More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0826 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_0826  sulfatase  100 
 
 
627 aa  1306    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000772105  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  28.48 
 
 
536 aa  143  9e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  28.66 
 
 
474 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  28.81 
 
 
481 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  26.11 
 
 
462 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  27.23 
 
 
486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  27.42 
 
 
506 aa  132  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  26.1 
 
 
500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  26.26 
 
 
490 aa  124  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  25.11 
 
 
497 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  26.36 
 
 
479 aa  122  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  26.59 
 
 
470 aa  121  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  24.82 
 
 
500 aa  120  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  25.61 
 
 
488 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  25.8 
 
 
460 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  28.04 
 
 
492 aa  119  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  25.06 
 
 
487 aa  118  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  27.25 
 
 
470 aa  117  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  29.6 
 
 
631 aa  116  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3366  sulfatase  25.16 
 
 
535 aa  115  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.897843 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0984  sulfatase  25.16 
 
 
535 aa  115  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0931  sulfatase  25.16 
 
 
535 aa  115  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  28.46 
 
 
442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2371  sulfatase  26.63 
 
 
510 aa  112  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.852311  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  26.17 
 
 
470 aa  111  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0819  sulfatase  27.48 
 
 
523 aa  111  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  26.7 
 
 
495 aa  111  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  26.03 
 
 
481 aa  110  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  26.9 
 
 
480 aa  110  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  26.21 
 
 
472 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  26.54 
 
 
491 aa  110  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  26.08 
 
 
462 aa  110  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0491  sulfatase  25.77 
 
 
500 aa  108  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.244971 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3651  sulfatase  27.23 
 
 
483 aa  109  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000643806  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  24.68 
 
 
468 aa  109  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  26.85 
 
 
539 aa  108  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  26.7 
 
 
471 aa  107  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  25.59 
 
 
517 aa  106  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1568  sulfatase  24.05 
 
 
638 aa  106  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365787  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  26.95 
 
 
452 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  24.72 
 
 
510 aa  106  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  26.78 
 
 
482 aa  104  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  25.53 
 
 
453 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  25.4 
 
 
440 aa  104  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000311  arylsulfatase  24.53 
 
 
508 aa  103  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  24.18 
 
 
553 aa  103  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  27.54 
 
 
440 aa  103  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  24.82 
 
 
453 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  25.32 
 
 
457 aa  103  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3142  sulfatase  25.83 
 
 
524 aa  103  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.854728  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  24.54 
 
 
523 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1946  sulfatase  25.36 
 
 
546 aa  102  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  25.85 
 
 
501 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  24.67 
 
 
466 aa  101  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  24.52 
 
 
467 aa  100  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  25.47 
 
 
483 aa  100  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03676  acrylsulfatase-like enzyme  25.41 
 
 
551 aa  100  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.176732  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4178  sulfatase  25.41 
 
 
551 aa  100  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0425413  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  25.81 
 
 
497 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03625  hypothetical protein  25.41 
 
 
551 aa  100  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.173568  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  25.81 
 
 
497 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0820  sulfatase  26.13 
 
 
627 aa  99.8  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4166  arylsulfatase  25.41 
 
 
551 aa  100  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00523411  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  25.81 
 
 
497 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  25.81 
 
 
497 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  27.57 
 
 
484 aa  100  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  24.49 
 
 
465 aa  99.4  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5237  arylsulfatase  25.53 
 
 
551 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0995003  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  23.29 
 
 
548 aa  99  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2976  sulfatase  24.29 
 
 
496 aa  97.8  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  26.44 
 
 
457 aa  97.1  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  25.32 
 
 
438 aa  97.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42934  arylsulfatase  24.56 
 
 
564 aa  95.9  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  25.12 
 
 
497 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  23.87 
 
 
559 aa  95.5  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2434  sulfatase  27.31 
 
 
564 aa  95.9  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3660  sulfatase  24.39 
 
 
523 aa  96.3  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000523129  normal  0.837026 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  22.99 
 
 
480 aa  95.9  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  25.06 
 
 
482 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0997  sulfatase  23.17 
 
 
517 aa  95.5  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224171  normal  0.0910854 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1842  sulfatase  23.86 
 
 
526 aa  94.7  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  24.13 
 
 
491 aa  94.4  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  27.35 
 
 
559 aa  94.7  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  25.53 
 
 
478 aa  94.4  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3419  sulfatase  24.22 
 
 
526 aa  94  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3990  sulfatase family protein  24.67 
 
 
517 aa  93.6  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01456  hypothetical protein  24.83 
 
 
560 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1583  sulfatase  24.83 
 
 
560 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096723  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01469  hypothetical protein  24.83 
 
 
560 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0299  sulfatase  24.08 
 
 
609 aa  93.2  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2159  sulfatase  24.83 
 
 
560 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  25.6 
 
 
486 aa  92.8  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  23.54 
 
 
551 aa  93.6  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1675  sulfatase  24.83 
 
 
539 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00971  iduronate-sulfatase and sulfatase 1 precursor  26.55 
 
 
558 aa  92.8  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2148  sulfatase  25.22 
 
 
560 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.541761  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  24.23 
 
 
471 aa  92.4  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5097  sulfatase  26.16 
 
 
550 aa  92.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  25.31 
 
 
457 aa  91.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3391  sulfatase  23.14 
 
 
505 aa  92  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.169259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>