231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1447 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_25880  Sulfatase protein  63.65 
 
 
717 aa  854    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1447  sulfatase  100 
 
 
690 aa  1414    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.189062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1838  hypothetical protein  92.76 
 
 
685 aa  1325    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.8565  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2974  hypothetical protein  65.23 
 
 
550 aa  691    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3872  sulfatase  92.76 
 
 
685 aa  1324    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292904  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2056  hypothetical protein  72.97 
 
 
695 aa  1026    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.814835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1865  sulfatase  72.67 
 
 
695 aa  1022    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119974  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4108  sulfatase  73.99 
 
 
697 aa  1073    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1416  sulfatase  93.92 
 
 
685 aa  1332    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.934087  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42670  hypothetical protein  72.38 
 
 
700 aa  1024    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3581  hypothetical protein  72.53 
 
 
700 aa  1019    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.377432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0240  sulfatase  29.65 
 
 
678 aa  228  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3562  sulfatase  28.7 
 
 
682 aa  221  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0174  sulfatase  28.27 
 
 
670 aa  221  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3632  sulfatase  27.43 
 
 
662 aa  209  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1399  sulfatase  30.27 
 
 
670 aa  208  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003619  phosphoglycerol transferase I  28.8 
 
 
649 aa  208  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878946  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1915  sulfatase  28.33 
 
 
654 aa  207  6e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256965  normal  0.471265 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4129  sulfatase  26.05 
 
 
654 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3884  sulfatase  26.59 
 
 
654 aa  204  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3507  sulfatase  27.77 
 
 
646 aa  203  9e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4201  sulfatase  26.05 
 
 
654 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000207245  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3803  sulfatase  26.53 
 
 
654 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4628  sulfatase  26.04 
 
 
660 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4333  sulfatase  26.05 
 
 
654 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0138  sulfatase  25.89 
 
 
654 aa  200  6e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000529062  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1625  sulfatase  26.58 
 
 
635 aa  200  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413884  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0154  sulfatase  26.96 
 
 
656 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02464  phosphoglycerol transferase  26.29 
 
 
645 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3808  sulfatase  26.24 
 
 
654 aa  198  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5023  sulfatase  26.22 
 
 
646 aa  197  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0910313  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4881  sulfatase  30.24 
 
 
695 aa  195  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.652285 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3456  sulfatase  27.45 
 
 
657 aa  194  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383156  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4012  sulfatase  26.84 
 
 
654 aa  194  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0432  phosphoglycerol transferase  27.26 
 
 
653 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4499  sulfatase  26.93 
 
 
649 aa  191  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000368912 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0377  sulfatase  25.59 
 
 
671 aa  190  5.999999999999999e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000264889  hitchhiker  0.0000000000000148489 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3051  sulfatase  23.93 
 
 
652 aa  190  7e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.535064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3506  sulfatase  26.71 
 
 
677 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.633638  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2716  sulfatase domain-containing protein  28.03 
 
 
665 aa  184  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.324091  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1899  sulfatase family protein  26.41 
 
 
677 aa  185  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1979  sulfatase  27.56 
 
 
663 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3723  sulfatase  25.97 
 
 
633 aa  182  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3618  sulfatase  26.28 
 
 
633 aa  182  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2948  hypothetical protein  25.81 
 
 
633 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.146367  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0526  sulfatase  26.44 
 
 
633 aa  181  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3858  sulfatase  26.89 
 
 
647 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.499421  normal  0.910234 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1932  sulfatase  25.76 
 
 
666 aa  177  6e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0320  sulfatase  24.77 
 
 
640 aa  172  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2475  sulfatase  27.27 
 
 
652 aa  169  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0445  sulfatase  23.71 
 
 
611 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0319  sulfatase  24.37 
 
 
646 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4465  sulfatase  24.89 
 
 
656 aa  162  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1118  sulfatase  28.29 
 
 
628 aa  160  7e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3537  sulfatase  23.97 
 
 
650 aa  160  9e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2548  sulfatase  24.41 
 
 
621 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1405  sulfatase  28.21 
 
 
712 aa  158  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2881  sulfatase  25 
 
 
712 aa  157  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242387  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0080  sulfatase  23.89 
 
 
634 aa  153  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.204618  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1753  sulfatase  24.68 
 
 
696 aa  153  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.100359  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0140  hypothetical protein  27.01 
 
 
633 aa  151  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.597793  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_002950  PG1564  hypothetical protein  23.51 
 
 
651 aa  143  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3855  sulfatase  23.96 
 
 
666 aa  141  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.593214  normal  0.690048 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1848  sulfatase  24.46 
 
 
645 aa  135  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2377  sulfatase  24.38 
 
 
643 aa  134  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1996  sulphatase  23.48 
 
 
628 aa  127  8.000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.745737 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1736  sulfatase  25.91 
 
 
597 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3271  sulfatase  21.65 
 
 
642 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.269035 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1353  sulfatase  22.11 
 
 
639 aa  119  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0174  sulfatase  28.49 
 
 
630 aa  118  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.326693  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0309  sulfatase  26.34 
 
 
630 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2021  hypothetical protein  24.42 
 
 
643 aa  117  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.112326 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1069  sulfatase  24.38 
 
 
641 aa  108  4e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0043  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  25.93 
 
 
732 aa  103  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0187  membrane protein  22.62 
 
 
659 aa  101  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0462581  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0157  membrane associated sulfatase  22.62 
 
 
659 aa  101  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149975  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5081  sulfatase  24.54 
 
 
642 aa  100  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140992  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4913  sulfatase  24.54 
 
 
642 aa  99.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000919892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4928  sulfatase  24.54 
 
 
642 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5470  sulfatase  24.54 
 
 
642 aa  100  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000729601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5024  sulfatase  24.85 
 
 
642 aa  100  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00083521  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1434  sulfatase  25.78 
 
 
639 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.511966  normal  0.0230537 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5321  sulfatase  24.54 
 
 
642 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.10214e-55 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3505  sulfatase  25.78 
 
 
639 aa  99.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000809194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1327  sulfatase  25.83 
 
 
628 aa  99  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3804  sulfatase  25.47 
 
 
639 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00040285  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3608  sulfatase  25.78 
 
 
639 aa  99  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1300  sulfatase; phosphoglycerol transferase  25.83 
 
 
628 aa  98.6  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1301  sulfatase; phosphoglycerol transferase  25.83 
 
 
628 aa  99  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1436  sulfatase  25.83 
 
 
628 aa  99  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.567309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3895  sulfatase  25.78 
 
 
639 aa  99  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60461  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1508  sulfatase  25.83 
 
 
628 aa  99  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221211 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3776  sulfatase  25.78 
 
 
639 aa  99  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000208589 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0182  sulfatase  24.17 
 
 
653 aa  99  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1576  sulfatase  25.83 
 
 
628 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3797  sulfatase  25.47 
 
 
639 aa  97.8  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000542687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1538  sulfatase  25.66 
 
 
628 aa  97.8  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3535  sulfatase  25.47 
 
 
639 aa  97.8  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.009662  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3517  sulfatase  25.47 
 
 
639 aa  97.4  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1028  sulfatase  28.49 
 
 
640 aa  97.1  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0869325  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>