244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2757 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0089  phosphoglyceromutase  71.49 
 
 		 505 aa  700    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0359859  normal  0.664593 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0934  phosphoglyceromutase  67.13 
 
 		 506 aa  681    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0379  phosphoglyceromutase  68.13 
 
 		 504 aa  677    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2757  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 506 aa  1031    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2981  phosphoglyceromutase  68.71 
 
 		 506 aa  692    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0726522 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2506  phosphoglyceromutase  70.3 
 
 		 507 aa  717    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2593  phosphoglyceromutase  67.33 
 
 		 506 aa  682    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.721523  normal  0.885019 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0905  phosphoglyceromutase  59.16 
 
 		 505 aa  558  1e-158  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.835251  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4623  phosphoglyceromutase  56.52 
 
 		 512 aa  548  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.947003  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1234  phosphoglyceromutase  56.97 
 
 		 523 aa  547  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.774717  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0343  phosphoglyceromutase  57.79 
 
 		 504 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0555548  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0436  phosphoglyceromutase  56.8 
 
 		 504 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0384  phosphoglyceromutase  56.78 
 
 		 504 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3023  phosphoglyceromutase  54.27 
 
 		 516 aa  498  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.634479  decreased coverage  0.00447978 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3166  phosphoglyceromutase  53.91 
 
 		 519 aa  500  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1956  phosphoglyceromutase  50 
 
 		 521 aa  497  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.029965  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  51.36 
 
 		 513 aa  495  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  52.79 
 
 		 516 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  50.69 
 
 		 508 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  52.9 
 
 		 516 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  51.08 
 
 		 511 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  50.88 
 
 		 511 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  50.19 
 
 		 512 aa  490  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3611  phosphoglyceromutase  50.39 
 
 		 511 aa  489  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  51.08 
 
 		 511 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  52.6 
 
 		 516 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0561  phosphoglyceromutase  51.68 
 
 		 521 aa  490  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00179134  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4217  phosphoglyceromutase  50.87 
 
 		 514 aa  488  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  51.97 
 
 		 513 aa  488  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1757  phosphoglyceromutase  50.99 
 
 		 513 aa  486  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000493891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  51.66 
 
 		 515 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  51.27 
 
 		 515 aa  488  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3806  phosphoglyceromutase  51.07 
 
 		 514 aa  485  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0075  phosphoglyceromutase  48.93 
 
 		 515 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  49.71 
 
 		 510 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  50.49 
 
 		 511 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  51.29 
 
 		 509 aa  484  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4877  phosphoglyceromutase  50.68 
 
 		 514 aa  483  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4141  phosphoglyceromutase  48.93 
 
 		 515 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.793791  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4470  phosphoglyceromutase  51.07 
 
 		 514 aa  483  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000756408 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  50.79 
 
 		 505 aa  482  1e-135  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  51.66 
 
 		 510 aa  484  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0069  phosphoglyceromutase  48.93 
 
 		 515 aa  483  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0040  phosphoglyceromutase  50.1 
 
 		 514 aa  480  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  48.45 
 
 		 514 aa  479  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  50.49 
 
 		 514 aa  479  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  48.54 
 
 		 514 aa  479  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.549374 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  49.41 
 
 		 529 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  52.99 
 
 		 516 aa  478  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  50.89 
 
 		 510 aa  481  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3698  phosphoglyceromutase  50.39 
 
 		 514 aa  480  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  50.68 
 
 		 514 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03470  phosphoglyceromutase  48.54 
 
 		 514 aa  477  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0123  phosphoglyceromutase  48.64 
 
 		 514 aa  475  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03421  hypothetical protein  48.54 
 
 		 514 aa  477  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  50.68 
 
 		 514 aa  478  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4985  phosphoglyceromutase  48.54 
 
 		 514 aa  477  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.676695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0096  phosphoglyceromutase  48.54 
 
 		 514 aa  477  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3824  phosphoglyceromutase  48.54 
 
 		 514 aa  477  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4116  phosphoglyceromutase  48.54 
 
 		 514 aa  477  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4040  phosphoglyceromutase  48.54 
 
 		 514 aa  477  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  50.68 
 
 		 514 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  48.34 
 
 		 514 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  50.68 
 
 		 514 aa  478  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  49.81 
 
 		 513 aa  475  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4021  phosphoglyceromutase  49.51 
 
 		 513 aa  477  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  48.15 
 
 		 514 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  50.49 
 
 		 516 aa  475  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  48.15 
 
 		 514 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  48.15 
 
 		 514 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  49.9 
 
 		 512 aa  474  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  49.51 
 
 		 517 aa  472  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  48.15 
 
 		 514 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0882  phosphoglyceromutase  49.07 
 
 		 542 aa  472  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0045  phosphoglyceromutase  49.9 
 
 		 514 aa  471  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0043  phosphoglyceromutase  49.9 
 
 		 514 aa  472  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316902 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00121  phosphoglyceromutase  48.83 
 
 		 510 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0494  phosphoglyceromutase  49.31 
 
 		 516 aa  470  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27440  phosphoglyceromutase  50.2 
 
 		 511 aa  469  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2738  phosphoglyceromutase  49.71 
 
 		 510 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000279445  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002247  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  49.22 
 
 		 510 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0136338  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0051  phosphoglyceromutase  49.71 
 
 		 514 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185111 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3211  phosphoglyceromutase  49.8 
 
 		 509 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  48.83 
 
 		 514 aa  469  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04670  phosphoglyceromutase  50.1 
 
 		 511 aa  466  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3050  phosphoglyceromutase  49.13 
 
 		 516 aa  467  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.583924  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  52.14 
 
 		 513 aa  462  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  49.02 
 
 		 511 aa  462  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  51.96 
 
 		 514 aa  464  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0673  phosphoglyceromutase  48.36 
 
 		 552 aa  463  1e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  49.71 
 
 		 509 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  46.07 
 
 		 525 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1720  phosphoglyceromutase  47.55 
 
 		 519 aa  460  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  47.25 
 
 		 514 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2188  phosphoglyceromutase  49.51 
 
 		 517 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0451  phosphoglyceromutase  47.55 
 
 		 519 aa  459  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.688516  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2016  phosphoglyceromutase  48.64 
 
 		 515 aa  460  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0100245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0140  phosphoglyceromutase  49.22 
 
 		 511 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0046  phosphoglyceromutase  51.84 
 
 		 525 aa  457  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  48.73 
 
 		 518 aa  456  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>