292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3632 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003619  phosphoglycerol transferase I  54.16 
 
 		 649 aa  724    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878946  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3632  sulfatase  100 
 
 		 662 aa  1359    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3507  sulfatase  71.12 
 
 		 646 aa  976    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02464  phosphoglycerol transferase  54.79 
 
 		 645 aa  739    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4628  sulfatase  72.4 
 
 		 660 aa  1013    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3456  sulfatase  53.47 
 
 		 657 aa  717    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4333  sulfatase  71.74 
 
 		 654 aa  994    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1915  sulfatase  53.58 
 
 		 654 aa  688    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256965  normal  0.471265 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0432  phosphoglycerol transferase  54.42 
 
 		 653 aa  706    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0138  sulfatase  71.27 
 
 		 654 aa  991    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000529062  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3562  sulfatase  66.26 
 
 		 682 aa  945    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4201  sulfatase  71.58 
 
 		 654 aa  991    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000207245  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4129  sulfatase  71.43 
 
 		 654 aa  986    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4012  sulfatase  71.67 
 
 		 654 aa  974    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3808  sulfatase  71.67 
 
 		 654 aa  998    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3884  sulfatase  71.52 
 
 		 654 aa  995    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0240  sulfatase  68.64 
 
 		 678 aa  969    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0174  sulfatase  76.66 
 
 		 670 aa  1059    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0154  sulfatase  74.77 
 
 		 656 aa  1043    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3803  sulfatase  71.29 
 
 		 654 aa  980    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2716  sulfatase domain-containing protein  50 
 
 		 665 aa  634  1e-180  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.324091  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1399  sulfatase  46.72 
 
 		 670 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1979  sulfatase  46.42 
 
 		 663 aa  548  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5023  sulfatase  42.35 
 
 		 646 aa  492  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0910313  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0080  sulfatase  39.96 
 
 		 634 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.204618  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0319  sulfatase  36.28 
 
 		 646 aa  387  1e-106  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3723  sulfatase  34.87 
 
 		 633 aa  295  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3618  sulfatase  32.89 
 
 		 633 aa  286  8e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0526  sulfatase  31.57 
 
 		 633 aa  278  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1625  sulfatase  30.34 
 
 		 635 aa  268  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413884  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4499  sulfatase  31.11 
 
 		 649 aa  263  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000368912 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2948  hypothetical protein  30.78 
 
 		 633 aa  263  8e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.146367  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0320  sulfatase  31.36 
 
 		 640 aa  257  6e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3051  sulfatase  28.99 
 
 		 652 aa  254  5.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.535064  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1753  sulfatase  31.81 
 
 		 696 aa  252  1e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.100359  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3858  sulfatase  32.38 
 
 		 647 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.499421  normal  0.910234 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1405  sulfatase  31.58 
 
 		 712 aa  251  4e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2475  sulfatase  32.49 
 
 		 652 aa  250  6e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84195 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1932  sulfatase  32.26 
 
 		 666 aa  240  6.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4465  sulfatase  30.07 
 
 		 656 aa  234  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2881  sulfatase  31.65 
 
 		 712 aa  233  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4881  sulfatase  29.49 
 
 		 695 aa  230  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.652285 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0140  hypothetical protein  31.09 
 
 		 633 aa  223  6e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.597793  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1118  sulfatase  30.65 
 
 		 628 aa  221  3e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3537  sulfatase  27.72 
 
 		 650 aa  217  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42670  hypothetical protein  27.26 
 
 		 700 aa  217  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4108  sulfatase  28.19 
 
 		 697 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1447  sulfatase  27.43 
 
 		 690 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.189062 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25880  Sulfatase protein  29.8 
 
 		 717 aa  209  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3581  hypothetical protein  27.33 
 
 		 700 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.377432  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1416  sulfatase  27.59 
 
 		 685 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.934087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3872  sulfatase  27.73 
 
 		 685 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292904  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1838  hypothetical protein  27.73 
 
 		 685 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.8565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0445  sulfatase  28.44 
 
 		 611 aa  195  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1865  sulfatase  26.16 
 
 		 695 aa  186  9e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119974  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2056  hypothetical protein  26.16 
 
 		 695 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.814835  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2548  sulfatase  26.93 
 
 		 621 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2974  hypothetical protein  30.96 
 
 		 550 aa  167  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_002950  PG2021  hypothetical protein  24.51 
 
 		 643 aa  166  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.112326 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1736  sulfatase  27.77 
 
 		 597 aa  153  8.999999999999999e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_002950  PG1564  hypothetical protein  24.84 
 
 		 651 aa  125  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1899  sulfatase family protein  25.49 
 
 		 677 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3506  sulfatase  26.06 
 
 		 677 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.633638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1848  sulfatase  24.35 
 
 		 645 aa  123  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3271  sulfatase  24.01 
 
 		 642 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.269035 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2377  sulfatase  29.37 
 
 		 643 aa  111  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0309  sulfatase  29.04 
 
 		 630 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0377  sulfatase  27.56 
 
 		 671 aa  107  9e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000264889  hitchhiker  0.0000000000000148489 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1069  sulfatase  26.05 
 
 		 641 aa  104  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1996  sulphatase  26.75 
 
 		 628 aa  103  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.745737 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1353  sulfatase  23.59 
 
 		 639 aa  102  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3855  sulfatase  25.71 
 
 		 666 aa  99  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.593214  normal  0.690048 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3757  phosphoglycerol transferase I  26.91 
 
 		 701 aa  90.1  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0174  sulfatase  23.37 
 
 		 630 aa  89.7  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.326693  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1100  sulfatase  24.37 
 
 		 609 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109677  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0854  sulfatase  22.85 
 
 		 672 aa  85.9  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1576  sulfatase  23.6 
 
 		 628 aa  84  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1327  sulfatase  23.53 
 
 		 628 aa  84  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1301  sulfatase; phosphoglycerol transferase  23.53 
 
 		 628 aa  84  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1436  sulfatase  23.53 
 
 		 628 aa  84  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.567309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1508  sulfatase  23.53 
 
 		 628 aa  84  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221211 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1538  sulfatase  23.6 
 
 		 628 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1300  sulfatase; phosphoglycerol transferase  23.53 
 
 		 628 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0062  sulfatase  24.85 
 
 		 629 aa  81.6  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000880147  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1028  sulfatase  23.97 
 
 		 640 aa  80.9  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0869325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0570  sulfatase family protein  23.48 
 
 		 602 aa  80.9  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0584  sulfatase family protein  23.48 
 
 		 602 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1033  sulfatase domain-containing protein  25.19 
 
 		 662 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.198685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1259  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  24.72 
 
 		 730 aa  79  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000749424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1340  sulfatase  23.25 
 
 		 628 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.5616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3874  sulfatase  23.25 
 
 		 628 aa  77.8  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.295207 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2852  sulfatase domain-containing protein  23.94 
 
 		 733 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4949  phosphoglycerol transferase I  26.09 
 
 		 763 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3505  sulfatase  23.1 
 
 		 639 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000809194  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4896  phosphoglycerol transferase I  26.09 
 
 		 763 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4862  phosphoglycerol transferase I  26.17 
 
 		 763 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4795  phosphoglycerol transferase I  26.09 
 
 		 763 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.552805  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4955  phosphoglycerol transferase I  26.09 
 
 		 763 aa  77  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.122981  normal  0.467109 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2837  sulfatase  22.68 
 
 		 733 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1470  sulfatase  22.97 
 
 		 628 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>