283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3723 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2948  hypothetical protein  63.02 
 
 
633 aa  828    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.146367  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3618  sulfatase  94.79 
 
 
633 aa  1243    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0526  sulfatase  63.67 
 
 
633 aa  830    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1625  sulfatase  57.52 
 
 
635 aa  732    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413884  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3723  sulfatase  100 
 
 
633 aa  1298    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0320  sulfatase  45.2 
 
 
640 aa  568  1e-160  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4499  sulfatase  44.16 
 
 
649 aa  533  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000368912 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1932  sulfatase  45.22 
 
 
666 aa  533  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4881  sulfatase  45.91 
 
 
695 aa  523  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.652285 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1405  sulfatase  45.78 
 
 
712 aa  521  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2475  sulfatase  45.76 
 
 
652 aa  512  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84195 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3858  sulfatase  46.79 
 
 
647 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.499421  normal  0.910234 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1753  sulfatase  45.44 
 
 
696 aa  508  1e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.100359  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3051  sulfatase  41.73 
 
 
652 aa  502  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.535064  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2881  sulfatase  42.21 
 
 
712 aa  493  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242387  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1118  sulfatase  43.27 
 
 
628 aa  471  1.0000000000000001e-131  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4465  sulfatase  40.55 
 
 
656 aa  463  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3537  sulfatase  38.07 
 
 
650 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0140  hypothetical protein  42.15 
 
 
633 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.597793  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3808  sulfatase  33.13 
 
 
654 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4628  sulfatase  32.88 
 
 
660 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3884  sulfatase  32.83 
 
 
654 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003619  phosphoglycerol transferase I  32.63 
 
 
649 aa  303  6.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878946  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0174  sulfatase  32.95 
 
 
670 aa  301  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3632  sulfatase  34.76 
 
 
662 aa  291  3e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4333  sulfatase  34.27 
 
 
654 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4012  sulfatase  32.83 
 
 
654 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4129  sulfatase  33.89 
 
 
654 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0138  sulfatase  33.16 
 
 
654 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000529062  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4201  sulfatase  34.08 
 
 
654 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000207245  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3562  sulfatase  30.32 
 
 
682 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3803  sulfatase  33.68 
 
 
654 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0154  sulfatase  31.24 
 
 
656 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1915  sulfatase  30.54 
 
 
654 aa  283  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256965  normal  0.471265 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02464  phosphoglycerol transferase  31.48 
 
 
645 aa  282  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3507  sulfatase  31.37 
 
 
646 aa  281  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5023  sulfatase  32.79 
 
 
646 aa  279  9e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0910313  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1399  sulfatase  32.47 
 
 
670 aa  277  4e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0240  sulfatase  34.1 
 
 
678 aa  276  6e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1979  sulfatase  31.67 
 
 
663 aa  270  5e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3456  sulfatase  31.41 
 
 
657 aa  266  8e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383156  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0432  phosphoglycerol transferase  32.94 
 
 
653 aa  263  6e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0319  sulfatase  28.89 
 
 
646 aa  241  2e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2716  sulfatase domain-containing protein  30.59 
 
 
665 aa  239  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.324091  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0080  sulfatase  30.4 
 
 
634 aa  218  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.204618  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25880  Sulfatase protein  28.35 
 
 
717 aa  200  6e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4108  sulfatase  27.81 
 
 
697 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42670  hypothetical protein  26.09 
 
 
700 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1416  sulfatase  26.83 
 
 
685 aa  186  9e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.934087  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3872  sulfatase  26.38 
 
 
685 aa  183  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292904  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1447  sulfatase  25.97 
 
 
690 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.189062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1838  hypothetical protein  26.02 
 
 
685 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.8565  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1865  sulfatase  27.03 
 
 
695 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119974  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2056  hypothetical protein  27.36 
 
 
695 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.814835  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3581  hypothetical protein  30.38 
 
 
700 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.377432  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2974  hypothetical protein  28.66 
 
 
550 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2548  sulfatase  28.4 
 
 
621 aa  163  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0445  sulfatase  25.35 
 
 
611 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1899  sulfatase family protein  25.39 
 
 
677 aa  152  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3506  sulfatase  26.09 
 
 
677 aa  145  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.633638  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0377  sulfatase  25.13 
 
 
671 aa  143  8e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000264889  hitchhiker  0.0000000000000148489 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1736  sulfatase  29.05 
 
 
597 aa  142  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_002950  PG1564  hypothetical protein  26.1 
 
 
651 aa  131  4.0000000000000003e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2377  sulfatase  27.25 
 
 
643 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2021  hypothetical protein  23.68 
 
 
643 aa  125  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.112326 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1848  sulfatase  27.94 
 
 
645 aa  120  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3855  sulfatase  27.58 
 
 
666 aa  117  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.593214  normal  0.690048 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1069  sulfatase  27.22 
 
 
641 aa  117  8.999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1996  sulphatase  23.69 
 
 
628 aa  110  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.745737 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1353  sulfatase  26.91 
 
 
639 aa  103  8e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0309  sulfatase  24.37 
 
 
630 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0062  sulfatase  24.64 
 
 
629 aa  101  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000880147  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3271  sulfatase  26.73 
 
 
642 aa  99.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.269035 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0174  sulfatase  25.79 
 
 
630 aa  96.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.326693  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3766  sulfatase  24.76 
 
 
642 aa  92.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000560432  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3505  sulfatase  23.62 
 
 
639 aa  91.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000809194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3517  sulfatase  23.78 
 
 
639 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3804  sulfatase  23.55 
 
 
639 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00040285  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3776  sulfatase  23.78 
 
 
639 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000208589 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3608  sulfatase  23.78 
 
 
639 aa  91.3  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3895  sulfatase  23.78 
 
 
639 aa  91.3  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3535  sulfatase  23.55 
 
 
639 aa  90.5  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.009662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3797  sulfatase  23.55 
 
 
639 aa  90.5  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000542687  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1434  sulfatase  23.47 
 
 
639 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.511966  normal  0.0230537 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3864  sulfatase  23.23 
 
 
639 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00973329  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5353  sulfatase  23.96 
 
 
642 aa  88.2  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171789  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3211  sulfatase  27.65 
 
 
612 aa  87.8  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139741  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2207  sulfatase  25.88 
 
 
627 aa  87.8  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5606  sulfatase  23.96 
 
 
642 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000063545  unclonable  7.68096e-25 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2501  sulfatase  25.07 
 
 
629 aa  87.8  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5404  sulfatase  24.28 
 
 
642 aa  87  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000849395  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5348  sulfatase  23.96 
 
 
642 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000124675  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5024  sulfatase  23.4 
 
 
642 aa  87  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00083521  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1100  sulfatase  24.22 
 
 
609 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109677  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4913  sulfatase  22.95 
 
 
642 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000919892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5321  sulfatase  22.95 
 
 
642 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.10214e-55 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5081  sulfatase  22.95 
 
 
642 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140992  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5470  sulfatase  22.95 
 
 
642 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000729601  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4928  sulfatase  22.66 
 
 
642 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0371  sulfatase  26.03 
 
 
625 aa  84.3  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000394083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>