94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3126 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4949  phosphoglycerol transferase I  54.28 
 
 
763 aa  840    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0514  phosphoglycerol transferase I  54.21 
 
 
765 aa  862    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00200662 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4591  phosphoglycerol transferase I  54.94 
 
 
763 aa  852    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000704227  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4952  phosphoglycerol transferase I  54.81 
 
 
763 aa  847    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000305013  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3126  phosphoglycerol transferase I  100 
 
 
767 aa  1574    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3696  phosphoglycerol transferase I  54.68 
 
 
763 aa  846    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0500697  hitchhiker  0.00693323 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4904  phosphoglycerol transferase I  54.68 
 
 
763 aa  847    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0182447  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4899  phosphoglycerol transferase I  54.81 
 
 
763 aa  852    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.309002  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4896  phosphoglycerol transferase I  54.28 
 
 
763 aa  838    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4795  phosphoglycerol transferase I  54.28 
 
 
763 aa  839    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.552805  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4862  phosphoglycerol transferase I  54.28 
 
 
763 aa  838    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4955  phosphoglycerol transferase I  54.55 
 
 
763 aa  842    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.122981  normal  0.467109 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5872  phosphoglycerol transferase I  54.68 
 
 
763 aa  848    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.454334  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04202  hypothetical protein  54.81 
 
 
763 aa  850    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0547551  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3638  Phosphatidylglycerol--membrane-oligosaccharide glycerophosphotransferase  54.81 
 
 
763 aa  850    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0992384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04236  phosphoglycerol transferase I  54.81 
 
 
763 aa  850    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0598672  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1492  Phosphatidylglycerol--membrane- oligosaccharidegl ycerophosphotransferase  38.41 
 
 
645 aa  362  2e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0261447  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3757  phosphoglycerol transferase I  38.72 
 
 
701 aa  261  3e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0010  phosphatidylglycerol--membrane-oligosaccharide glycerophosphotransferase  28.57 
 
 
489 aa  196  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3516  phosphoglycerol transferase I  32.47 
 
 
738 aa  186  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0478646 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1557  putative phosphoglycerol transferase I (phosphatidylglycerol--membrane-oligosaccharide glycerophosphotransferase)  32 
 
 
432 aa  159  1e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0665  putative sulfatase family protein  28.24 
 
 
453 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.144816  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2284  putative carbohydrate translocase  44.54 
 
 
773 aa  107  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0121  hypothetical protein  25.81 
 
 
521 aa  106  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02464  phosphoglycerol transferase  25.85 
 
 
645 aa  77.8  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3537  sulfatase  27.02 
 
 
650 aa  76.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003619  phosphoglycerol transferase I  25.37 
 
 
649 aa  73.6  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878946  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2768  sulfatase  25.49 
 
 
731 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.518041  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2929  sulfatase  26.88 
 
 
733 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0161141  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1979  sulfatase  23.44 
 
 
663 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0565  sulfatase  24.73 
 
 
581 aa  67.4  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3632  sulfatase  25 
 
 
662 aa  67  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3456  sulfatase  25.1 
 
 
657 aa  66.2  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383156  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2852  sulfatase domain-containing protein  26.88 
 
 
733 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2837  sulfatase  26.95 
 
 
733 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5023  sulfatase  22.95 
 
 
646 aa  62  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0910313  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0240  sulfatase  22.9 
 
 
678 aa  61.6  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1996  sulphatase  24.43 
 
 
628 aa  61.2  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.745737 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0854  sulfatase  25.53 
 
 
672 aa  61.2  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10410  Sulfatase  25.13 
 
 
729 aa  60.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1625  sulfatase  26.94 
 
 
635 aa  59.3  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413884  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3507  sulfatase  23.87 
 
 
646 aa  58.9  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0174  sulfatase  23.18 
 
 
670 aa  58.5  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3562  sulfatase  23.3 
 
 
682 aa  57.8  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4465  sulfatase  24.92 
 
 
656 aa  57.8  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49940  hypothetical protein  26.2 
 
 
774 aa  57  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.278868 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0140  hypothetical protein  23.71 
 
 
633 aa  57  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.597793  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1915  sulfatase  23.71 
 
 
654 aa  56.2  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256965  normal  0.471265 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3884  sulfatase  23.36 
 
 
654 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0432  phosphoglycerol transferase  26.45 
 
 
653 aa  55.5  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0154  sulfatase  23.36 
 
 
656 aa  55.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2203  sulfatase  23.64 
 
 
736 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4254  hypothetical protein  25.13 
 
 
774 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0478454  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3808  sulfatase  23.03 
 
 
654 aa  54.7  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3803  sulfatase  24.53 
 
 
654 aa  54.7  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2548  sulfatase  25.4 
 
 
621 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40416  predicted protein  23.17 
 
 
700 aa  53.5  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0080  sulfatase  24.43 
 
 
634 aa  53.1  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.204618  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3051  sulfatase  25.26 
 
 
652 aa  53.5  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.535064  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25880  Sulfatase protein  22.43 
 
 
717 aa  53.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0662  sulfatase  24.34 
 
 
630 aa  53.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3858  sulfatase  25.35 
 
 
647 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.499421  normal  0.910234 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4012  sulfatase  23.68 
 
 
654 aa  52.8  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4129  sulfatase  22.7 
 
 
654 aa  52.8  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49659  predicted protein  22.51 
 
 
629 aa  52.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4333  sulfatase  22.7 
 
 
654 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4201  sulfatase  22.7 
 
 
654 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000207245  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0138  sulfatase  22.7 
 
 
654 aa  52.4  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000529062  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1405  sulfatase  26.86 
 
 
712 aa  52  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0445  sulfatase  21.19 
 
 
611 aa  51.6  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07229  sulfatase domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G17610)  22.75 
 
 
925 aa  51.6  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0143959  normal  0.252406 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0320  sulfatase  25.91 
 
 
640 aa  51.6  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1753  sulfatase  24.75 
 
 
696 aa  51.6  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.100359  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4628  sulfatase  22.37 
 
 
660 aa  50.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1399  sulfatase  23.58 
 
 
670 aa  50.4  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4499  sulfatase  24.8 
 
 
649 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000368912 
 
 
-
 
NC_002950  PG1564  hypothetical protein  26 
 
 
651 aa  50.1  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2377  sulfatase  23.46 
 
 
643 aa  48.1  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1353  sulfatase  21.99 
 
 
639 aa  47.8  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0319  sulfatase  23.3 
 
 
646 aa  47.8  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3872  sulfatase  25.16 
 
 
685 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292904  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2974  hypothetical protein  25.49 
 
 
550 aa  47  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0062  sulfatase  25.49 
 
 
629 aa  47  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000880147  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1447  sulfatase  23.29 
 
 
690 aa  47  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.189062 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1736  sulfatase  23.08 
 
 
597 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3723  sulfatase  24.41 
 
 
633 aa  46.6  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1416  sulfatase  24.67 
 
 
685 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.934087  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2716  sulfatase domain-containing protein  21.69 
 
 
665 aa  46.6  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.324091  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1838  hypothetical protein  24.67 
 
 
685 aa  46.2  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.8565  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3618  sulfatase  21.82 
 
 
633 aa  45.8  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0165  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  24.02 
 
 
727 aa  45.4  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2948  hypothetical protein  21.65 
 
 
633 aa  45.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.146367  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0526  sulfatase  20.94 
 
 
633 aa  44.7  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1100  sulfatase  24.71 
 
 
609 aa  44.3  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>