219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2929 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2852  sulfatase domain-containing protein  94.13 
 
 		 733 aa  1415    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2203  sulfatase  70.07 
 
 		 736 aa  1033    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10410  Sulfatase  64.88 
 
 		 729 aa  954    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4254  hypothetical protein  60.51 
 
 		 774 aa  829    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0478454  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2929  sulfatase  100 
 
 		 733 aa  1496    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0161141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49940  hypothetical protein  61.49 
 
 		 774 aa  838    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.278868 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2837  sulfatase  94.82 
 
 		 733 aa  1407    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2768  sulfatase  82.79 
 
 		 731 aa  1226    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.518041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3757  phosphoglycerol transferase I  27.57 
 
 		 701 aa  85.1  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3562  sulfatase  25.16 
 
 		 682 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02464  phosphoglycerol transferase  21.92 
 
 		 645 aa  81.6  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0154  sulfatase  22.83 
 
 		 656 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0174  sulfatase  23.28 
 
 		 670 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2377  sulfatase  23.34 
 
 		 643 aa  80.1  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0140  hypothetical protein  24.29 
 
 		 633 aa  78.2  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.597793  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1979  sulfatase  22.6 
 
 		 663 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3632  sulfatase  22.68 
 
 		 662 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2021  hypothetical protein  26 
 
 		 643 aa  75.1  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.112326 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1131  sulfatase  22.14 
 
 		 593 aa  74.7  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4499  sulfatase  23.15 
 
 		 649 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000368912 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003619  phosphoglycerol transferase I  22.83 
 
 		 649 aa  74.3  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878946  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1736  sulfatase  21.6 
 
 		 597 aa  72.4  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0999  sulfatase  22.61 
 
 		 593 aa  73.2  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.477664  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3696  phosphoglycerol transferase I  27.24 
 
 		 763 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0500697  hitchhiker  0.00693323 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4952  phosphoglycerol transferase I  27.24 
 
 		 763 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000305013  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1399  sulfatase  23.1 
 
 		 670 aa  72  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3507  sulfatase  22.53 
 
 		 646 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1492  Phosphatidylglycerol--membrane- oligosaccharidegl ycerophosphotransferase  21.92 
 
 		 645 aa  72.4  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0261447  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4591  phosphoglycerol transferase I  27.24 
 
 		 763 aa  72  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000704227  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4899  phosphoglycerol transferase I  27.24 
 
 		 763 aa  72  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.309002  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1586  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  27.75 
 
 		 689 aa  71.6  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0888013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5872  phosphoglycerol transferase I  26.85 
 
 		 763 aa  70.5  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.454334  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04236  phosphoglycerol transferase I  26.85 
 
 		 763 aa  70.5  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0598672  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3638  Phosphatidylglycerol--membrane-oligosaccharide glycerophosphotransferase  26.85 
 
 		 763 aa  70.5  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0992384  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04202  hypothetical protein  26.85 
 
 		 763 aa  70.5  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0547551  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1915  sulfatase  24.07 
 
 		 654 aa  70.5  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256965  normal  0.471265 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3126  phosphoglycerol transferase I  26.88 
 
 		 767 aa  69.3  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4904  phosphoglycerol transferase I  26.85 
 
 		 763 aa  69.7  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0182447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2881  sulfatase  23.43 
 
 		 712 aa  69.3  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242387  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4795  phosphoglycerol transferase I  26.85 
 
 		 763 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.552805  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4955  phosphoglycerol transferase I  26.85 
 
 		 763 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.122981  normal  0.467109 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4896  phosphoglycerol transferase I  26.85 
 
 		 763 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4949  phosphoglycerol transferase I  26.85 
 
 		 763 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5023  sulfatase  21.98 
 
 		 646 aa  69.3  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0910313  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4862  phosphoglycerol transferase I  26.85 
 
 		 763 aa  68.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3884  sulfatase  20.97 
 
 		 654 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0240  sulfatase  22.05 
 
 		 678 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3456  sulfatase  23.42 
 
 		 657 aa  67.8  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0432  phosphoglycerol transferase  21.86 
 
