255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4628 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3456  sulfatase  54.83 
 
 
657 aa  715    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383156  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4129  sulfatase  92.63 
 
 
654 aa  1214    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4201  sulfatase  92.63 
 
 
654 aa  1216    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000207245  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2716  sulfatase domain-containing protein  51.57 
 
 
665 aa  661    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.324091  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4628  sulfatase  100 
 
 
660 aa  1343    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0154  sulfatase  75.35 
 
 
656 aa  1011    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4333  sulfatase  92.93 
 
 
654 aa  1221    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3562  sulfatase  71.12 
 
 
682 aa  971    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0174  sulfatase  74.77 
 
 
670 aa  1032    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1915  sulfatase  54.32 
 
 
654 aa  692    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256965  normal  0.471265 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3803  sulfatase  87.86 
 
 
654 aa  1170    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02464  phosphoglycerol transferase  54.59 
 
 
645 aa  738    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003619  phosphoglycerol transferase I  55.21 
 
 
649 aa  745    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878946  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3808  sulfatase  94.34 
 
 
654 aa  1274    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3884  sulfatase  93.43 
 
 
654 aa  1267    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0240  sulfatase  72.85 
 
 
678 aa  1011    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0432  phosphoglycerol transferase  55.14 
 
 
653 aa  716    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4012  sulfatase  93.12 
 
 
654 aa  1240    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3507  sulfatase  75.12 
 
 
646 aa  1014    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0138  sulfatase  92.47 
 
 
654 aa  1215    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000529062  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3632  sulfatase  73.1 
 
 
662 aa  1002    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1399  sulfatase  48.25 
 
 
670 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1979  sulfatase  46.86 
 
 
663 aa  570  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5023  sulfatase  42.92 
 
 
646 aa  483  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0910313  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0319  sulfatase  39.35 
 
 
646 aa  411  1e-113  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0080  sulfatase  40.54 
 
 
634 aa  402  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.204618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3723  sulfatase  32.88 
 
 
633 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3618  sulfatase  33.23 
 
 
633 aa  301  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0526  sulfatase  32.16 
 
 
633 aa  295  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2948  hypothetical protein  31.99 
 
 
633 aa  292  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.146367  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3858  sulfatase  33.57 
 
 
647 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.499421  normal  0.910234 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4499  sulfatase  32.7 
 
 
649 aa  286  8e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000368912 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2475  sulfatase  32.12 
 
 
652 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84195 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1625  sulfatase  31.4 
 
 
635 aa  268  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413884  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0320  sulfatase  29.17 
 
 
640 aa  266  7e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1405  sulfatase  33.39 
 
 
712 aa  261  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1932  sulfatase  31.11 
 
 
666 aa  261  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1753  sulfatase  30.99 
 
 
696 aa  257  5e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.100359  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3051  sulfatase  28.29 
 
 
652 aa  251  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.535064  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4465  sulfatase  30.99 
 
 
656 aa  246  8e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2881  sulfatase  29.49 
 
 
712 aa  244  5e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4881  sulfatase  28.4 
 
 
695 aa  232  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.652285 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3537  sulfatase  28.59 
 
 
650 aa  231  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1118  sulfatase  30.53 
 
 
628 aa  229  9e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42670  hypothetical protein  28.77 
 
 
700 aa  224  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0140  hypothetical protein  28.42 
 
 
633 aa  219  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.597793  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3581  hypothetical protein  28.51 
 
 
700 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.377432  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4108  sulfatase  26.52 
 
 
697 aa  212  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25880  Sulfatase protein  29.66 
 
 
717 aa  209  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1447  sulfatase  26.04 
 
 
690 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.189062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3872  sulfatase  27.76 
 
 
685 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292904  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1838  hypothetical protein  27.94 
 
 
685 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.8565  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1416  sulfatase  28.06 
 
 
685 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.934087  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1865  sulfatase  28.25 
 
 
695 aa  197  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119974  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2056  hypothetical protein  28.25 
 
 
695 aa  196  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.814835  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0445  sulfatase  27.15 
 
 
611 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2021  hypothetical protein  27.16 
 
 
643 aa  169  2e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.112326 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2974  hypothetical protein  28.6 
 
 
550 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2548  sulfatase  27.74 
 
 
621 aa  163  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1736  sulfatase  28.16 
 
 
597 aa  160  9e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3506  sulfatase  25.85 
 
 
677 aa  134  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.633638  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2377  sulfatase  25.78 
 
 
643 aa  133  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1564  hypothetical protein  25.98 
 
 
651 aa  130  6e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1899  sulfatase family protein  25.77 
 
 
677 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1848  sulfatase  24.82 
 
 
645 aa  124  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0309  sulfatase  30.16 
 
 
630 aa  117  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1069  sulfatase  28.66 
 
 
641 aa  112  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3271  sulfatase  24.09 
 
 
642 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.269035 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1353  sulfatase  25.05 
 
 
639 aa  105  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3855  sulfatase  23.77 
 
 
666 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.593214  normal  0.690048 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1996  sulphatase  23.7 
 
 
628 aa  95.5  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.745737 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0377  sulfatase  26.84 
 
 
671 aa  94.4  6e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000264889  hitchhiker  0.0000000000000148489 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0062  sulfatase  25.85 
 
 
629 aa  91.3  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000880147  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1538  sulfatase  23.25 
 
 
628 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0371  sulfatase  25.72 
 
 
625 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000394083  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0174  sulfatase  23.56 
 
 
630 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.326693  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3535  sulfatase  23.69 
 
 
639 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.009662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1434  sulfatase  23.14 
 
 
639 aa  84  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.511966  normal  0.0230537 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3505  sulfatase  22.87 
 
 
639 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000809194  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1576  sulfatase  22.63 
 
 
628 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3804  sulfatase  22.87 
 
 
639 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00040285  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3797  sulfatase  23.4 
 
 
639 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000542687  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3864  sulfatase  22.87 
 
 
639 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00973329  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3608  sulfatase  23.1 
 
 
639 aa  82  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3895  sulfatase  23.1 
 
 
639 aa  82  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60461  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3776  sulfatase  23.1 
 
 
639 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000208589 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3517  sulfatase  23.1 
 
 
639 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3211  sulfatase  24.92 
 
 
612 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139741  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0584  sulfatase family protein  25.22 
 
 
602 aa  81.3  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1300  sulfatase; phosphoglycerol transferase  22.35 
 
 
628 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0570  sulfatase family protein  25.22 
 
 
602 aa  80.9  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1327  sulfatase  22.41 
 
 
628 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3757  phosphoglycerol transferase I  25.74 
 
 
701 aa  79.7  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1301  sulfatase; phosphoglycerol transferase  22.41 
 
 
628 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1436  sulfatase  22.41 
 
 
628 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.567309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1508  sulfatase  22.41 
 
 
628 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221211 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5024  sulfatase  22.83 
 
 
642 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00083521  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5348  sulfatase  22.85 
 
 
642 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000124675  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5404  sulfatase  22.83 
 
 
642 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000849395  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5353  sulfatase  22.85 
 
 
642 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>