284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1625 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3723  sulfatase  57.52 
 
 
633 aa  732    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2948  hypothetical protein  59.87 
 
 
633 aa  740    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.146367  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1625  sulfatase  100 
 
 
635 aa  1300    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413884  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3618  sulfatase  56.99 
 
 
633 aa  723    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0526  sulfatase  59.46 
 
 
633 aa  763    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0320  sulfatase  48.19 
 
 
640 aa  625  1e-177  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1932  sulfatase  45.06 
 
 
666 aa  543  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4881  sulfatase  45.1 
 
 
695 aa  530  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.652285 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1405  sulfatase  47.18 
 
 
712 aa  527  1e-148  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2475  sulfatase  44.95 
 
 
652 aa  522  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4499  sulfatase  43.24 
 
 
649 aa  525  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000368912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3051  sulfatase  40.5 
 
 
652 aa  522  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.535064  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3858  sulfatase  45.39 
 
 
647 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.499421  normal  0.910234 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4465  sulfatase  42.33 
 
 
656 aa  489  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3537  sulfatase  40.93 
 
 
650 aa  476  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2881  sulfatase  42.81 
 
 
712 aa  475  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242387  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1118  sulfatase  44 
 
 
628 aa  471  1.0000000000000001e-131  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1753  sulfatase  44.71 
 
 
696 aa  461  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.100359  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0140  hypothetical protein  38.89 
 
 
633 aa  437  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.597793  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0174  sulfatase  31.86 
 
 
670 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5023  sulfatase  31.69 
 
 
646 aa  273  8.000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0910313  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4333  sulfatase  31.2 
 
 
654 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4129  sulfatase  30.66 
 
 
654 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003619  phosphoglycerol transferase I  31.1 
 
 
649 aa  270  5e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878946  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3507  sulfatase  31.1 
 
 
646 aa  270  7e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0154  sulfatase  29.74 
 
 
656 aa  270  7e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0138  sulfatase  31.04 
 
 
654 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000529062  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02464  phosphoglycerol transferase  31.92 
 
 
645 aa  269  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4628  sulfatase  31.4 
 
 
660 aa  268  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1915  sulfatase  31.06 
 
 
654 aa  268  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256965  normal  0.471265 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4201  sulfatase  30.77 
 
 
654 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000207245  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3803  sulfatase  30.91 
 
 
654 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3808  sulfatase  30.17 
 
 
654 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3884  sulfatase  30.9 
 
 
654 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3632  sulfatase  30.6 
 
 
662 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3456  sulfatase  39.36 
 
 
657 aa  266  8.999999999999999e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383156  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3562  sulfatase  30.37 
 
 
682 aa  261  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0240  sulfatase  31.67 
 
 
678 aa  257  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0432  phosphoglycerol transferase  30 
 
 
653 aa  256  6e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0319  sulfatase  29.12 
 
 
646 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1399  sulfatase  29.44 
 
 
670 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4012  sulfatase  31.23 
 
 
654 aa  248  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2716  sulfatase domain-containing protein  30.96 
 
 
665 aa  245  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.324091  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1979  sulfatase  28.55 
 
 
663 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0080  sulfatase  30.41 
 
 
634 aa  211  4e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.204618  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42670  hypothetical protein  27.51 
 
 
700 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1416  sulfatase  27.57 
 
 
685 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.934087  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3581  hypothetical protein  27.18 
 
 
700 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.377432  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25880  Sulfatase protein  27.55 
 
 
717 aa  201  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3872  sulfatase  27.41 
 
 
685 aa  201  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292904  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1447  sulfatase  26.58 
 
 
690 aa  200  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.189062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1838  hypothetical protein  27.57 
 
 
685 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.8565  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4108  sulfatase  26.85 
 
 
697 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1865  sulfatase  25.27 
 
 
695 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119974  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2056  hypothetical protein  25.59 
 
 
695 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.814835  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2974  hypothetical protein  27.97 
 
 
550 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2548  sulfatase  29.63 
 
 
621 aa  167  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0377  sulfatase  26.02 
 
 
671 aa  157  4e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000264889  hitchhiker  0.0000000000000148489 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0445  sulfatase  30.15 
 
 
611 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3506  sulfatase  23.61 
 
 
677 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.633638  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1899  sulfatase family protein  23.65 
 
 
677 aa  137  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1848  sulfatase  22.54 
 
 
645 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2377  sulfatase  30.67 
 
 
643 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2021  hypothetical protein  25.14 
 
 
643 aa  130  8.000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.112326 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1736  sulfatase  31.05 
 
 
597 aa  127  9e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_002950  PG1564  hypothetical protein  28 
 
 
651 aa  124  4e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1996  sulphatase  28.13 
 
 
628 aa  122  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.745737 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1353  sulfatase  26.65 
 
 
639 aa  120  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0062  sulfatase  24.91 
 
 
629 aa  118  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000880147  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3855  sulfatase  26.73 
 
 
666 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.593214  normal  0.690048 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1069  sulfatase  25.53 
 
 
641 aa  113  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3271  sulfatase  26.04 
 
 
642 aa  106  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.269035 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0174  sulfatase  25.56 
 
 
630 aa  104  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.326693  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1100  sulfatase  26.06 
 
 
609 aa  95.5  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109677  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0309  sulfatase  25.87 
 
 
630 aa  94.7  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5081  sulfatase  25.87 
 
 
642 aa  94  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140992  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5470  sulfatase  25.87 
 
 
642 aa  94  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000729601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5321  sulfatase  25.87 
 
 
642 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.10214e-55 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4913  sulfatase  25.87 
 
 
642 aa  93.6  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000919892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4928  sulfatase  25.94 
 
 
642 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0999  sulfatase  25.11 
 
 
593 aa  92.8  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.477664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2501  sulfatase  26.54 
 
 
629 aa  92  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5024  sulfatase  25.87 
 
 
642 aa  91.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00083521  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3804  sulfatase  25.37 
 
 
639 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00040285  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1131  sulfatase  25.12 
 
 
593 aa  91.3  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3517  sulfatase  25.95 
 
 
639 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0371  sulfatase  26.59 
 
 
625 aa  90.9  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000394083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5353  sulfatase  26.11 
 
 
642 aa  90.9  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171789  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3535  sulfatase  25.95 
 
 
639 aa  90.5  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.009662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3776  sulfatase  25.95 
 
 
639 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000208589 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3608  sulfatase  25.95 
 
 
639 aa  90.1  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3895  sulfatase  25.95 
 
 
639 aa  90.1  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60461  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2207  sulfatase  26.09 
 
 
627 aa  90.1  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5348  sulfatase  26.11 
 
 
642 aa  89  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000124675  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3864  sulfatase  25.63 
 
 
639 aa  89  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00973329  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5404  sulfatase  26.43 
 
 
642 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000849395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3505  sulfatase  26.07 
 
 
639 aa  89  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000809194  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1434  sulfatase  25.95 
 
 
639 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.511966  normal  0.0230537 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5606  sulfatase  25.8 
 
 
642 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000063545  unclonable  7.68096e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3766  sulfatase  27.18 
 
 
642 aa  88.6  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000560432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>