129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_04236 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04236  phosphoglycerol transferase I  100 
 
 
763 aa  1581    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0598672  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3638  Phosphatidylglycerol--membrane-oligosaccharide glycerophosphotransferase  100 
 
 
763 aa  1581    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0992384  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04202  hypothetical protein  100 
 
 
763 aa  1581    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0547551  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0514  phosphoglycerol transferase I  85.06 
 
 
765 aa  1360    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00200662 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4591  phosphoglycerol transferase I  99.87 
 
 
763 aa  1578    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000704227  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4952  phosphoglycerol transferase I  99.61 
 
 
763 aa  1574    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000305013  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3126  phosphoglycerol transferase I  54.81 
 
 
767 aa  849    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3696  phosphoglycerol transferase I  99.34 
 
 
763 aa  1571    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0500697  hitchhiker  0.00693323 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4904  phosphoglycerol transferase I  99.61 
 
 
763 aa  1575    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0182447  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4899  phosphoglycerol transferase I  99.74 
 
 
763 aa  1576    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.309002  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4896  phosphoglycerol transferase I  92.4 
 
 
763 aa  1436    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4949  phosphoglycerol transferase I  92.26 
 
 
763 aa  1435    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4795  phosphoglycerol transferase I  92.27 
 
 
763 aa  1437    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.552805  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4862  phosphoglycerol transferase I  92.4 
 
 
763 aa  1437    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4955  phosphoglycerol transferase I  91.86 
 
 
763 aa  1431    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.122981  normal  0.467109 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5872  phosphoglycerol transferase I  99.74 
 
 
763 aa  1576    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.454334  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1492  Phosphatidylglycerol--membrane- oligosaccharidegl ycerophosphotransferase  34.26 
 
 
645 aa  340  5.9999999999999996e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0261447  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3757  phosphoglycerol transferase I  35.32 
 
 
701 aa  278  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0010  phosphatidylglycerol--membrane-oligosaccharide glycerophosphotransferase  32.82 
 
 
489 aa  212  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3516  phosphoglycerol transferase I  30.31 
 
 
738 aa  190  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0478646 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1557  putative phosphoglycerol transferase I (phosphatidylglycerol--membrane-oligosaccharide glycerophosphotransferase)  34.08 
 
 
432 aa  170  1e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0121  hypothetical protein  26.96 
 
 
521 aa  95.5  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0665  putative sulfatase family protein  26.33 
 
 
453 aa  95.5  3e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.144816  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2284  putative carbohydrate translocase  33.33 
 
 
773 aa  93.6  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02464  phosphoglycerol transferase  25.36 
 
 
645 aa  90.1  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003619  phosphoglycerol transferase I  25.07 
 
 
649 aa  89.7  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878946  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1979  sulfatase  22.35 
 
 
663 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0565  sulfatase  27.02 
 
 
581 aa  80.9  0.00000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3562  sulfatase  25.08 
 
 
682 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3632  sulfatase  26.17 
 
 
662 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3803  sulfatase  26.33 
 
 
654 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4465  sulfatase  25.96 
 
 
656 aa  74.7  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0140  hypothetical protein  25.94 
 
 
633 aa  74.3  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.597793  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3537  sulfatase  26.39 
 
 
650 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3808  sulfatase  26.24 
 
 
654 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3884  sulfatase  26.24 
 
 
654 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25880  Sulfatase protein  26.62 
 
 
717 aa  72.8  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0174  sulfatase  23.12 
 
 
670 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0138  sulfatase  26.33 
 
 
654 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000529062  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5023  sulfatase  26.19 
 
 
646 aa  71.6  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0910313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1625  sulfatase  26.12 
 
 
635 aa  71.6  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413884  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4201  sulfatase  26.33 
 
 
654 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000207245  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4129  sulfatase  26.33 
 
 
654 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4333  sulfatase  26.33 
 
 
654 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2852  sulfatase domain-containing protein  27.17 
 
