More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3562 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3632  sulfatase  66.26 
 
 		 662 aa  932    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0432  phosphoglycerol transferase  54.06 
 
 		 653 aa  699    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3803  sulfatase  70.72 
 
 		 654 aa  945    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2716  sulfatase domain-containing protein  51.56 
 
 		 665 aa  642    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.324091  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4628  sulfatase  71.12 
 
 		 660 aa  971    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3456  sulfatase  54.35 
 
 		 657 aa  707    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3507  sulfatase  67.65 
 
 		 646 aa  922    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1915  sulfatase  55.75 
 
 		 654 aa  718    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256965  normal  0.471265 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3562  sulfatase  100 
 
 		 682 aa  1401    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0138  sulfatase  71.32 
 
 		 654 aa  961    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000529062  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4012  sulfatase  71.54 
 
 		 654 aa  942    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003619  phosphoglycerol transferase I  50.87 
 
 		 649 aa  706    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878946  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0154  sulfatase  68.37 
 
 		 656 aa  934    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4129  sulfatase  71 
 
 		 654 aa  955    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0174  sulfatase  72.71 
 
 		 670 aa  985    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3808  sulfatase  71.03 
 
 		 654 aa  969    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3884  sulfatase  71.83 
 
 		 654 aa  968    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0240  sulfatase  68.37 
 
 		 678 aa  982    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4201  sulfatase  71.47 
 
 		 654 aa  963    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000207245  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4333  sulfatase  71.47 
 
 		 654 aa  963    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02464  phosphoglycerol transferase  49.92 
 
 		 645 aa  698    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1399  sulfatase  48.17 
 
 		 670 aa  591  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1979  sulfatase  47.96 
 
 		 663 aa  546  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5023  sulfatase  43.49 
 
 		 646 aa  486  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0910313  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0319  sulfatase  37.85 
 
 		 646 aa  394  1e-108  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0080  sulfatase  38.57 
 
 		 634 aa  379  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.204618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3723  sulfatase  30.32 
 
 		 633 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3618  sulfatase  29.7 
 
 		 633 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0526  sulfatase  29.39 
 
 		 633 aa  270  5e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2948  hypothetical protein  30.62 
 
 		 633 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.146367  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4499  sulfatase  33.33 
 
 		 649 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000368912 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1625  sulfatase  30.37 
 
 		 635 aa  261  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413884  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0320  sulfatase  29.48 
 
 		 640 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4465  sulfatase  32.36 
 
 		 656 aa  254  5.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1932  sulfatase  30.16 
 
 		 666 aa  252  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3858  sulfatase  31.27 
 
 		 647 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.499421  normal  0.910234 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1753  sulfatase  30.57 
 
 		 696 aa  248  4e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.100359  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2475  sulfatase  32.25 
 
 		 652 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84195 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2881  sulfatase  30.19 
 
 		 712 aa  245  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242387  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3051  sulfatase  28.41 
 
 		 652 aa  244  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.535064  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3537  sulfatase  29.37 
 
 		 650 aa  232  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1405  sulfatase  30.83 
 
 		 712 aa  230  6e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4881  sulfatase  31.24 
 
 		 695 aa  229  9e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.652285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42670  hypothetical protein  28.29 
 
 		 700 aa  226  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4108  sulfatase  27.54 
 
 		 697 aa  223  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3581  hypothetical protein  28.33 
 
 		 700 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.377432  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1838  hypothetical protein  28.79 
 
 		 685 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.8565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1447  sulfatase  28.7 
 
 		 690 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.189062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3872  sulfatase  28.49 
 
 		 685 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292904  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1118  sulfatase  29.44 
 
 		 628 aa  220  7e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1416  sulfatase  27.79 
 
 		 685 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.934087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25880  Sulfatase protein  29.48 
 
 		 717 aa  218  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1865  sulfatase  28.83 
 
 		 695 aa  207  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119974  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2056  hypothetical protein  28.09 
 
 		 695 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.814835  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0445  sulfatase  26.92 
 
 		 611 aa  195  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0140  hypothetical protein  34.04 
 
 		 633 aa  193  9e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.597793  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2974  hypothetical protein  29.94 
 
 		 550 aa  177  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_002950  PG2021  hypothetical protein  26.84 
 
 		 643 aa  173  1e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.112326 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1736  sulfatase  27.91 
 
 		 597 aa  172  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2548  sulfatase  28.24 
 
 		 621 aa  165  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1564  hypothetical protein  25.65 
 
 		 651 aa  137  6.0000000000000005e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2377  sulfatase  25.28 
 
 		 643 aa  128  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3271  sulfatase  24.84 
 
 		 642 aa  124  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.269035 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1069  sulfatase  24.22 
 
 		 641 aa  122  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1848  sulfatase  23.08 
 
 		 645 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1899  sulfatase family protein  25.19 
 
 		 677 aa  117  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3506  sulfatase  25.24 
 
 		 677 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.633638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3855  sulfatase  22.37 
 
 		 666 aa  111  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.593214  normal  0.690048 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0377  sulfatase  23.72 
 
 		 671 aa  109  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000264889  hitchhiker  0.0000000000000148489 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0309  sulfatase  26.91 
 
 		 630 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1996  sulphatase  23.76 
 
 		 628 aa  106  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.745737 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1353  sulfatase  24.67 
 
 		 639 aa  105  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1100  sulfatase  27.27 
 
 		 609 aa  93.6  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109677  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0174  sulfatase  23.38 
 
 		 630 aa  92  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.326693  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0062  sulfatase  24.25 
 
 		 629 aa  87.8  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000880147  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3757  phosphoglycerol transferase I  27.31 
 
 		 701 aa  85.9  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2852  sulfatase domain-containing protein  25.8 
 
 		 733 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0999  sulfatase  26.3 
 
 		 593 aa  84.3  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.477664  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3211  sulfatase  23.56 
 
 		 612 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139741  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1131  sulfatase  25.58 
 
 		 593 aa  82.4  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2837  sulfatase  25.48 
 
 		 733 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2929  sulfatase  25.16 
 
 		 733 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0161141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1259  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  24.35 
 
 		 730 aa  81.6  0.00000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000749424  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1538  sulfatase  22.91 
 
 		 628 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1033  sulfatase domain-containing protein  24.87 
 
 		 662 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.198685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3516  phosphoglycerol transferase I  24.06 
 
 		 738 aa  80.5  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0478646 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10410  Sulfatase  21.31 
 
 		 729 aa  79.3  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0369  sulfatase  25.6 
 
 		 628 aa  77.8  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151431  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2768  sulfatase  23.56 
 
 		 731 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.518041  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0121  hypothetical protein  23.87 
 
 		 521 aa  77.4  0.0000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1576  sulfatase  22.63 
 
 		 628 aa  77.4  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1139  sulfatase  24.6 
 
 		 628 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1327  sulfatase  23.81 
 
 		 628 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1300  sulfatase; phosphoglycerol transferase  23.81 
 
 		 628 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1301  sulfatase; phosphoglycerol transferase  23.81 
 
 		 628 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1436  sulfatase  23.81 
 
 		 628 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.567309  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1028  sulfatase  24.48 
 
 		 640 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0869325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1508  sulfatase  23.81 
 
 		 628 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49940  hypothetical protein  22.09 
 
 		 774 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.278868 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0514  phosphoglycerol transferase I  24.75 
 
 		 765 aa  76.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200662 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>