201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2203 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4254  hypothetical protein  61.36 
 
 
774 aa  845    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0478454  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2852  sulfatase domain-containing protein  70.78 
 
 
733 aa  1049    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10410  Sulfatase  72.33 
 
 
729 aa  1065    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2203  sulfatase  100 
 
 
736 aa  1509    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49940  hypothetical protein  61.58 
 
 
774 aa  843    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.278868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2929  sulfatase  70.04 
 
 
733 aa  1009    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0161141  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2837  sulfatase  70.6 
 
 
733 aa  1033    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2768  sulfatase  67.72 
 
 
731 aa  988    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.518041  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0140  hypothetical protein  26.43 
 
 
633 aa  91.3  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.597793  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2377  sulfatase  24.13 
 
 
643 aa  87.4  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3757  phosphoglycerol transferase I  29.3 
 
 
701 aa  85.5  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3858  sulfatase  22.78 
 
 
647 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.499421  normal  0.910234 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4499  sulfatase  21.96 
 
 
649 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000368912 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1399  sulfatase  23.46 
 
 
670 aa  78.6  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1996  sulphatase  25.62 
 
 
628 aa  76.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.745737 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02464  phosphoglycerol transferase  21.33 
 
 
645 aa  75.1  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0154  sulfatase  21.31 
 
 
656 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1538  sulfatase  23.72 
 
 
628 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1327  sulfatase  23.72 
 
 
628 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1300  sulfatase; phosphoglycerol transferase  22.3 
 
 
628 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1301  sulfatase; phosphoglycerol transferase  23.72 
 
 
628 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1436  sulfatase  23.72 
 
 
628 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.567309  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0174  sulfatase  21.9 
 
 
670 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0445  sulfatase  21.15 
 
 
611 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2881  sulfatase  23.63 
 
 
712 aa  73.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1508  sulfatase  23.72 
 
 
628 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221211 
 
 
-
 
NC_002950  PG2021  hypothetical protein  24.24 
 
 
643 aa  72.4  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.112326 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1576  sulfatase  22.3 
 
 
628 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1625  sulfatase  21.36 
 
 
635 aa  72  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413884  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1915  sulfatase  20.77 
 
 
654 aa  72  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256965  normal  0.471265 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3562  sulfatase  21.34 
 
 
682 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0854  sulfatase  22.93 
 
 
672 aa  71.2  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1979  sulfatase  20.89 
 
 
663 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3874  sulfatase  23.32 
 
 
628 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.295207 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1139  sulfatase  22 
 
 
628 aa  71.2  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3507  sulfatase  22.91 
 
 
646 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2716  sulfatase domain-containing protein  20.92 
 
 
665 aa  70.1  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.324091  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1470  sulfatase  23.32 
 
 
628 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1340  sulfatase  23.32 
 
 
628 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.5616  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003619  phosphoglycerol transferase I  21.36 
 
 
649 aa  70.5  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878946  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1015  sulfatase  27.16 
 
 
588 aa  70.1  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0240  sulfatase  20.74 
 
 
678 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0999  sulfatase  23.32 
 
 
593 aa  69.3  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.477664  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1492  Phosphatidylglycerol--membrane- oligosaccharidegl ycerophosphotransferase  22.62 
 
 
645 aa  69.3  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0261447  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3505  sulfatase  21.09 
 
 
639 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000809194  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1131  sulfatase  24.6 
 
 
593 aa  68.2  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3855  sulfatase  29.94 
 
 
666 aa  68.2  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.593214  normal  0.690048 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0432  phosphoglycerol transferase  20.98 
 
 
653 aa  67.8  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0138  sulfatase  22.32 
 
 
654 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000529062  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04236  phosphoglycerol transferase I  27.06 
 
 
763 aa  67.4  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0598672  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3638  Phosphatidylglycerol--membrane-oligosaccharide glycerophosphotransferase  27.06 
 
