210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2852 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4254  hypothetical protein  59.8 
 
 		 774 aa  819    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0478454  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2929  sulfatase  94.13 
 
 		 733 aa  1377    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0161141  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2852  sulfatase domain-containing protein  100 
 
 		 733 aa  1496    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10410  Sulfatase  64.74 
 
 		 729 aa  956    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2203  sulfatase  71.05 
 
 		 736 aa  1045    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49940  hypothetical protein  60.98 
 
 		 774 aa  838    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.278868 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2837  sulfatase  96.86 
 
 		 733 aa  1429    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2768  sulfatase  81.69 
 
 		 731 aa  1212    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.518041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3562  sulfatase  25.8 
 
 		 682 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0154  sulfatase  22.95 
 
 		 656 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3757  phosphoglycerol transferase I  27.27 
 
 		 701 aa  82  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0174  sulfatase  24.21 
 
 		 670 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0140  hypothetical protein  24.29 
 
 		 633 aa  79.7  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.597793  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02464  phosphoglycerol transferase  21.78 
 
 		 645 aa  79  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1736  sulfatase  22.55 
 
 		 597 aa  78.6  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2377  sulfatase  23.96 
 
 		 643 aa  77.8  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3632  sulfatase  23.94 
 
 		 662 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003619  phosphoglycerol transferase I  22.76 
 
 		 649 aa  75.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878946  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3507  sulfatase  23.31 
 
 		 646 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4499  sulfatase  23.15 
 
 		 649 aa  74.3  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000368912 
 
 
-
 
NC_002950  PG2021  hypothetical protein  26 
 
 		 643 aa  73.2  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.112326 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4952  phosphoglycerol transferase I  27.56 
 
 		 763 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000305013  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1399  sulfatase  24.42 
 
 		 670 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4591  phosphoglycerol transferase I  27.56 
 
 		 763 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000704227  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4899  phosphoglycerol transferase I  27.56 
 
 		 763 aa  72.4  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.309002  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1979  sulfatase  22.91 
 
 		 663 aa  72  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5023  sulfatase  22.71 
 
 		 646 aa  72.4  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0910313  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3696  phosphoglycerol transferase I  27.56 
 
 		 763 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0500697  hitchhiker  0.00693323 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04236  phosphoglycerol transferase I  27.17 
 
 		 763 aa  70.9  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0598672  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3638  Phosphatidylglycerol--membrane-oligosaccharide glycerophosphotransferase  27.17 
 
 		 763 aa  70.9  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0992384  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04202  hypothetical protein  27.17 
 
 		 763 aa  70.9  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0547551  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5872  phosphoglycerol transferase I  27.17 
 
 		 763 aa  70.9  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.454334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0240  sulfatase  22.05 
 
 		 678 aa  70.9  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1492  Phosphatidylglycerol--membrane- oligosaccharidegl ycerophosphotransferase  21.94 
 
 		 645 aa  70.1  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0261447  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1915  sulfatase  23.6 
 
 		 654 aa  70.5  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256965  normal  0.471265 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4904  phosphoglycerol transferase I  27.17 
 
 		 763 aa  69.7  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0182447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2881  sulfatase  21.91 
 
 		 712 aa  69.3  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242387  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0999  sulfatase  22.67 
 
 		 593 aa  69.3  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.477664  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3884  sulfatase  22.04 
 
 		 654 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1586  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  26.79 
 
 		 689 aa  69.3  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0888013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2475  sulfatase  24.31 
 
 		 652 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84195 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1100  sulfatase  22.92 
 
 		 609 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109677  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4333  sulfatase  22.38 
 
 		 654 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4129  sulfatase  22.38 
 
 		 654 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0138  sulfatase  22.38 
 
 		 654 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000529062  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3803  sulfatase  22.5 
 
 		 654 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4201  sulfatase  22.38 
 
 		 654 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000207245  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1118  sulfatase  22.32 
 
 		 628 aa  68.2  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4881  sulfatase  23.45 
 
 		 695 aa  67.8  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.652285 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1131  sulfatase  24.9 
 
