278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3618 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2948  hypothetical protein  62.06 
 
 		 633 aa  815    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.146367  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3723  sulfatase  94.79 
 
 		 633 aa  1243    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1625  sulfatase  56.99 
 
 		 635 aa  723    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413884  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0526  sulfatase  63.35 
 
 		 633 aa  821    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3618  sulfatase  100 
 
 		 633 aa  1298    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0320  sulfatase  44.25 
 
 		 640 aa  557  1e-157  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4499  sulfatase  43.36 
 
 		 649 aa  522  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000368912 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1405  sulfatase  46.25 
 
 		 712 aa  524  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1932  sulfatase  43.47 
 
 		 666 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4881  sulfatase  45.57 
 
 		 695 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.652285 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1753  sulfatase  44.03 
 
 		 696 aa  504  1e-141  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.100359  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2475  sulfatase  45.12 
 
 		 652 aa  501  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84195 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3858  sulfatase  46.3 
 
 		 647 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.499421  normal  0.910234 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3051  sulfatase  41.54 
 
 		 652 aa  495  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.535064  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2881  sulfatase  41.4 
 
 		 712 aa  486  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242387  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1118  sulfatase  42.76 
 
 		 628 aa  466  9.999999999999999e-131  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4465  sulfatase  39.97 
 
 		 656 aa  452  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3537  sulfatase  37.76 
 
 		 650 aa  442  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0140  hypothetical protein  40.89 
 
 		 633 aa  436  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.597793  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3808  sulfatase  33.54 
 
 		 654 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3884  sulfatase  33.49 
 
 		 654 aa  302  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4628  sulfatase  33.23 
 
 		 660 aa  301  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0174  sulfatase  32.4 
 
 		 670 aa  296  6e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003619  phosphoglycerol transferase I  33.04 
 
 		 649 aa  293  7e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878946  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3632  sulfatase  32.77 
 
 		 662 aa  282  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4333  sulfatase  32.95 
 
 		 654 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0138  sulfatase  33.22 
 
 		 654 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000529062  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4012  sulfatase  33.23 
 
 		 654 aa  280  4e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4201  sulfatase  32.78 
 
 		 654 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000207245  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4129  sulfatase  32.45 
 
 		 654 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3562  sulfatase  29.7 
 
 		 682 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0154  sulfatase  30.83 
 
 		 656 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3803  sulfatase  32.56 
 
 		 654 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1915  sulfatase  29.3 
 
 		 654 aa  274  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256965  normal  0.471265 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1399  sulfatase  32.72 
 
 		 670 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02464  phosphoglycerol transferase  31.23 
 
 		 645 aa  273  5.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5023  sulfatase  31.76 
 
 		 646 aa  273  7e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0910313  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3507  sulfatase  30.75 
 
 		 646 aa  272  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0240  sulfatase  32.33 
 
 		 678 aa  269  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3456  sulfatase  30.41 
 
 		 657 aa  259  7e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1979  sulfatase  30.23 
 
 		 663 aa  259  9e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0432  phosphoglycerol transferase  31.77 
 
 		 653 aa  254  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0319  sulfatase  28.03 
 
 		 646 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2716  sulfatase domain-containing protein  29.8 
 
 		 665 aa  234  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.324091  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0080  sulfatase  30 
 
 		 634 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.204618  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25880  Sulfatase protein  28.35 
 
 		 717 aa  200  6e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4108  sulfatase  27.5 
 
 		 697 aa  200  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1416  sulfatase  26.82 
 
 		 685 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.934087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42670  hypothetical protein  26.08 
 
 		 700 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1447  sulfatase  26.28 
 
 		 690 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.189062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3872  sulfatase  26.26 
 
 		 685 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292904  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1865  sulfatase  27.68 
 
 		 695 aa  181  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119974  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1838  hypothetical protein  26.09 
 
 		 685 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.8565  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2056  hypothetical protein  27.97 
 
 		 695 aa  180  8e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.814835  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2974  hypothetical protein  28.71 
 
 		 550 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3581  hypothetical protein  29.65 
 
 		 700 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.377432  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0445  sulfatase  25.84 
 
 		 611 aa  160  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2548  sulfatase  27.85 
 
 		 621 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1899  sulfatase family protein  25.7 
 
 		 677 aa  148  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3506  sulfatase  26.09 
 
 		 677 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.633638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0377  sulfatase  25.04 
 
 		 671 aa  140  4.999999999999999e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000264889  hitchhiker  0.0000000000000148489 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1736  sulfatase  29.05 
 
 		 597 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_002950  PG1564  hypothetical protein  26.65 
 
 		 651 aa  134  6.999999999999999e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2377  sulfatase  28.14 
 
 		 643 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2021  hypothetical protein  24.28 
 
 		 643 aa  127  7e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.112326 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3855  sulfatase  27.04 
 
 		 666 aa  117  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.593214  normal  0.690048 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1848  sulfatase  25.82 
 
 		 645 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1069  sulfatase  24.7 
 
 		 641 aa  110  5e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1996  sulphatase  24.21 
 
 		 628 aa  108  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.745737 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1353  sulfatase  26.38 
 
 		 639 aa  104  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0309  sulfatase  24.35 
 
 		 630 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3271  sulfatase  26.28 
 
 		 642 aa  101  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.269035 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0062  sulfatase  24.7 
 
 		 629 aa  95.1  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000880147  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0174  sulfatase  26.07 
 
 		 630 aa  95.1  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.326693  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3766  sulfatase  26.06 
 
 		 642 aa  93.6  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000560432  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3505  sulfatase  24.02 
 
 		 639 aa  93.2  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000809194  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2207  sulfatase  26.61 
 
 		 627 aa  93.6  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3608  sulfatase  24.32 
 
 		 639 aa  92.8  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3517  sulfatase  24.32 
 
 		 639 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3776  sulfatase  24.32 
 
 		 639 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000208589 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3895  sulfatase  24.32 
 
 		 639 aa  92.8  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60461  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2501  sulfatase  26.32 
 
 		 629 aa  92.8  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3804  sulfatase  24.52 
 
 		 639 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00040285  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3797  sulfatase  23.95 
 
 		 639 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000542687  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3535  sulfatase  23.95 
 
 		 639 aa  91.3  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.009662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3864  sulfatase  23.65 
 
 		 639 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00973329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5606  sulfatase  24.47 
 
 		 642 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000063545  unclonable  7.68096e-25 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1434  sulfatase  24.25 
 
 		 639 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.511966  normal  0.0230537 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5353  sulfatase  24.47 
 
 		 642 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171789  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5024  sulfatase  25 
 
 		 642 aa  89.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00083521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5321  sulfatase  24.14 
 
 		 642 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.10214e-55 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5348  sulfatase  24.47 
 
 		 642 aa  89  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000124675  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5404  sulfatase  24.46 
 
 		 642 aa  89  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000849395  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5081  sulfatase  24.14 
 
 		 642 aa  88.6  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140992  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4913  sulfatase  24.14 
 
 		 642 aa  88.6  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000919892  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5470  sulfatase  24.14 
 
 		 642 aa  88.6  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000729601  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4928  sulfatase  24.22 
 
 		 642 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0371  sulfatase  26.03 
 
 		 625 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000394083  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3211  sulfatase  27.33 
 
 		 612 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139741  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0584  sulfatase family protein  25.31 
 
 		 602 aa  84.3  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>