227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2548 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2548  sulfatase  100 
 
 
621 aa  1278    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0445  sulfatase  35.14 
 
 
611 aa  403  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2021  hypothetical protein  31.36 
 
 
643 aa  291  3e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.112326 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1736  sulfatase  30.54 
 
 
597 aa  281  3e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003619  phosphoglycerol transferase I  25.86 
 
 
649 aa  189  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878946  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02464  phosphoglycerol transferase  27.99 
 
 
645 aa  189  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2716  sulfatase domain-containing protein  28.55 
 
 
665 aa  185  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.324091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4499  sulfatase  28.18 
 
 
649 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000368912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4881  sulfatase  27.63 
 
 
695 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.652285 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3456  sulfatase  30.44 
 
 
657 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383156  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0432  phosphoglycerol transferase  29.95 
 
 
653 aa  179  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5023  sulfatase  26.49 
 
 
646 aa  178  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0910313  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3858  sulfatase  31.57 
 
 
647 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.499421  normal  0.910234 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1865  sulfatase  24.96 
 
 
695 aa  176  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119974  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3581  hypothetical protein  24.45 
 
 
700 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.377432  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2056  hypothetical protein  25.25 
 
 
695 aa  174  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.814835  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0154  sulfatase  27.12 
 
 
656 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2948  hypothetical protein  27.57 
 
 
633 aa  173  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.146367  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0174  sulfatase  26.92 
 
 
670 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42670  hypothetical protein  23.86 
 
 
700 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1625  sulfatase  26.55 
 
 
635 aa  172  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413884  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3632  sulfatase  27.97 
 
 
662 aa  171  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3872  sulfatase  24.1 
 
 
685 aa  170  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292904  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3562  sulfatase  28.63 
 
 
682 aa  169  9e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2881  sulfatase  31.75 
 
 
712 aa  169  9e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242387  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1838  hypothetical protein  23.53 
 
 
685 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.8565  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4108  sulfatase  23.86 
 
 
697 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2475  sulfatase  34.06 
 
 
652 aa  169  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84195 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3723  sulfatase  26.55 
 
 
633 aa  169  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1932  sulfatase  27.24 
 
 
666 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1416  sulfatase  23.76 
 
 
685 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.934087  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1979  sulfatase  25.42 
 
 
663 aa  167  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1564  hypothetical protein  28.11 
 
 
651 aa  167  8e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1447  sulfatase  24.38 
 
 
690 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.189062 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3618  sulfatase  26.36 
 
 
633 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25880  Sulfatase protein  24.52 
 
 
717 aa  165  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0526  sulfatase  26.32 
 
 
633 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0240  sulfatase  27 
 
 
678 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1915  sulfatase  27.95 
 
 
654 aa  164  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256965  normal  0.471265 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3051  sulfatase  25.24 
 
 
652 aa  164  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.535064  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0138  sulfatase  25.62 
 
 
654 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000529062  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3507  sulfatase  27.17 
 
 
646 aa  164  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0319  sulfatase  29.33 
 
 
646 aa  163  8.000000000000001e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4129  sulfatase  25.62 
 
 
654 aa  163  9e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3884  sulfatase  26.89 
 
 
654 aa  163  9e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4628  sulfatase  27.74 
 
 
660 aa  163  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4333  sulfatase  27.19 
 
 
654 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4201  sulfatase  26.97 
 
 
654 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000207245  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0320  sulfatase  27.02 
 
 
640 aa  162  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3808  sulfatase  26.89 
 
 
654 aa  160  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2974  hypothetical protein  25.2 
 
 
550 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4465  sulfatase  27.54 
 
 
656 aa  157  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3803  sulfatase  28.22 
 
 
654 aa  155  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1399  sulfatase  26.75 
 
 
670 aa  151  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0140  hypothetical protein  24.66 
 
 
633 aa  150  6e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.597793  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4012  sulfatase  26.42 
 
 
654 aa  150  9e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1753  sulfatase  26.53 
 
 
696 aa  144  3e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.100359  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1118  sulfatase  26.46 
 
 
628 aa  144  4e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1405  sulfatase  29.75 
 
 
712 aa  143  7e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3537  sulfatase  25.38 
 
 
650 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0080  sulfatase  24.01 
 
 
634 aa  136  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.204618  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1996  sulphatase  25.86 
 
 
628 aa  136  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.745737 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0377  sulfatase  23.23 
 
 
671 aa  135  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000264889  hitchhiker  0.0000000000000148489 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3855  sulfatase  26.71 
 
 
666 aa  127  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.593214  normal  0.690048 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2377  sulfatase  23.99 
 
 
643 aa  123  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1353  sulfatase  23.54 
 
 
639 aa  114  6e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3271  sulfatase  24.81 
 
 
642 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.269035 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1069  sulfatase  26.05 
 
 
641 aa  99.8  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0309  sulfatase  25.8 
 
 
630 aa  94.4  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1899  sulfatase family protein  23.96 
 
 
677 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0165  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  25.92 
 
 
727 aa  87.4  7e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0854  sulfatase  25.99 
 
 
672 aa  86.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2207  sulfatase  26.67 
 
 
627 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3207  sulfatase  22.08 
 
 
595 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.803481  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0371  sulfatase  24.04 
 
 
625 aa  82  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000394083  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2501  sulfatase  26.03 
 
 
629 aa  82  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1538  sulfatase  24.29 
 
 
628 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1300  sulfatase; phosphoglycerol transferase  24.29 
 
 
628 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1576  sulfatase  24.29 
 
 
628 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1327  sulfatase  24.29 
 
 
628 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1301  sulfatase; phosphoglycerol transferase  24.29 
 
 
628 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1508  sulfatase  24.29 
 
 
628 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221211 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3506  sulfatase  24.17 
 
 
677 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.633638  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1436  sulfatase  24.29 
 
 
628 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.567309  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3874  sulfatase  24.29 
 
 
628 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.295207 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1470  sulfatase  24.29 
 
 
628 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0043  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  22.01 
 
 
732 aa  79.3  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0391  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  23.68 
 
 
691 aa  79.3  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1340  sulfatase  23.97 
 
 
628 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.5616  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4913  sulfatase  22.15 
 
 
642 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000919892  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5081  sulfatase  22.15 
 
 
642 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140992  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5321  sulfatase  22.15 
 
 
642 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.10214e-55 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5470  sulfatase  22.15 
 
 
642 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000729601  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4928  sulfatase  22.15 
 
 
642 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5024  sulfatase  22.15 
 
 
642 aa  77  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00083521  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1139  sulfatase  24.34 
 
 
628 aa  77  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5353  sulfatase  22.15 
 
 
642 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171789  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0864  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  27.8 
 
 
722 aa  76.6  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5606  sulfatase  22.15 
 
 
642 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000063545  unclonable  7.68096e-25 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0662  sulfatase  21.11 
 
 
630 aa  75.5  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>