More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3506 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1899  sulfatase family protein  93.06 
 
 
677 aa  1304    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3506  sulfatase  100 
 
 
677 aa  1379    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.633638  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1848  sulfatase  34.88 
 
 
645 aa  412  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0377  sulfatase  34.32 
 
 
671 aa  412  1e-113  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000264889  hitchhiker  0.0000000000000148489 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1447  sulfatase  26.71 
 
 
690 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.189062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1838  hypothetical protein  26.38 
 
 
685 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.8565  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1416  sulfatase  26.63 
 
 
685 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.934087  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3872  sulfatase  26.01 
 
 
685 aa  185  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292904  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42670  hypothetical protein  27.67 
 
 
700 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1865  sulfatase  26.68 
 
 
695 aa  179  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119974  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3581  hypothetical protein  26.76 
 
 
700 aa  177  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.377432  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2056  hypothetical protein  26.49 
 
 
695 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.814835  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4108  sulfatase  26.6 
 
 
697 aa  170  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25880  Sulfatase protein  28.65 
 
 
717 aa  167  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2974  hypothetical protein  28.94 
 
 
550 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4499  sulfatase  27.66 
 
 
649 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000368912 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2948  hypothetical protein  25.31 
 
 
633 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.146367  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3723  sulfatase  26.09 
 
 
633 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0526  sulfatase  24.64 
 
 
633 aa  146  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3618  sulfatase  26.09 
 
 
633 aa  146  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3858  sulfatase  25.04 
 
 
647 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.499421  normal  0.910234 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003619  phosphoglycerol transferase I  27.01 
 
 
649 aa  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878946  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4465  sulfatase  26.57 
 
 
656 aa  142  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02464  phosphoglycerol transferase  25.86 
 
 
645 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1625  sulfatase  23.61 
 
 
635 aa  137  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413884  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1932  sulfatase  26.27 
 
 
666 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4628  sulfatase  25.84 
 
 
660 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4129  sulfatase  26.14 
 
 
654 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3884  sulfatase  25.8 
 
 
654 aa  130  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4333  sulfatase  26.33 
 
 
654 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1915  sulfatase  23.99 
 
 
654 aa  130  8.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256965  normal  0.471265 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5023  sulfatase  24.52 
 
 
646 aa  130  8.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0910313  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4201  sulfatase  26.37 
 
 
654 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000207245  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0138  sulfatase  26.14 
 
 
654 aa  127  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000529062  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3808  sulfatase  25.68 
 
 
654 aa  126  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0320  sulfatase  28.4 
 
 
640 aa  125  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3632  sulfatase  26.06 
 
 
662 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2881  sulfatase  23.77 
 
 
712 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242387  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3456  sulfatase  27.39 
 
 
657 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383156  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0154  sulfatase  28.17 
 
 
656 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1753  sulfatase  24.02 
 
 
696 aa  121  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.100359  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3507  sulfatase  25.39 
 
 
646 aa  120  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2475  sulfatase  22.79 
 
 
652 aa  120  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84195 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3803  sulfatase  28.12 
 
 
654 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0240  sulfatase  29.13 
 
 
678 aa  120  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4881  sulfatase  27.22 
 
 
695 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.652285 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2716  sulfatase domain-containing protein  24.01 
 
 
665 aa  114  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.324091  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3562  sulfatase  25 
 
 
682 aa  114  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3051  sulfatase  23.81 
 
 
652 aa  113  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.535064  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0174  sulfatase  26.75 
 
 
670 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4012  sulfatase  26.5 
 
 
654 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3537  sulfatase  23.11 
 
 
650 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3608  sulfatase  28.41 
 
 
639 aa  112  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3505  sulfatase  28.41 
 
 
639 aa  112  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000809194  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3895  sulfatase  28.41 
 
 
639 aa  112  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60461  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3776  sulfatase  28.41 
 
 
639 aa  112  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000208589 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3797  sulfatase  28.78 
 
 
639 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000542687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3517  sulfatase  28.33 
 
 
639 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0432  phosphoglycerol transferase  27.41 
 
 
653 aa  111  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3535  sulfatase  28.01 
 
 
639 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.009662  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3804  sulfatase  28.7 
 
 
639 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00040285  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3864  sulfatase  28.33 
 
 
639 aa  111  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00973329  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1405  sulfatase  24.55 
 
 
712 aa  108  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1434  sulfatase  28.12 
 
 
639 aa  107  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.511966  normal  0.0230537 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5081  sulfatase  28.01 
 
 
642 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140992  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5470  sulfatase  28.01 
 
 
642 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000729601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5024  sulfatase  28.01 
 
 
642 aa  106  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00083521  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4913  sulfatase  28.01 
 
 
642 aa  106  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000919892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4928  sulfatase  28.01 
 
 
642 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5321  sulfatase  28.01 
 
 
642 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.10214e-55 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5353  sulfatase  27.73 
 
 
642 aa  105  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171789  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5606  sulfatase  27.75 
 
 
642 aa  105  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000063545  unclonable  7.68096e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5404  sulfatase  27.73 
 
 
642 aa  104  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000849395  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5348  sulfatase  27.45 
 
 
642 aa  103  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000124675  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1399  sulfatase  26.9 
 
 
670 aa  103  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1118  sulfatase  24.04 
 
 
628 aa  103  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0140  hypothetical protein  25.87 
 
 
633 aa  102  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.597793  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3766  sulfatase  27.45 
 
 
642 aa  102  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000560432  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0319  sulfatase  24.94 
 
 
646 aa  102  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1979  sulfatase  26.81 
 
 
663 aa  101  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0080  sulfatase  24.18 
 
 
634 aa  97.8  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.204618  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0999  sulfatase  27.22 
 
 
593 aa  97.8  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.477664  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1066  sulfatase  23.22 
 
 
651 aa  97.4  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1131  sulfatase  27.22 
 
 
593 aa  97.1  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0174  sulfatase  25.26 
 
 
630 aa  94.7  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.326693  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1996  sulphatase  24.44 
 
 
628 aa  93.6  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.745737 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1100  sulfatase  26.22 
 
 
609 aa  92  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109677  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2021  hypothetical protein  25.11 
 
 
643 aa  89  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.112326 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0062  sulfatase  25.59 
 
 
629 aa  88.6  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000880147  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0182  sulfatase  26.82 
 
 
653 aa  84  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1586  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  28.35 
 
 
689 aa  83.2  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0888013  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0369  sulfatase  26.72 
 
 
628 aa  82.8  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151431  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2740  sulfatase  27.22 
 
 
657 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000010539  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0854  sulfatase  25.71 
 
 
672 aa  80.9  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1327  sulfatase  23.78 
 
 
628 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1508  sulfatase  23.78 
 
 
628 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221211 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1576  sulfatase  23.78 
 
 
628 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1436  sulfatase  23.78 
 
 
628 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.567309  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0242  sulfatase  23.96 
 
 
666 aa  80.5  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1300  sulfatase; phosphoglycerol transferase  23.78 
 
 
628 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>