 		 593 aa  67.8  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3456  sulfatase  24.05 
 
 		 657 aa  66.6  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4896  phosphoglycerol transferase I  26.67 
 
 		 763 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4795  phosphoglycerol transferase I  26.67 
 
 		 763 aa  66.6  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.552805  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4862  phosphoglycerol transferase I  26.87 
 
 		 763 aa  66.6  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4955  phosphoglycerol transferase I  26.67 
 
 		 763 aa  66.6  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.122981  normal  0.467109 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4949  phosphoglycerol transferase I  26.67 
 
 		 763 aa  66.6  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3808  sulfatase  22.22 
 
 		 654 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1066  sulfatase  24.42 
 
 		 651 aa  66.2  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0182  sulfatase  24.43 
 
 		 653 aa  65.9  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4628  sulfatase  23.05 
 
 		 660 aa  65.5  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0445  sulfatase  21.31 
 
 		 611 aa  65.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0432  phosphoglycerol transferase  21.72 
 
 		 653 aa  65.9  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3858  sulfatase  23.44 
 
 		 647 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.499421  normal  0.910234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0565  sulfatase  26.79 
 
 		 581 aa  65.5  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3126  phosphoglycerol transferase I  26.88 
 
 		 767 aa  65.1  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3537  sulfatase  21.46 
 
 		 650 aa  64.3  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1996  sulphatase  22.34 
 
 		 628 aa  64.7  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.745737 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3855  sulfatase  29.3 
 
 		 666 aa  63.9  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.593214  normal  0.690048 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3776  sulfatase  20.26 
 
 		 639 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000208589 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2716  sulfatase domain-containing protein  19.83 
 
 		 665 aa  62.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.324091  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3505  sulfatase  20.26 
 
 		 639 aa  62.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000809194  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1015  sulfatase  22.51 
 
 		 588 aa  62.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2012  sulfatase  23.84 
 
 		 657 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000485706  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1932  sulfatase  22.98 
 
 		 666 aa  62.4  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3608  sulfatase  20.26 
 
 		 639 aa  62.4  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2993  sulfatase  23.18 
 
 		 657 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000444572  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3895  sulfatase  20.26 
 
 		 639 aa  62.4  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60461  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2289  sulfatase  23.68 
 
 		 657 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000748062  hitchhiker  1.58706e-23 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0514  phosphoglycerol transferase I  25.39 
 
 		 765 aa  62.4  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200662 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2951  sulfatase  23.68 
 
 		 657 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000274078  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2987  sulfatase  23.18 
 
 		 657 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000085975  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2835  sulfatase  26.46 
 
 		 625 aa  61.6  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.181831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1620  sulfatase  25 
 
 		 698 aa  61.6  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2946  sulfatase  23.18 
 
 		 657 aa  61.6  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1489399999999997e-51 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2737  sulfatase  23.18 
 
 		 657 aa  61.6  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000322483  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2688  phosphoglycerol transferase  23.18 
 
 		 657 aa  61.6  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000425258  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2947  sulfatase  23.18 
 
 		 657 aa  61.6  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000013293  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1470  sulfatase  19.16 
 
 		 628 aa  61.2  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1434  sulfatase  19.94 
 
 		 639 aa  61.2  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.511966  normal  0.0230537 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1405  sulfatase  23.41 
 
 		 712 aa  61.2  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0854  sulfatase  21.07 
 
 		 672 aa  61.2  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4012  sulfatase  21.73 
 
 		 654 aa  61.2  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2666  phosphoglycerol transferase  23.18 
 
 		 657 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000321801  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0320  sulfatase  22.7 
 
 		 640 aa  60.8  0.00000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3535  sulfatase  20 
 
 		 639 aa  60.8  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.009662  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1028  sulfatase  24.29 
 
 		 640 aa  60.8  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0869325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3874  sulfatase  19.16 
 
 		 628 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.295207 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3516  phosphoglycerol transferase I  24.12 
 
 		 738 aa  60.5  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0478646 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0742  sulfatase  22 
 
 		 646 aa  60.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0759  sulfatase  22 
 
 		 646 aa  60.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>