 
733 aa  70.9  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4881  sulfatase  27.53 
 
 
695 aa  70.9  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.652285 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0240  sulfatase  25.17 
 
 
678 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2929  sulfatase  26.85 
 
 
733 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0161141  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0080  sulfatase  25.44 
 
 
634 aa  68.6  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.204618  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4012  sulfatase  26.67 
 
 
654 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2837  sulfatase  26.95 
 
 
733 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0154  sulfatase  23.55 
 
 
656 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3723  sulfatase  25.91 
 
 
633 aa  67.8  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0432  phosphoglycerol transferase  24.69 
 
 
653 aa  67.4  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4628  sulfatase  25.42 
 
 
660 aa  67  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2203  sulfatase  27.06 
 
 
736 aa  67  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0526  sulfatase  26.51 
 
 
633 aa  67.4  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0319  sulfatase  23.97 
 
 
646 aa  67  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0854  sulfatase  24.7 
 
 
672 aa  67  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2948  hypothetical protein  25.7 
 
 
633 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.146367  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3456  sulfatase  23.5 
 
 
657 aa  66.6  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383156  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1996  sulphatase  25.55 
 
 
628 aa  65.5  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.745737 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49940  hypothetical protein  27.33 
 
 
774 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.278868 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3507  sulfatase  22.81 
 
 
646 aa  64.7  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4499  sulfatase  26.47 
 
 
649 aa  64.7  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000368912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3858  sulfatase  26.86 
 
 
647 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.499421  normal  0.910234 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2768  sulfatase  25 
 
 
731 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.518041  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0320  sulfatase  26.83 
 
 
640 aa  63.2  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1915  sulfatase  22.19 
 
 
654 aa  62.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256965  normal  0.471265 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1405  sulfatase  26.67 
 
 
712 aa  62.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1736  sulfatase  22.34 
 
 
597 aa  62.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42670  hypothetical protein  24.52 
 
 
700 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3581  hypothetical protein  24.52 
 
 
700 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.377432  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1399  sulfatase  24.69 
 
 
670 aa  62  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2475  sulfatase  27.05 
 
 
652 aa  62  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84195 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4254  hypothetical protein  26 
 
 
774 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0478454  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10410  Sulfatase  27.74 
 
 
729 aa  61.6  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1564  hypothetical protein  25.83 
 
 
651 aa  61.6  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2056  hypothetical protein  23.92 
 
 
695 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.814835  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3618  sulfatase  25.73 
 
 
633 aa  60.8  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1865  sulfatase  23.91 
 
 
695 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119974  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4108  sulfatase  23.74 
 
 
697 aa  57.8  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0445  sulfatase  23.85 
 
 
611 aa  57.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1753  sulfatase  25 
 
 
696 aa  56.2  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.100359  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0662  sulfatase  23.51 
 
 
630 aa  56.2  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2881  sulfatase  22.74 
 
 
712 aa  56.6  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242387  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2716  sulfatase domain-containing protein  21.58 
 
 
665 aa  55.8  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.324091  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1932  sulfatase  24.58 
 
 
666 aa  55.8  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0369  sulfatase  23.89 
 
 
628 aa  55.5  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151431  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3051  sulfatase  23.75 
 
 
652 aa  55.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.535064  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3855  sulfatase  24.84 
 
 
666 aa  55.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.593214  normal  0.690048 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2548  sulfatase  23.48 
 
 
621 aa  54.7  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2974  hypothetical protein  24.44 
 
 
550 aa  54.3  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5606  sulfatase  22.94 
 
 
642 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000063545  unclonable  7.68096e-25 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1118  sulfatase  23.72 
 
 
628 aa  53.5  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5321  sulfatase  22.48 
 
 
642 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.10214e-55 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5081  sulfatase  22.48 
 
 
642 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140992  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4928  sulfatase  22.48 
 
 
642 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5470  sulfatase  22.48 
 
 
642 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000729601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5353  sulfatase  22.94 
 
 
642 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>