269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3808 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0154  sulfatase  75 
 
 		 656 aa  1016    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2716  sulfatase domain-containing protein  51.09 
 
 		 665 aa  661    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.324091  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4201  sulfatase  90.98 
 
 		 654 aa  1208    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000207245  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4628  sulfatase  94.34 
 
 		 660 aa  1274    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4129  sulfatase  90.83 
 
 		 654 aa  1204    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3562  sulfatase  71.03 
 
 		 682 aa  969    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4333  sulfatase  91.13 
 
 		 654 aa  1209    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0174  sulfatase  74.61 
 
 		 670 aa  1032    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3803  sulfatase  86.09 
 
 		 654 aa  1156    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003619  phosphoglycerol transferase I  54.74 
 
 		 649 aa  742    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878946  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3456  sulfatase  55.47 
 
 		 657 aa  723    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3808  sulfatase  100 
 
 		 654 aa  1332    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3884  sulfatase  96.18 
 
 		 654 aa  1294    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0240  sulfatase  71.91 
 
 		 678 aa  1003    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02464  phosphoglycerol transferase  54.43 
 
 		 645 aa  740    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3632  sulfatase  71.5 
 
 		 662 aa  988    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4012  sulfatase  96.33 
 
 		 654 aa  1274    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3507  sulfatase  73.76 
 
 		 646 aa  1009    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0432  phosphoglycerol transferase  55.07 
 
 		 653 aa  716    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1915  sulfatase  54.16 
 
 		 654 aa  699    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256965  normal  0.471265 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0138  sulfatase  90.67 
 
 		 654 aa  1205    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000529062  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1399  sulfatase  49.07 
 
 		 670 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1979  sulfatase  47.75 
 
 		 663 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5023  sulfatase  43.23 
 
 		 646 aa  485  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0910313  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0319  sulfatase  39.97 
 
 		 646 aa  412  1e-114  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0080  sulfatase  40.54 
 
 		 634 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.204618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3723  sulfatase  33.13 
 
 		 633 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3618  sulfatase  33.54 
 
 		 633 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0526  sulfatase  31.75 
 
 		 633 aa  295  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2948  hypothetical protein  31.33 
 
 		 633 aa  290  4e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.146367  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4499  sulfatase  32.39 
 
 		 649 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000368912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3858  sulfatase  34.23 
 
 		 647 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.499421  normal  0.910234 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1405  sulfatase  34.12 
 
 		 712 aa  270  5.9999999999999995e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1625  sulfatase  30.17 
 
 		 635 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413884  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0320  sulfatase  30.49 
 
 		 640 aa  266  1e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2475  sulfatase  31.77 
 
 		 652 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84195 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1932  sulfatase  30.93 
 
 		 666 aa  261  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3051  sulfatase  28.46 
 
 		 652 aa  260  7e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.535064  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1753  sulfatase  31.45 
 
 		 696 aa  258  2e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.100359  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4465  sulfatase  30.69 
 
 		 656 aa  242  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2881  sulfatase  30.05 
 
 		 712 aa  241  2.9999999999999997e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4881  sulfatase  28.14 
 
 		 695 aa  231  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.652285 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1118  sulfatase  30.09 
 
 		 628 aa  229  2e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3537  sulfatase  28.44 
 
 		 650 aa  226  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42670  hypothetical protein  27.83 
 
 		 700 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0140  hypothetical protein  28.88 
 
 		 633 aa  219  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.597793  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4108  sulfatase  26.52 
 
 		 697 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25880  Sulfatase protein  29.28 
 
 		 717 aa  212  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3581  hypothetical protein  27.98 
 
 		 700 aa  212  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.377432  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1447  sulfatase  26.24 
 
 		 690 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.189062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3872  sulfatase  28.14 
 
 		 685 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292904  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1838  hypothetical protein  27.94 
 
 		 685 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.8565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1416  sulfatase  27.89 
 
 		 685 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.934087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0445  sulfatase  28.6 
 
 		 611 aa  196  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1865  sulfatase  27.27 
 
 		 695 aa  194  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119974  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2056  hypothetical protein  27.6 
 
 		 695 aa  191  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.814835  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2021  hypothetical protein  25.53 
 
 		 643 aa  169  1e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.112326 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2974  hypothetical protein  29.01 
 
 		 550 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2548  sulfatase  26.95 
 
 		 621 aa  160  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1736  sulfatase  28.4 
 
 		 597 aa  159  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2377  sulfatase  25.22 
 
 		 643 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1564  hypothetical protein  26.67 
 
 		 651 aa  131  4.0000000000000003e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1899  sulfatase family protein  26.68 
 
 		 677 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3506  sulfatase  26.17 
 
 		 677 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.633638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1848  sulfatase  23.81 
 
 		 645 aa  124  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3271  sulfatase  23.34 
 
 		 642 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.269035 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0309  sulfatase  29.24 
 
 		 630 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1069  sulfatase  27.99 
 
 		 641 aa  110  9.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1353  sulfatase  25.45 
 
 		 639 aa  104  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3855  sulfatase  23.43 
 
 		 666 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.593214  normal  0.690048 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0377  sulfatase  26.92 
 
 		 671 aa  96.3  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000264889  hitchhiker  0.0000000000000148489 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1996  sulphatase  23.46 
 
 		 628 aa  93.6  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.745737 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0174  sulfatase  24.29 
 
 		 630 aa  90.5  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.326693  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0062  sulfatase  25.85 
 
 		 629 aa  88.2  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000880147  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0371  sulfatase  25.39 
 
 		 625 aa  84.3  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000394083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1538  sulfatase  23.04 
 
 		 628 aa  84.3  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0584  sulfatase family protein  25.89 
 
 		 602 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0570  sulfatase family protein  25.89 
 
 		 602 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1131  sulfatase  24.13 
 
 		 593 aa  82.4  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1576  sulfatase  22.76 
 
 		 628 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0999  sulfatase  25.16 
 
 		 593 aa  81.6  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.477664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1434  sulfatase  22.73 
 
 		 639 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.511966  normal  0.0230537 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0182  sulfatase  24.4 
 
 		 653 aa  80.5  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3211  sulfatase  24.6 
 
 		 612 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139741  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1557  putative phosphoglycerol transferase I (phosphatidylglycerol--membrane-oligosaccharide glycerophosphotransferase)  26.73 
 
 		 432 aa  80.1  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3535  sulfatase  23.08 
 
 		 639 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.009662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3864  sulfatase  22.42 
 
 		 639 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00973329  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3797  sulfatase  22.8 
 
 		 639 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000542687  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1300  sulfatase; phosphoglycerol transferase  22.49 
 
 		 628 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3804  sulfatase  22.49 
 
 		 639 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00040285  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1066  sulfatase  23.74 
 
 		 651 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3608  sulfatase  22.42 
 
 		 639 aa  79  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3505  sulfatase  22.42 
 
 		 639 aa  79  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000809194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1301  sulfatase; phosphoglycerol transferase  22.22 
 
 		 628 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3895  sulfatase  22.42 
 
 		 639 aa  79  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60461  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3776  sulfatase  22.42 
 
 		 639 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000208589 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1327  sulfatase  22.22 
 
 		 628 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3517  sulfatase  22.42 
 
 		 639 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1436  sulfatase  22.22 
 
 		 628 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.567309  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1100  sulfatase  25.16 
 
 		 609 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>