More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1899 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1899  sulfatase family protein  100 
 
 
677 aa  1381    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3506  sulfatase  93.06 
 
 
677 aa  1287    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.633638  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0377  sulfatase  35.02 
 
 
671 aa  424  1e-117  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000264889  hitchhiker  0.0000000000000148489 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1848  sulfatase  35.14 
 
 
645 aa  415  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1416  sulfatase  26.87 
 
 
685 aa  190  9e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.934087  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1838  hypothetical protein  26.87 
 
 
685 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.8565  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3872  sulfatase  26.74 
 
 
685 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292904  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1447  sulfatase  26.41 
 
 
690 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.189062 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42670  hypothetical protein  27 
 
 
700 aa  178  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3581  hypothetical protein  26.87 
 
 
700 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.377432  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4108  sulfatase  27.57 
 
 
697 aa  173  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25880  Sulfatase protein  28.67 
 
 
717 aa  171  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1865  sulfatase  27.12 
 
 
695 aa  171  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119974  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2056  hypothetical protein  26.34 
 
 
695 aa  165  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.814835  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4499  sulfatase  26.04 
 
 
649 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000368912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2974  hypothetical protein  28.94 
 
 
550 aa  160  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003619  phosphoglycerol transferase I  26.6 
 
 
649 aa  154  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3723  sulfatase  25.39 
 
 
633 aa  152  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02464  phosphoglycerol transferase  26.52 
 
 
645 aa  151  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0526  sulfatase  24.92 
 
 
633 aa  150  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3618  sulfatase  25.7 
 
 
633 aa  148  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3858  sulfatase  24.78 
 
 
647 aa  146  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.499421  normal  0.910234 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2948  hypothetical protein  24.75 
 
 
633 aa  145  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.146367  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4465  sulfatase  25.89 
 
 
656 aa  139  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1625  sulfatase  23.65 
 
 
635 aa  137  9e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413884  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5023  sulfatase  24.44 
 
 
646 aa  132  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0910313  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1932  sulfatase  25.2 
 
 
666 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4628  sulfatase  25.77 
 
 
660 aa  128  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4129  sulfatase  26.16 
 
 
654 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3808  sulfatase  26.68 
 
 
654 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4333  sulfatase  26.25 
 
 
654 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3884  sulfatase  26.7 
 
 
654 aa  127  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1915  sulfatase  23.94 
 
 
654 aa  127  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256965  normal  0.471265 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2881  sulfatase  24.07 
 
 
712 aa  126  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242387  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3456  sulfatase  27.03 
 
 
657 aa  127  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383156  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0320  sulfatase  28.7 
 
 
640 aa  125  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0240  sulfatase  26.62 
 
 
678 aa  125  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4201  sulfatase  25.83 
 
 
654 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000207245  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1753  sulfatase  23.55 
 
 
696 aa  125  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.100359  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0138  sulfatase  26.05 
 
 
654 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000529062  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3632  sulfatase  25.49 
 
 
662 aa  124  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3507  sulfatase  24.61 
 
 
646 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0154  sulfatase  28.48 
 
 
656 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3803  sulfatase  28.48 
 
 
654 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2475  sulfatase  23.22 
 
 
652 aa  120  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4881  sulfatase  26.32 
 
 
695 aa  117  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.652285 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3562  sulfatase  25.19 
 
 
682 aa  117  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1405  sulfatase  26.41 
 
 
712 aa  116  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3537  sulfatase  22.9 
 
 
650 aa  115  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3051  sulfatase  22.99 
 
 
652 aa  114  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.535064  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2716  sulfatase domain-containing protein  23.26 
 
 
665 aa  114  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.324091  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0174  sulfatase  25.1 
 
 
670 aa  114  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1118  sulfatase  24.63 
 
 
628 aa  112  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0432  phosphoglycerol transferase  24.83 
 
 
653 aa  110  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4012  sulfatase  26.42 
 
 
654 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3608  sulfatase  27.86 
 
 
639 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3505  sulfatase  27.86 
 
 
639 aa  108  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000809194  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3895  sulfatase  27.86 
 
 
639 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60461  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3776  sulfatase  27.86 
 
 
639 aa  108  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000208589 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3797  sulfatase  27.86 
 
 
639 aa  107  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000542687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3517  sulfatase  27.78 
 
 
639 aa  108  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3864  sulfatase  27.78 
 
 
639 aa  107  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00973329  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5353  sulfatase  26.68 
 
 
642 aa  107  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171789  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5321  sulfatase  26.68 
 
 
642 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.10214e-55 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5606  sulfatase  27.09 
 
 
642 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000063545  unclonable  7.68096e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3804  sulfatase  27.7 
 
 
639 aa  107  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00040285  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5024  sulfatase  27.1 
 
 
642 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00083521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5081  sulfatase  26.68 
 
 
642 aa  106  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140992  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4913  sulfatase  26.68 
 
 
642 aa  106  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000919892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4928  sulfatase  26.68 
 
 
642 aa  106  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5470  sulfatase  26.68 
 
 
642 aa  106  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000729601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5404  sulfatase  26.94 
 
 
642 aa  106  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000849395  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1434  sulfatase  27.78 
 
 
639 aa  106  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.511966  normal  0.0230537 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5348  sulfatase  26.68 
 
 
642 aa  105  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000124675  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3535  sulfatase  27.2 
 
 
639 aa  105  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.009662  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1399  sulfatase  23.17 
 
 
670 aa  103  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3766  sulfatase  26.67 
 
 
642 aa  102  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000560432  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1979  sulfatase  27.08 
 
 
663 aa  100  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0319  sulfatase  22.7 
 
 
646 aa  100  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0999  sulfatase  28.06 
 
 
593 aa  100  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.477664  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1131  sulfatase  28.06 
 
 
593 aa  99.4  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0140  hypothetical protein  24.92 
 
 
633 aa  98.6  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.597793  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0080  sulfatase  22.12 
 
 
634 aa  97.4  7e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.204618  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1996  sulphatase  22.81 
 
 
628 aa  94  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.745737 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0174  sulfatase  24.25 
 
 
630 aa  92.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.326693  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1100  sulfatase  21.68 
 
 
609 aa  90.5  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109677  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1066  sulfatase  26.52 
 
 
651 aa  88.2  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3855  sulfatase  23.54 
 
 
666 aa  87  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.593214  normal  0.690048 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0062  sulfatase  25 
 
 
629 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000880147  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0182  sulfatase  26.74 
 
 
653 aa  80.9  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3271  sulfatase  23.55 
 
 
642 aa  80.9  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.269035 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0854  sulfatase  24.94 
 
 
672 aa  80.9  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1586  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  28.27 
 
 
689 aa  80.1  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0888013  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1028  sulfatase  26.75 
 
 
640 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0869325  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2548  sulfatase  23.08 
 
 
621 aa  79  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2740  sulfatase  25.58 
 
 
657 aa  79  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000010539  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0584  sulfatase family protein  24.86 
 
 
602 aa  79  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0369  sulfatase  25.86 
 
 
628 aa  79  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151431  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0575  sulfatase family protein  24.01 
 
 
608 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122436  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0662  sulfatase  25.78 
 
 
630 aa  78.2  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>