252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2506 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0934  phosphoglyceromutase  72.22 
 
 		 506 aa  720    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0379  phosphoglyceromutase  66.14 
 
 		 504 aa  659    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0089  phosphoglyceromutase  73.61 
 
 		 505 aa  712    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0359859  normal  0.664593 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2757  phosphoglyceromutase  70.3 
 
 		 506 aa  728    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2981  phosphoglyceromutase  72.22 
 
 		 506 aa  732    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0726522 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2506  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 507 aa  1030    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2593  phosphoglyceromutase  72.42 
 
 		 506 aa  721    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.721523  normal  0.885019 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0343  phosphoglyceromutase  58.3 
 
 		 504 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0555548  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4623  phosphoglyceromutase  57.14 
 
 		 512 aa  557  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.947003  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0905  phosphoglyceromutase  58.1 
 
 		 505 aa  556  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.835251  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0384  phosphoglyceromutase  57.48 
 
 		 504 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0436  phosphoglyceromutase  57.31 
 
 		 504 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1234  phosphoglyceromutase  55.07 
 
 		 523 aa  520  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.774717  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3023  phosphoglyceromutase  54.29 
 
 		 516 aa  518  1.0000000000000001e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.634479  decreased coverage  0.00447978 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  50.88 
 
 		 510 aa  486  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0561  phosphoglyceromutase  51.58 
 
 		 521 aa  480  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00179134  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1956  phosphoglyceromutase  47.96 
 
 		 521 aa  481  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.029965  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  48.93 
 
 		 516 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  49.71 
 
 		 511 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  47.57 
 
 		 512 aa  475  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  50.1 
 
 		 513 aa  475  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  49.9 
 
 		 505 aa  477  1e-133  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  49.71 
 
 		 511 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  51.17 
 
 		 509 aa  474  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  47.51 
 
 		 525 aa  474  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1757  phosphoglyceromutase  50 
 
 		 513 aa  474  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000493891  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  50.48 
 
 		 516 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  50.67 
 
 		 516 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  48.83 
 
 		 512 aa  473  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  48.63 
 
 		 512 aa  474  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  50.67 
 
 		 516 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3166  phosphoglyceromutase  50.59 
 
 		 519 aa  473  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0140  phosphoglyceromutase  50 
 
 		 511 aa  475  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  49.51 
 
 		 511 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  50.98 
 
 		 514 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  48.43 
 
 		 518 aa  469  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  48.13 
 
 		 512 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  48.03 
 
 		 509 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  49.51 
 
 		 508 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  46.65 
 
 		 514 aa  462  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  51.06 
 
 		 516 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  47.95 
 
 		 511 aa  463  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0882  phosphoglyceromutase  47.68 
 
 		 542 aa  462  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  48.25 
 
 		 513 aa  461  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  49.8 
 
 		 512 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  48.24 
 
 		 517 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  49.02 
 
 		 513 aa  460  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  48.62 
 
 		 511 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  50.88 
 
 		 510 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 		 512 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0822  phosphoglyceromutase  48.37 
 
 		 523 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  48.82 
 
 		 512 aa  457  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4470  phosphoglyceromutase  47.66 
 
 		 514 aa  456  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000756408 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  48.44 
 
 		 510 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  50.49 
 
 		 513 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  48.14 
 
 		 512 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  50.19 
 
 		 512 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3731  phosphoglyceromutase  46.65 
 
 		 506 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0656  phosphoglyceromutase  48.75 
 
 		 524 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3806  phosphoglyceromutase  47.56 
 
 		 514 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  47.66 
 
 		 516 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  47.55 
 
 		 512 aa  450  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2016  phosphoglyceromutase  47.25 
 
 		 515 aa  449  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0100245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4217  phosphoglyceromutase  47.28 
 
 		 514 aa  449  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  47.96 
 
 		 515 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  47.77 
 
 		 515 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  46.67 
 
 		 511 aa  448  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0451  phosphoglyceromutase  46.47 
 
 		 519 aa  446  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.688516  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4877  phosphoglyceromutase  46.98 
 
 		 514 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  47.95 
 
 		 511 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0040  phosphoglyceromutase  46.39 
 
 		 514 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4021  phosphoglyceromutase  46.3 
 
 		 513 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  46.75 
 
 		 510 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  47.36 
 
 		 529 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1720  phosphoglyceromutase  46.27 
 
 		 519 aa  443  1e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  48.82 
 
 		 513 aa  444  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04670  phosphoglyceromutase  47.73 
 
 		 511 aa  442  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3698  phosphoglyceromutase  46.39 
 
 		 514 aa  442  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3611  phosphoglyceromutase  46.56 
 
 		 511 aa  445  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0043  phosphoglyceromutase  46.48 
 
 		 514 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316902 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  49.12 
 
 		 521 aa  443  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0051  phosphoglyceromutase  46.48 
 
 		 514 aa  442  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185111 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3211  phosphoglyceromutase  46.05 
 
 		 509 aa  444  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1890  phosphoglyceromutase  49.54 
 
 		 540 aa  442  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  46.09 
 
 		 514 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  46 
 
 		 514 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27440  phosphoglyceromutase  47.16 
 
 		 511 aa  440  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  46 
 
 		 514 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  46 
 
 		 514 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4141  phosphoglyceromutase  43.95 
 
 		 515 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.793791  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0526  phosphoglyceromutase  46.65 
 
 		 509 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.594564  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0075  phosphoglyceromutase  43.95 
 
 		 515 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4375  phosphoglyceromutase  45.51 
 
 		 510 aa  439  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2738  phosphoglyceromutase  47.37 
 
 		 510 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000279445  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0684  phosphoglyceromutase  46.65 
 
 		 509 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113328 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0045  phosphoglyceromutase  46.48 
 
 		 514 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150167 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0439  phosphoglyceromutase  49.81 
 
 		 557 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156638 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  45.58 
 
 		 514 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  46 
 
 		 514 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  45.12 
 
 		 514 aa  440  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>