    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0432  phosphoglycerol transferase  54.87 
 
 
653 aa  700    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0154  sulfatase  69.42 
 
 
656 aa  953    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02464  phosphoglycerol transferase  54.05 
 
 
645 aa  724    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4129  sulfatase  73.86 
 
 
654 aa  996    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3808  sulfatase  71.91 
 
 
654 aa  1003    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3884  sulfatase  73.15 
 
 
654 aa  1009    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0240  sulfatase  100 
 
 
678 aa  1380    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0138  sulfatase  74.02 
 
 
654 aa  1002    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000529062  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4333  sulfatase  73.83 
 
 
654 aa  1007    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2716  sulfatase domain-containing protein  49.69 
 
 
665 aa  624  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.324091  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1399  sulfatase  48.16 
 
 
670 aa  578  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1979  sulfatase  49.17 
 
 
663 aa  558  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5023  sulfatase  42.57 
 
 
646 aa  477  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0910313  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0319  sulfatase  38.14 
 
 
646 aa  391  1e-107  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0080  sulfatase  40.47 
 
 
634 aa  390  1e-107  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.204618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3723  sulfatase  34.1 
 
 
633 aa  276  6e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0526  sulfatase  31.22 
 
 
633 aa  275  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3618  sulfatase  32.33 
 
 
633 aa  269  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2948  hypothetical protein  29.94 
 
 
633 aa  262  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.146367  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1625  sulfatase  31.67 
 
 
635 aa  257  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413884  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1932  sulfatase  32.57 
 
 
666 aa  253  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3858  sulfatase  32.69 
 
 
647 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.499421  normal  0.910234 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4499  sulfatase  32.2 
 
 
649 aa  251  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000368912 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0320  sulfatase  33.2 
 
 
640 aa  251  4e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1753  sulfatase  30.76 
 
 
696 aa  248  2e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.100359  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3051  sulfatase  28.71 
 
 
652 aa  246  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.535064  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2475  sulfatase  32.26 
 
 
652 aa  242  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84195 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4465  sulfatase  32.13 
 
 
656 aa  241  2.9999999999999997e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1405  sulfatase  32.22 
 
 
712 aa  239  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3537  sulfatase  29.77 
 
 
650 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2881  sulfatase  30.93 
 
 
712 aa  236  9e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42670  hypothetical protein  28.7 
 
 
700 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1447  sulfatase  29.65 
 
 
690 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.189062 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4881  sulfatase  32.56 
 
 
695 aa  226  7e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.652285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3581  hypothetical protein  28.68 
 
 
700 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.377432  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4108  sulfatase  28.14 
 
 
697 aa  223  9e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1838  hypothetical protein  29 
 
 
685 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.8565  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1416  sulfatase  28.36 
 
 
685 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.934087  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3872  sulfatase  29.38 
 
 
685 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292904  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1118  sulfatase  30.93 
 
 
628 aa  214  4.9999999999999996e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0140  hypothetical protein  30.21 
 
 
633 aa  207  4e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.597793  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25880  Sulfatase protein  30.07 
 
 
717 aa  207  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2056  hypothetical protein  28.25 
 
 
695 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.814835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1865  sulfatase  28.37 
 
 
695 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119974  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0445  sulfatase  28.01 
 
 
611 aa  191  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2021  hypothetical protein  27.84 
 
 
643 aa  178  3e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.112326 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2974  hypothetical protein  31.52 
 
 
550 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2548  sulfatase  28.54 
 
 
621 aa  165  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1736  sulfatase  26.1 
 
 
597 aa  164  7e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_002950  PG1564  hypothetical protein  28.94 
 
 
651 aa  151  3e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2377  sulfatase  27.66 
 
 
643 aa  141  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1848  sulfatase  25.74 
 
 
645 aa  131  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1899  sulfatase family protein  26.62 
 
 
677 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0309  sulfatase  32.01 
 
 
630 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3506  sulfatase  29.13 
 
 
677 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.633638  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1069  sulfatase  27.99 
 
 
641 aa  117  7.999999999999999e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0377  sulfatase  25.6 
 
 
671 aa  115  3e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000264889  hitchhiker  0.0000000000000148489 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3271  sulfatase  24.8 
 
 
642 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.269035 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1996  sulphatase  25.69 
 
 
628 aa  105  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.745737 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1353  sulfatase  23.5 
 
 
639 aa  103  7e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3855  sulfatase  22.99 
 
 
666 aa  98.2  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.593214  normal  0.690048 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0174  sulfatase  23.82 
 
 
630 aa  89.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.326693  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0121  hypothetical protein  23.14 
 
 
521 aa  84.7  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3757  phosphoglycerol transferase I  25.94 
 
 
701 aa  84.3  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0854  sulfatase  21.41 
 
 
672 aa  84  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1100  sulfatase  25.48 
 
 
609 aa  84  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109677  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1557  putative phosphoglycerol transferase I (phosphatidylglycerol--membrane-oligosaccharide glycerophosphotransferase)  25.72 
 
 
432 aa  81.3  0.00000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3797  sulfatase  22.32 
 
 
639 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000542687  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0584  sulfatase family protein  25.75 
 
 
602 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1434  sulfatase  22.49 
 
 
639 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.511966  normal  0.0230537 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0570  sulfatase family protein  25.67 
 
 
602 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1576  sulfatase  21.29 
 
 
628 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3535  sulfatase  22.84 
 
 
639 aa  79  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.009662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3864  sulfatase  22.19 
 
 
639 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00973329  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3804  sulfatase  21.71 
 
 
639 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00040285  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1300  sulfatase; phosphoglycerol transferase  22.33 
 
 
628 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3517  sulfatase  21.29 
 
 
639 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1538  sulfatase  21.07 
 
 
628 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1131  sulfatase  25.07 
 
 
593 aa  77.8  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1327  sulfatase  22.4 
 
 
628 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3608  sulfatase  21.45 
 
 
639 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1301  sulfatase; phosphoglycerol transferase  22.4 
 
 
628 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1508  sulfatase  22.4 
 
 
628 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221211 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1436  sulfatase  22.4 
 
 
628 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.567309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3895  sulfatase  21.45 
 
 
639 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60461  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3776  sulfatase  21.45 
 
 
639 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000208589 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0665  putative sulfatase family protein  25.6 
 
 
453 aa  77  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.144816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3505  sulfatase  21.88 
 
 
639 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000809194  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0062  sulfatase  26.43 
 
 
629 aa  77  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000880147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>