239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2056 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_25880  Sulfatase protein  63.66 
 
 		 717 aa  866    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1838  hypothetical protein  72.13 
 
 		 685 aa  1038    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.8565  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2974  hypothetical protein  62.27 
 
 		 550 aa  669    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1416  sulfatase  72.42 
 
 		 685 aa  1038    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.934087  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2056  hypothetical protein  100 
 
 		 695 aa  1431    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.814835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1865  sulfatase  96.69 
 
 		 695 aa  1364    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4108  sulfatase  77.59 
 
 		 697 aa  1122    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3872  sulfatase  72.28 
 
 		 685 aa  1040    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292904  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3581  hypothetical protein  72.98 
 
 		 700 aa  1015    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.377432  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1447  sulfatase  72.97 
 
 		 690 aa  1043    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.189062 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42670  hypothetical protein  73.09 
 
 		 700 aa  1021    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0240  sulfatase  28.26 
 
 		 678 aa  212  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3562  sulfatase  28.09 
 
 		 682 aa  209  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4628  sulfatase  28.25 
 
 		 660 aa  207  7e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5023  sulfatase  28.99 
 
 		 646 aa  206  8e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0910313  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0174  sulfatase  27.94 
 
 		 670 aa  206  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3884  sulfatase  27.9 
 
 		 654 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3456  sulfatase  28.06 
 
 		 657 aa  205  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3808  sulfatase  27.6 
 
 		 654 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4012  sulfatase  28.14 
 
 		 654 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3507  sulfatase  29.37 
 
 		 646 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4881  sulfatase  29.15 
 
 		 695 aa  196  9e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.652285 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1915  sulfatase  27.96 
 
 		 654 aa  196  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256965  normal  0.471265 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0432  phosphoglycerol transferase  28.39 
 
 		 653 aa  194  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3803  sulfatase  27.04 
 
 		 654 aa  194  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1399  sulfatase  28.14 
 
 		 670 aa  194  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4129  sulfatase  27.65 
 
 		 654 aa  194  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0154  sulfatase  27.16 
 
 		 656 aa  193  8e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4333  sulfatase  27.65 
 
 		 654 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4201  sulfatase  27.65 
 
 		 654 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000207245  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0138  sulfatase  27.33 
 
 		 654 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000529062  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1625  sulfatase  25.59 
 
 		 635 aa  191  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413884  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3632  sulfatase  26.27 
 
 		 662 aa  191  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2716  sulfatase domain-containing protein  28.28 
 
 		 665 aa  190  8e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.324091  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0377  sulfatase  27.16 
 
 		 671 aa  189  2e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000264889  hitchhiker  0.0000000000000148489 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3723  sulfatase  28.21 
 
 		 633 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3618  sulfatase  28.48 
 
 		 633 aa  184  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4499  sulfatase  26.92 
 
 		 649 aa  181  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000368912 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0526  sulfatase  26.14 
 
 		 633 aa  181  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1979  sulfatase  27.93 
 
 		 663 aa  180  7e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02464  phosphoglycerol transferase  29.23 
 
 		 645 aa  177  5e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003619  phosphoglycerol transferase I  26.54 
 
 		 649 aa  177  6e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878946  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3051  sulfatase  24.76 
 
 		 652 aa  173  6.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.535064  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1932  sulfatase  26.59 
 
 		 666 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0320  sulfatase  25.91 
 
 		 640 aa  172  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2948  hypothetical protein  27.52 
 
 		 633 aa  171  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.146367  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2548  sulfatase  24.91 
 
 		 621 aa  171  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0445  sulfatase  24.96 
 
 		 611 aa  170  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1118  sulfatase  28.21 
 
 		 628 aa  169  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3506  sulfatase  27.27 
 
 		 677 aa  167  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.633638  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1899  sulfatase family protein  26.34 
 
 		 677 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3858  sulfatase  27.05 
 
 		 647 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.499421  normal  0.910234 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2475  sulfatase  28.12 
 
 		 652 aa  161  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84195 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0319  sulfatase  26.19 
 
 		 646 aa  160  7e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4465  sulfatase  27.78 
 
 		 656 aa  157  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1753  sulfatase  29.35 
 
 		 696 aa  157  8e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.100359  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2881  sulfatase  24.05 
 
 		 712 aa  154  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242387  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3537  sulfatase  24.04 
 
 		 650 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1405  sulfatase  29.65 
 
 		 712 aa  148  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0080  sulfatase  25.27 
 
 		 634 aa  144  7e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.204618  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0140  hypothetical protein  26.58 
 
 		 633 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.597793  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1736  sulfatase  24.11 
 
 		 597 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2377  sulfatase  23.93 
 
 		 643 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1564  hypothetical protein  26.29 
 
 		 651 aa  132  3e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1996  sulphatase  25 
 
 		 628 aa  130  9.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.745737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1848  sulfatase  23.54 
 
 		 645 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3271  sulfatase  22.37 
 
 		 642 aa  123  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.269035 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3855  sulfatase  22.57 
 
 		 666 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.593214  normal  0.690048 
 
 
-
 
NC_002950  PG2021  hypothetical protein  23.76 
 
 		 643 aa  117  5e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.112326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0309  sulfatase  26.54 
 
 		 630 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1069  sulfatase  24.39 
 
 		 641 aa  113  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5024  sulfatase  26.65 
 
 		 642 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00083521  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5404  sulfatase  26.95 
 
 		 642 aa  111  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000849395  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5348  sulfatase  26.95 
 
 		 642 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000124675  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4928  sulfatase  26.35 
 
 		 642 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5081  sulfatase  26.35 
 
 		 642 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140992  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4913  sulfatase  26.35 
 
 		 642 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000919892  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5470  sulfatase  26.35 
 
 		 642 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000729601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5321  sulfatase  26.35 
 
 		 642 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.10214e-55 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5353  sulfatase  26.35 
 
 		 642 aa  109  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171789  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5606  sulfatase  26.05 
 
 		 642 aa  108  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000063545  unclonable  7.68096e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3864  sulfatase  26.45 
 
 		 639 aa  107  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00973329  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3766  sulfatase  26.77 
 
 		 642 aa  107  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000560432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1434  sulfatase  26.16 
 
 		 639 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.511966  normal  0.0230537 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0174  sulfatase  28 
 
 		 630 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.326693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3804  sulfatase  26.38 
 
 		 639 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00040285  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3505  sulfatase  26.46 
 
 		 639 aa  105  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000809194  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3535  sulfatase  26.84 
 
 		 639 aa  105  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.009662  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1353  sulfatase  25.11 
 
 		 639 aa  105  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3608  sulfatase  26.52 
 
 		 639 aa  105  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3895  sulfatase  26.52 
 
 		 639 aa  105  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60461  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3776  sulfatase  26.52 
 
 		 639 aa  105  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000208589 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1028  sulfatase  29.25 
 
 		 640 aa  104  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0869325  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3797  sulfatase  26.09 
 
 		 639 aa  104  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000542687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3517  sulfatase  25.58 
 
 		 639 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0043  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  27.05 
 
 		 732 aa  98.6  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0999  sulfatase  26.7 
 
 		 593 aa  98.2  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.477664  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1131  sulfatase  25.63 
 
 		 593 aa  97.8  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1508  sulfatase  26.11 
 
 		 628 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221211 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1436  sulfatase  26.11 
 
 		 628 aa  96.7  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.567309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>