 		 653 aa  67.8  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0445  sulfatase  21.31 
 
 		 611 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2475  sulfatase  23.51 
 
 		 652 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84195 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4333  sulfatase  21 
 
 		 654 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1118  sulfatase  23.03 
 
 		 628 aa  66.6  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4201  sulfatase  20.79 
 
 		 654 aa  66.6  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000207245  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4881  sulfatase  24.37 
 
 		 695 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.652285 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0138  sulfatase  21 
 
 		 654 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000529062  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3803  sulfatase  21.09 
 
 		 654 aa  66.2  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4129  sulfatase  21 
 
 		 654 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1066  sulfatase  23.7 
 
 		 651 aa  65.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1996  sulphatase  24.23 
 
 		 628 aa  65.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.745737 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1100  sulfatase  22.35 
 
 		 609 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109677  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1015  sulfatase  23.21 
 
 		 588 aa  64.3  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0565  sulfatase  26.01 
 
 		 581 aa  64.3  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2716  sulfatase domain-containing protein  20.28 
 
 		 665 aa  64.3  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.324091  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3505  sulfatase  20.48 
 
 		 639 aa  63.9  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000809194  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3808  sulfatase  21.59 
 
 		 654 aa  63.9  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3855  sulfatase  29.3 
 
 		 666 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.593214  normal  0.690048 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4628  sulfatase  21.01 
 
 		 660 aa  63.5  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3608  sulfatase  20.71 
 
 		 639 aa  63.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3895  sulfatase  20.71 
 
 		 639 aa  63.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60461  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3858  sulfatase  23.51 
 
 		 647 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.499421  normal  0.910234 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3776  sulfatase  20.71 
 
 		 639 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000208589 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1620  sulfatase  25.88 
 
 		 698 aa  63.5  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0182  sulfatase  24.43 
 
 		 653 aa  63.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0514  phosphoglycerol transferase I  25.88 
 
 		 765 aa  63.2  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200662 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0010  phosphatidylglycerol--membrane-oligosaccharide glycerophosphotransferase  26.64 
 
 		 489 aa  62.4  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3535  sulfatase  20.51 
 
 		 639 aa  62.4  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.009662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1434  sulfatase  20.39 
 
 		 639 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.511966  normal  0.0230537 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2012  sulfatase  23.36 
 
 		 657 aa  62  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000485706  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2835  sulfatase  25.55 
 
 		 625 aa  61.2  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.181831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3874  sulfatase  19.12 
 
 		 628 aa  61.2  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.295207 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2993  sulfatase  22.7 
 
 		 657 aa  61.2  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000444572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1470  sulfatase  19.12 
 
 		 628 aa  61.2  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2289  sulfatase  23.2 
 
 		 657 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000748062  hitchhiker  1.58706e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2951  sulfatase  23.2 
 
 		 657 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000274078  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1139  sulfatase  19.44 
 
 		 628 aa  60.8  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1508  sulfatase  19.12 
 
 		 628 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221211 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1538  sulfatase  19.12 
 
 		 628 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2987  sulfatase  22.7 
 
 		 657 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000085975  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3797  sulfatase  20.06 
 
 		 639 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000542687  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1327  sulfatase  19.12 
 
 		 628 aa  60.1  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2737  sulfatase  22.7 
 
 		 657 aa  60.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000322483  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1300  sulfatase; phosphoglycerol transferase  19.12 
 
 		 628 aa  60.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2688  phosphoglycerol transferase  22.7 
 
 		 657 aa  60.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000425258  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1301  sulfatase; phosphoglycerol transferase  19.12 
 
 		 628 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3517  sulfatase  20.06 
 
 		 639 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2947  sulfatase  22.7 
 
 		 657 aa  60.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000013293  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1576  sulfatase  19.12 
 
 		 628 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1340  sulfatase  19.12 
 
 		 628 aa  60.1  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.5616  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2946  sulfatase  22.7 
 
 		 657 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1489399999999997e-51 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>