236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1838 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1838  hypothetical protein  100 
 
 		 685 aa  1409    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.8565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3872  sulfatase  99.12 
 
 		 685 aa  1400    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292904  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2974  hypothetical protein  65.35 
 
 		 550 aa  684    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1447  sulfatase  92.76 
 
 		 690 aa  1325    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.189062 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2056  hypothetical protein  72.13 
 
 		 695 aa  1021    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.814835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1865  sulfatase  71.84 
 
 		 695 aa  1016    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3581  hypothetical protein  70.88 
 
 		 700 aa  1011    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.377432  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4108  sulfatase  73.85 
 
 		 697 aa  1076    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25880  Sulfatase protein  62.61 
 
 		 717 aa  843    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1416  sulfatase  97.08 
 
 		 685 aa  1377    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.934087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42670  hypothetical protein  71.16 
 
 		 700 aa  1020    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0240  sulfatase  29 
 
 		 678 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3562  sulfatase  28.79 
 
 		 682 aa  221  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0174  sulfatase  28.02 
 
 		 670 aa  218  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1915  sulfatase  29.45 
 
 		 654 aa  213  7e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256965  normal  0.471265 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1399  sulfatase  30.83 
 
 		 670 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3507  sulfatase  27.27 
 
 		 646 aa  209  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003619  phosphoglycerol transferase I  29.64 
 
 		 649 aa  204  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878946  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3456  sulfatase  28.09 
 
 		 657 aa  202  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3884  sulfatase  27.88 
 
 		 654 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3632  sulfatase  27.69 
 
 		 662 aa  201  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0154  sulfatase  27.26 
 
 		 656 aa  201  5e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5023  sulfatase  27.04 
 
 		 646 aa  201  5e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0910313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1625  sulfatase  27.57 
 
 		 635 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413884  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02464  phosphoglycerol transferase  27.08 
 
 		 645 aa  199  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4628  sulfatase  27.94 
 
 		 660 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3803  sulfatase  26.32 
 
 		 654 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4129  sulfatase  25.55 
 
 		 654 aa  197  6e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4881  sulfatase  31.96 
 
 		 695 aa  196  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.652285 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3808  sulfatase  27.94 
 
 		 654 aa  196  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0377  sulfatase  26.06 
 
 		 671 aa  195  2e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000264889  hitchhiker  0.0000000000000148489 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4201  sulfatase  25.55 
 
 		 654 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000207245  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4333  sulfatase  25.55 
 
 		 654 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0138  sulfatase  27.16 
 
 		 654 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000529062  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3051  sulfatase  25.19 
 
 		 652 aa  194  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.535064  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0432  phosphoglycerol transferase  26.86 
 
 		 653 aa  193  8e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4499  sulfatase  27.52 
 
 		 649 aa  192  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000368912 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4012  sulfatase  27.58 
 
 		 654 aa  193  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1899  sulfatase family protein  26.87 
 
 		 677 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2716  sulfatase domain-containing protein  27.91 
 
 		 665 aa  186  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.324091  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1979  sulfatase  26.92 
 
 		 663 aa  182  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3723  sulfatase  26.02 
 
 		 633 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2948  hypothetical protein  26.33 
 
 		 633 aa  180  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.146367  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3618  sulfatase  26.09 
 
 		 633 aa  180  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0526  sulfatase  27.39 
 
 		 633 aa  180  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1932  sulfatase  26.45 
 
 		 666 aa  180  8e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3506  sulfatase  26.42 
 
 		 677 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.633638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0320  sulfatase  24.62 
 
 		 640 aa  177  6e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3858  sulfatase  26.51 
 
 		 647 aa  177  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.499421  normal  0.910234 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0319  sulfatase  25 
 
 		 646 aa  171  3e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2475  sulfatase  27.99 
 
 		 652 aa  170  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0445  sulfatase  24.55 
 
 		 611 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3537  sulfatase  23.69 
 
 		 650 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4465  sulfatase  25.29 
 
 		 656 aa  161  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1405  sulfatase  29.69 
 
 		 712 aa  162  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1118  sulfatase  28.26 
 
 		 628 aa  160  7e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2548  sulfatase  23.38 
 
 		 621 aa  160  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2881  sulfatase  25.81 
 
 		 712 aa  159  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242387  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0080  sulfatase  24.25 
 
 		 634 aa  156  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.204618  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0140  hypothetical protein  29.89 
 
 		 633 aa  154  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.597793  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1753  sulfatase  25.38 
 
 		 696 aa  154  4e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.100359  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1564  hypothetical protein  23.59 
 
 		 651 aa  139  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3855  sulfatase  23.3 
 
 		 666 aa  135  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.593214  normal  0.690048 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2377  sulfatase  24.7 
 
 		 643 aa  134  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1848  sulfatase  24.26 
 
 		 645 aa  134  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1736  sulfatase  22.82 
 
 		 597 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1353  sulfatase  23.18 
 
 		 639 aa  123  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3271  sulfatase  21.73 
 
 		 642 aa  122  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.269035 
 
 
-
 
NC_002950  PG2021  hypothetical protein  23.93 
 
 		 643 aa  121  4.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.112326 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1996  sulphatase  24.69 
 
 		 628 aa  121  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.745737 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0174  sulfatase  28.89 
 
 		 630 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.326693  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1069  sulfatase  23.61 
 
 		 641 aa  110  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0309  sulfatase  25.35 
 
 		 630 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0043  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  26.45 
 
 		 732 aa  104  5e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0157  membrane associated sulfatase  23.02 
 
 		 659 aa  101  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149975  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0187  membrane protein  23.02 
 
 		 659 aa  101  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0462581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1508  sulfatase  26.92 
 
 		 628 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221211 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1327  sulfatase  26.92 
 
 		 628 aa  99.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1300  sulfatase; phosphoglycerol transferase  26.92 
 
 		 628 aa  99.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1576  sulfatase  26.92 
 
 		 628 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1301  sulfatase; phosphoglycerol transferase  26.92 
 
 		 628 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1434  sulfatase  25.88 
 
 		 639 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.511966  normal  0.0230537 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1436  sulfatase  26.92 
 
 		 628 aa  99.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.567309  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3505  sulfatase  25.88 
 
 		 639 aa  98.6  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000809194  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1538  sulfatase  26.6 
 
 		 628 aa  98.2  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3608  sulfatase  25.88 
 
 		 639 aa  98.6  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3895  sulfatase  25.88 
 
 		 639 aa  98.6  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60461  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3776  sulfatase  25.88 
 
 		 639 aa  98.6  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000208589 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3804  sulfatase  25.56 
 
 		 639 aa  98.2  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00040285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4928  sulfatase  24.29 
 
 		 642 aa  97.8  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5024  sulfatase  24.61 
 
 		 642 aa  97.8  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00083521  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0322  sulfatase  24.05 
 
 		 662 aa  97.8  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4913  sulfatase  24.29 
 
 		 642 aa  97.8  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000919892  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3535  sulfatase  25.56 
 
 		 639 aa  97.4  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.009662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5321  sulfatase  24.29 
 
 		 642 aa  97.4  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.10214e-55 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3797  sulfatase  25.56 
 
 		 639 aa  97.4  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000542687  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5081  sulfatase  24.29 
 
 		 642 aa  97.4  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140992  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5470  sulfatase  24.29 
 
 		 642 aa  97.4  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000729601  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1028  sulfatase  28.57 
 
 		 640 aa  97.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0869325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1340  sulfatase  26.6 
 
 		 628 aa  96.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.5616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>