 
763 aa  67.4  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0992384  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4129  sulfatase  22.22 
 
 
654 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4591  phosphoglycerol transferase I  27.06 
 
 
763 aa  67.4  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000704227  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04202  hypothetical protein  27.06 
 
 
763 aa  67.4  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0547551  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4899  phosphoglycerol transferase I  27.06 
 
 
763 aa  67.4  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.309002  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1586  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  29.22 
 
 
689 aa  67.4  0.0000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0888013  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5872  phosphoglycerol transferase I  27.06 
 
 
763 aa  67.4  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.454334  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3696  phosphoglycerol transferase I  27.06 
 
 
763 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0500697  hitchhiker  0.00693323 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4955  phosphoglycerol transferase I  27.23 
 
 
763 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.122981  normal  0.467109 
 
 
-
 
NC_002950  PG1564  hypothetical protein  24.07 
 
 
651 aa  67  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0379  sulfatase family protein  22.92 
 
 
646 aa  66.6  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4949  phosphoglycerol transferase I  27.23 
 
 
763 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4795  phosphoglycerol transferase I  27.23 
 
 
763 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.552805  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3884  sulfatase  21.75 
 
 
654 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1353  sulfatase  22.48 
 
 
639 aa  67  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4862  phosphoglycerol transferase I  27.23 
 
 
763 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2475  sulfatase  22.87 
 
 
652 aa  67  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84195 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4896  phosphoglycerol transferase I  27.23 
 
 
763 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0742  sulfatase  23.32 
 
 
646 aa  66.6  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0759  sulfatase  23.32 
 
 
646 aa  66.6  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4952  phosphoglycerol transferase I  27.06 
 
 
763 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000305013  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4904  phosphoglycerol transferase I  27.06 
 
 
763 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0182447  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3608  sulfatase  20.93 
 
 
639 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3895  sulfatase  20.93 
 
 
639 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60461  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4881  sulfatase  22.6 
 
 
695 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.652285 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5024  sulfatase  22.31 
 
 
642 aa  66.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00083521  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0182  sulfatase  24.28 
 
 
653 aa  66.6  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4333  sulfatase  22.41 
 
 
654 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3632  sulfatase  20.7 
 
 
662 aa  66.6  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1434  sulfatase  20.99 
 
 
639 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.511966  normal  0.0230537 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1066  sulfatase  22.9 
 
 
651 aa  65.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3776  sulfatase  20.93 
 
 
639 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000208589 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4928  sulfatase  21.51 
 
 
642 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5081  sulfatase  21.12 
 
 
642 aa  65.1  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140992  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5321  sulfatase  21.12 
 
 
642 aa  65.1  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.10214e-55 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4913  sulfatase  21.12 
 
 
642 aa  65.1  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000919892  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5470  sulfatase  21.12 
 
 
642 aa  65.1  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000729601  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3766  sulfatase  22.41 
 
 
642 aa  65.1  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000560432  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3803  sulfatase  20.06 
 
 
654 aa  65.1  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5606  sulfatase  21.18 
 
 
642 aa  64.7  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000063545  unclonable  7.68096e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5348  sulfatase  21.12 
 
 
642 aa  64.3  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000124675  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5353  sulfatase  21.18 
 
 
642 aa  64.3  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171789  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5404  sulfatase  21.12 
 
 
642 aa  64.3  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000849395  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3535  sulfatase  21.39 
 
 
639 aa  64.3  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.009662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3797  sulfatase  20.28 
 
 
639 aa  63.9  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000542687  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4201  sulfatase  20.63 
 
 
654 aa  64.3  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000207245  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1932  sulfatase  21.1 
 
 
666 aa  63.9  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3804  sulfatase  20.37 
 
 
639 aa  63.9  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00040285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3517  sulfatase  20.57 
 
 
639 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3808  sulfatase  21.66 
 
 
654 aa  63.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.062671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>