79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0121 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0121  hypothetical protein  100 
 
 
521 aa  1058    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1492  Phosphatidylglycerol--membrane- oligosaccharidegl ycerophosphotransferase  27.18 
 
 
645 aa  130  8.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0261447  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0665  putative sulfatase family protein  27.09 
 
 
453 aa  129  2.0000000000000002e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.144816  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0010  phosphatidylglycerol--membrane-oligosaccharide glycerophosphotransferase  25.85 
 
 
489 aa  103  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3126  phosphoglycerol transferase I  26.03 
 
 
767 aa  100  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3638  Phosphatidylglycerol--membrane-oligosaccharide glycerophosphotransferase  26.96 
 
 
763 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0992384  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04202  hypothetical protein  26.96 
 
 
763 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0547551  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5872  phosphoglycerol transferase I  26.96 
 
 
763 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.454334  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4904  phosphoglycerol transferase I  26.96 
 
 
763 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0182447  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4952  phosphoglycerol transferase I  26.96 
 
 
763 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000305013  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04236  phosphoglycerol transferase I  26.96 
 
 
763 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0598672  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4591  phosphoglycerol transferase I  26.96 
 
 
763 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000704227  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3696  phosphoglycerol transferase I  26.96 
 
 
763 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0500697  hitchhiker  0.00693323 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4899  phosphoglycerol transferase I  26.96 
 
 
763 aa  95.1  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.309002  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3757  phosphoglycerol transferase I  26.09 
 
 
701 aa  93.2  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3516  phosphoglycerol transferase I  24.32 
 
 
738 aa  92.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0478646 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4949  phosphoglycerol transferase I  26.09 
 
 
763 aa  91.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4896  phosphoglycerol transferase I  26.09 
 
 
763 aa  91.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4795  phosphoglycerol transferase I  26.09 
 
 
763 aa  91.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.552805  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4955  phosphoglycerol transferase I  26.09 
 
 
763 aa  91.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.122981  normal  0.467109 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4862  phosphoglycerol transferase I  26.09 
 
 
763 aa  91.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0240  sulfatase  23.14 
 
 
678 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0514  phosphoglycerol transferase I  24.79 
 
 
765 aa  85.5  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00200662 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003619  phosphoglycerol transferase I  24.77 
 
 
649 aa  82  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878946  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3803  sulfatase  22.96 
 
 
654 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3562  sulfatase  23.61 
 
 
682 aa  79  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3884  sulfatase  23.5 
 
 
654 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4628  sulfatase  23.31 
 
 
660 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3808  sulfatase  22.95 
 
 
654 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4129  sulfatase  22.68 
 
 
654 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4201  sulfatase  23.22 
 
 
654 aa  77  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000207245  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4333  sulfatase  22.68 
 
 
654 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0138  sulfatase  22.68 
 
 
654 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000529062  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0174  sulfatase  22.5 
 
 
670 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3507  sulfatase  21.63 
 
 
646 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2716  sulfatase domain-containing protein  25.83 
 
 
665 aa  75.9  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.324091  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3632  sulfatase  24.36 
 
 
662 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02464  phosphoglycerol transferase  23.68 
 
 
645 aa  74.7  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0154  sulfatase  23.51 
 
 
656 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2881  sulfatase  22.89 
 
 
712 aa  71.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242387  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0432  phosphoglycerol transferase  22.57 
 
 
653 aa  68.6  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5023  sulfatase  23.75 
 
 
646 aa  67.4  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0910313  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4012  sulfatase  22.68 
 
 
654 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3456  sulfatase  22.84 
 
 
657 aa  65.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383156  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0319  sulfatase  23.03 
 
 
646 aa  65.9  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1915  sulfatase  22.09 
 
 
654 aa  63.9  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256965  normal  0.471265 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1557  putative phosphoglycerol transferase I (phosphatidylglycerol--membrane-oligosaccharide glycerophosphotransferase)  21.5 
 
 
432 aa  63.9  0.000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1979  sulfatase  22.46 
 
 
663 aa  62  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0140  hypothetical protein  22.62 
 
 
633 aa  61.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.597793  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1753  sulfatase  24.92 
 
 
696 aa  60.5  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.100359  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0526  sulfatase  22.91 
 
 
633 aa  59.3  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1118  sulfatase  21.32 
 
 
628 aa  58.2  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2377  sulfatase  24.39 
 
 
643 aa  57.8  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4465  sulfatase  20.82 
 
 
656 aa  57.4  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1405  sulfatase  21.33 
 
 
712 aa  55.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1399  sulfatase  24.04 
 
 
670 aa  54.3  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3723  sulfatase  22.09 
 
 
633 aa  54.3  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1996  sulphatase  24.26 
 
 
628 aa  53.9  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.745737 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3618  sulfatase  21.8 
 
 
633 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4881  sulfatase  22.15 
 
 
695 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.652285 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1028  sulfatase  21.67 
 
 
640 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0869325  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4499  sulfatase  23.53 
 
 
649 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000368912 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1625  sulfatase  20.99 
 
 
635 aa  50.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413884  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0565  sulfatase  27.54 
 
 
581 aa  50.8  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0377  sulfatase  23.32 
 
 
671 aa  50.1  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000264889  hitchhiker  0.0000000000000148489 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2548  sulfatase  29.27 
 
 
621 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3537  sulfatase  21.04 
 
 
650 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3051  sulfatase  20.16 
 
 
652 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.535064  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2021  hypothetical protein  25 
 
 
643 aa  48.5  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.112326 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0080  sulfatase  21.3 
 
 
634 aa  47.8  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.204618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3207  sulfatase  28.42 
 
 
595 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.803481  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1736  sulfatase  23.08 
 
 
597 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0309  sulfatase  26.01 
 
 
630 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2948  hypothetical protein  21.36 
 
 
633 aa  45.4  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.146367  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0445  sulfatase  22.78 
 
 
611 aa  44.3  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2475  sulfatase  23.83 
 
 
652 aa  44.3  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1865  sulfatase  26.02 
 
 
695 aa  44.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119974  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25880  Sulfatase protein  25.15 
 
 
717 aa  43.9  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1353  sulfatase  26.99 
 
 
639 aa  43.9  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>