240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1865 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1838  hypothetical protein  71.84 
 
 
685 aa  1032    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.8565  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2974  hypothetical protein  61.87 
 
 
550 aa  666    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1416  sulfatase  72.57 
 
 
685 aa  1040    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.934087  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2056  hypothetical protein  96.69 
 
 
695 aa  1363    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.814835  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1447  sulfatase  72.67 
 
 
690 aa  1040    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.189062 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1865  sulfatase  100 
 
 
695 aa  1433    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119974  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4108  sulfatase  77.59 
 
 
697 aa  1120    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3581  hypothetical protein  73.72 
 
 
700 aa  1022    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.377432  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25880  Sulfatase protein  63.33 
 
 
717 aa  856    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42670  hypothetical protein  73.35 
 
 
700 aa  1027    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3872  sulfatase  71.99 
 
 
685 aa  1036    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292904  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3562  sulfatase  28.83 
 
 
682 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0240  sulfatase  28.37 
 
 
678 aa  212  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0174  sulfatase  27.79 
 
 
670 aa  210  8e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4628  sulfatase  28.25 
 
 
660 aa  207  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3884  sulfatase  27.75 
 
 
654 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3456  sulfatase  28.85 
 
 
657 aa  205  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383156  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3507  sulfatase  28.35 
 
 
646 aa  204  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1399  sulfatase  28.74 
 
 
670 aa  204  6e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3808  sulfatase  27.27 
 
 
654 aa  204  6e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5023  sulfatase  29.39 
 
 
646 aa  200  6e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0910313  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4012  sulfatase  28.14 
 
 
654 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1915  sulfatase  27.32 
 
 
654 aa  198  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256965  normal  0.471265 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4129  sulfatase  27.46 
 
 
654 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3803  sulfatase  27.15 
 
 
654 aa  196  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4881  sulfatase  28.76 
 
 
695 aa  195  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.652285 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4333  sulfatase  27.46 
 
 
654 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4201  sulfatase  27.46 
 
 
654 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000207245  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0377  sulfatase  26.58 
 
 
671 aa  194  4e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000264889  hitchhiker  0.0000000000000148489 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0138  sulfatase  27.14 
 
 
654 aa  194  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000529062  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0432  phosphoglycerol transferase  28.21 
 
 
653 aa  193  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0154  sulfatase  27.19 
 
 
656 aa  193  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3632  sulfatase  26.27 
 
 
662 aa  192  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2716  sulfatase domain-containing protein  28.03 
 
 
665 aa  191  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.324091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1625  sulfatase  25.51 
 
 
635 aa  189  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413884  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4499  sulfatase  27.26 
 
 
649 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000368912 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0526  sulfatase  25.99 
 
 
633 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3618  sulfatase  28.19 
 
 
633 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3723  sulfatase  27.87 
 
 
633 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003619  phosphoglycerol transferase I  27.41 
 
 
649 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878946  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02464  phosphoglycerol transferase  27.71 
 
 
645 aa  180  9e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2948  hypothetical protein  28.38 
 
 
633 aa  179  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.146367  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0320  sulfatase  25.68 
 
 
640 aa  177  6e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3051  sulfatase  25.16 
 
 
652 aa  176  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.535064  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1979  sulfatase  27.59 
 
 
663 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1899  sulfatase family protein  26.77 
 
 
677 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1932  sulfatase  26.24 
 
 
666 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2548  sulfatase  25.26 
 
 
621 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3858  sulfatase  27.58 
 
 
647 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.499421  normal  0.910234 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3506  sulfatase  26.68 
 
 
677 aa  169  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.633638  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1118  sulfatase  28.78 
 
 
628 aa  168  2.9999999999999998e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0445  sulfatase  25.16 
 
 
611 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2475  sulfatase  28.6 
 
 
652 aa  165  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84195 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1753  sulfatase  27.8 
 
 
696 aa  162  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.100359  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0319  sulfatase  26.59 
 
 
646 aa  161  3e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4465  sulfatase  27.78 
 
 
656 aa  158  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2881  sulfatase  24.46 
 
 
712 aa  155  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242387  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1405  sulfatase  27.46 
 
 
712 aa  152  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3537  sulfatase  22.93 
 
 
650 aa  151  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0080  sulfatase  25.44 
 
 
634 aa  150  9e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.204618  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0140  hypothetical protein  25.7 
 
 
633 aa  140  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.597793  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1996  sulphatase  25.5 
 
 
628 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.745737 
 
 
-
 
NC_002950  PG1564  hypothetical protein  25.95 
 
 
651 aa  134  5e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1848  sulfatase  23.5 
 
 
645 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1736  sulfatase  24.11 
 
 
597 aa  130  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2377  sulfatase  24.23 
 
 
643 aa  130  8.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3855  sulfatase  24.18 
 
 
666 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.593214  normal  0.690048 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3271  sulfatase  22.95 
 
 
642 aa  121  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.269035 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0309  sulfatase  26.55 
 
 
630 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1069  sulfatase  23.63 
 
 
641 aa  114  5e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5024  sulfatase  26.77 
 
 
642 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00083521  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2021  hypothetical protein  23.3 
 
 
643 aa  112  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.112326 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5348  sulfatase  27.08 
 
 
642 aa  112  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000124675  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4928  sulfatase  26.46 
 
 
642 aa  112  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5404  sulfatase  27.08 
 
 
642 aa  112  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000849395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4913  sulfatase  26.46 
 
 
642 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000919892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5321  sulfatase  26.46 
 
 
642 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.10214e-55 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5081  sulfatase  26.46 
 
 
642 aa  111  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140992  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5470  sulfatase  26.46 
 
 
642 aa  111  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000729601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5353  sulfatase  26.46 
 
 
642 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171789  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5606  sulfatase  26.15 
 
 
642 aa  109  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000063545  unclonable  7.68096e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3864  sulfatase  27.48 
 
 
639 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00973329  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3766  sulfatase  27.08 
 
 
642 aa  108  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000560432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1434  sulfatase  27.16 
 
 
639 aa  107  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.511966  normal  0.0230537 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0174  sulfatase  28.31 
 
 
630 aa  107  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.326693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3804  sulfatase  26.67 
 
 
639 aa  107  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00040285  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3608  sulfatase  26.84 
 
 
639 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3505  sulfatase  26.77 
 
 
639 aa  106  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000809194  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3895  sulfatase  26.84 
 
 
639 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60461  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3776  sulfatase  26.84 
 
 
639 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000208589 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3535  sulfatase  27.16 
 
 
639 aa  106  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.009662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3797  sulfatase  26.38 
 
 
639 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000542687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3517  sulfatase  26.52 
 
 
639 aa  104  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1353  sulfatase  23.37 
 
 
639 aa  104  6e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1028  sulfatase  29.2 
 
 
640 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0869325  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0043  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  27.6 
 
 
732 aa  102  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0999  sulfatase  27.16 
 
 
593 aa  101  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.477664  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1131  sulfatase  26.09 
 
 
593 aa  100  8e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1301  sulfatase; phosphoglycerol transferase  26.11 
 
 
628 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1508  sulfatase  26.11 
 
 
628 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>