270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3507 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4333  sulfatase  74.65 
 
 
654 aa  993    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0174  sulfatase  73.11 
 
 
670 aa  1001    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02464  phosphoglycerol transferase  52.49 
 
 
645 aa  713    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4628  sulfatase  75.12 
 
 
660 aa  1014    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0432  phosphoglycerol transferase  52.6 
 
 
653 aa  681    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3456  sulfatase  55.75 
 
 
657 aa  713    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383156  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003619  phosphoglycerol transferase I  54.08 
 
 
649 aa  722    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878946  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3562  sulfatase  67.65 
 
 
682 aa  922    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4129  sulfatase  74.49 
 
 
654 aa  989    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0138  sulfatase  74.33 
 
 
654 aa  992    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000529062  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3808  sulfatase  73.76 
 
 
654 aa  1009    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3884  sulfatase  74.07 
 
 
654 aa  1009    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0240  sulfatase  67.6 
 
 
678 aa  944    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3632  sulfatase  71.47 
 
 
662 aa  970    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4201  sulfatase  74.65 
 
 
654 aa  993    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000207245  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0154  sulfatase  70.65 
 
 
656 aa  972    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1915  sulfatase  52.79 
 
 
654 aa  672    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256965  normal  0.471265 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3803  sulfatase  73.58 
 
 
654 aa  980    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4012  sulfatase  74.07 
 
 
654 aa  990    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3507  sulfatase  100 
 
 
646 aa  1317    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2716  sulfatase domain-containing protein  49.3 
 
 
665 aa  633  1e-180  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.324091  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1399  sulfatase  48.1 
 
 
670 aa  586  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1979  sulfatase  50 
 
 
663 aa  556  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5023  sulfatase  41.67 
 
 
646 aa  485  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0910313  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0319  sulfatase  37 
 
 
646 aa  389  1e-107  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0080  sulfatase  36.69 
 
 
634 aa  387  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.204618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3723  sulfatase  31.37 
 
 
633 aa  281  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3618  sulfatase  30.75 
 
 
633 aa  272  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4499  sulfatase  33.33 
 
 
649 aa  271  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000368912 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1625  sulfatase  31.1 
 
 
635 aa  270  8e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413884  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3858  sulfatase  34.16 
 
 
647 aa  267  5e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.499421  normal  0.910234 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2948  hypothetical protein  29.5 
 
 
633 aa  266  7e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.146367  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0526  sulfatase  30.07 
 
 
633 aa  266  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2475  sulfatase  35.25 
 
 
652 aa  260  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84195 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1932  sulfatase  30.68 
 
 
666 aa  254  3e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0320  sulfatase  31.38 
 
 
640 aa  253  1e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1405  sulfatase  33.74 
 
 
712 aa  252  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3051  sulfatase  28.75 
 
 
652 aa  251  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.535064  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1753  sulfatase  30.5 
 
 
696 aa  247  6e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.100359  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3537  sulfatase  29.84 
 
 
650 aa  241  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2881  sulfatase  29.95 
 
 
712 aa  240  5e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4881  sulfatase  29.98 
 
 
695 aa  238  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.652285 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1118  sulfatase  30.27 
 
 
628 aa  232  1e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4465  sulfatase  31.29 
 
 
656 aa  225  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42670  hypothetical protein  27.99 
 
 
700 aa  219  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0140  hypothetical protein  29.95 
 
 
633 aa  216  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.597793  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4108  sulfatase  27.69 
 
 
697 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25880  Sulfatase protein  31.03 
 
 
717 aa  212  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3581  hypothetical protein  27.69 
 
 
700 aa  211  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.377432  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3872  sulfatase  28.05 
 
 
685 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292904  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1838  hypothetical protein  27.27 
 
 
685 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.8565  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1416  sulfatase  27.72 
 
 
685 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.934087  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1447  sulfatase  27.77 
 
 
690 aa  203  8e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.189062 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1865  sulfatase  28.35 
 
 
695 aa  195  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119974  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2056  hypothetical protein  29.37 
 
 
695 aa  190  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.814835  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0445  sulfatase  29.82 
 
 
611 aa  188  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2548  sulfatase  27.17 
 
 
621 aa  164  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2021  hypothetical protein  26.21 
 
 
643 aa  163  8.000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.112326 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1736  sulfatase  27.32 
 
 
597 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2974  hypothetical protein  28.51 
 
 
550 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_002950  PG1564  hypothetical protein  26.38 
 
 
651 aa  133  7.999999999999999e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1899  sulfatase family protein  24.61 
 
 
677 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1848  sulfatase  23.61 
 
 
645 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2377  sulfatase  24.55 
 
 
643 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3506  sulfatase  25.39 
 
 
677 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.633638  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1069  sulfatase  29.49 
 
 
641 aa  109  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1353  sulfatase  25.2 
 
 
639 aa  108  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0377  sulfatase  24.24 
 
 
671 aa  105  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000264889  hitchhiker  0.0000000000000148489 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0309  sulfatase  28.33 
 
 
630 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3855  sulfatase  23.79 
 
 
666 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.593214  normal  0.690048 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3271  sulfatase  23 
 
 
642 aa  99  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.269035 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0174  sulfatase  24.22 
 
 
630 aa  93.6  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.326693  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1996  sulphatase  23.27 
 
 
628 aa  91.7  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.745737 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1100  sulfatase  24.69 
 
 
609 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109677  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5353  sulfatase  25 
 
 
642 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171789  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0062  sulfatase  26.35 
 
 
629 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000880147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5606  sulfatase  24.68 
 
 
642 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000063545  unclonable  7.68096e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5404  sulfatase  24.68 
 
 
642 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000849395  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5348  sulfatase  24.68 
 
 
642 aa  84  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000124675  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5024  sulfatase  24.68 
 
 
642 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00083521  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3535  sulfatase  25.9 
 
 
639 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.009662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3797  sulfatase  24.02 
 
 
639 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000542687  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1434  sulfatase  25.9 
 
 
639 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.511966  normal  0.0230537 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3864  sulfatase  23.39 
 
 
639 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00973329  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1340  sulfatase  23.46 
 
 
628 aa  82  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.5616  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3505  sulfatase  23.56 
 
 
639 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000809194  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0999  sulfatase  25.24 
 
 
593 aa  81.6  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.477664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3804  sulfatase  25.17 
 
 
639 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00040285  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1538  sulfatase  23.25 
 
 
628 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3776  sulfatase  25.25 
 
 
639 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000208589 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1131  sulfatase  25.24 
 
 
593 aa  81.3  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3766  sulfatase  24.83 
 
 
642 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000560432  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3608  sulfatase  25.25 
 
 
639 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3895  sulfatase  25.25 
 
 
639 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0371  sulfatase  23.99 
 
 
625 aa  80.5  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000394083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5321  sulfatase  23.73 
 
 
642 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.10214e-55 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4913  sulfatase  23.73 
 
 
642 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000919892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4928  sulfatase  23.73 
 
 
642 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1508  sulfatase  22.97 
 
 
628 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221211 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1301  sulfatase; phosphoglycerol transferase  22.97 
 
 
628 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>