228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0526 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0526  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 509 aa  1044    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.594564  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0684  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 509 aa  1044    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113328 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03470  phosphoglyceromutase  59.3 
 
 		 514 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  59.3 
 
 		 514 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3824  phosphoglyceromutase  59.3 
 
 		 514 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0096  phosphoglyceromutase  59.3 
 
 		 514 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4985  phosphoglyceromutase  59.3 
 
 		 514 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.676695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4877  phosphoglyceromutase  60.43 
 
 		 514 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03421  hypothetical protein  59.3 
 
 		 514 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  59.3 
 
 		 514 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.549374 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4040  phosphoglyceromutase  59.3 
 
 		 514 aa  612  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4116  phosphoglyceromutase  59.3 
 
 		 514 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  58.51 
 
 		 514 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0043  phosphoglyceromutase  60.35 
 
 		 514 aa  608  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316902 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  58.32 
 
 		 514 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  59.96 
 
 		 514 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  59.61 
 
 		 514 aa  606  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  58.32 
 
 		 514 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4217  phosphoglyceromutase  59.06 
 
 		 514 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  58.32 
 
 		 514 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0045  phosphoglyceromutase  60.16 
 
 		 514 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150167 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  58.32 
 
 		 514 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0051  phosphoglyceromutase  60.16 
 
 		 514 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185111 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  59.84 
 
 		 514 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  60.04 
 
 		 514 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4470  phosphoglyceromutase  59.65 
 
 		 514 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000756408 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  59.1 
 
 		 513 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4021  phosphoglyceromutase  59.57 
 
 		 513 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  60.04 
 
 		 513 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  59.84 
 
 		 514 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0123  phosphoglyceromutase  58.12 
 
 		 514 aa  602  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0040  phosphoglyceromutase  59.26 
 
 		 514 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0069  phosphoglyceromutase  58.32 
 
 		 515 aa  598  1e-170  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0075  phosphoglyceromutase  58.51 
 
 		 515 aa  600  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2188  phosphoglyceromutase  59.02 
 
 		 517 aa  600  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3698  phosphoglyceromutase  58.67 
 
 		 514 aa  600  1e-170  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  59.65 
 
 		 514 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4141  phosphoglyceromutase  58.51 
 
 		 515 aa  600  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.793791  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04670  phosphoglyceromutase  59.22 
 
 		 511 aa  595  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4391  phosphoglyceromutase  55.92 
 
 		 520 aa  593  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  57.56 
 
 		 508 aa  592  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3166  phosphoglyceromutase  58.95 
 
 		 519 aa  594  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  57.81 
 
 		 515 aa  590  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27440  phosphoglyceromutase  59.22 
 
 		 511 aa  591  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3806  phosphoglyceromutase  59.42 
 
 		 514 aa  591  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  58.93 
 
 		 509 aa  587  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0031  phosphoglyceromutase  54.86 
 
 		 517 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3611  phosphoglyceromutase  54.99 
 
 		 511 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  58.71 
 
 		 510 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  56.97 
 
 		 511 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0494  phosphoglyceromutase  56.03 
 
 		 516 aa  580  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  57.78 
 
 		 515 aa  579  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002247  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  58.07 
 
 		 510 aa  578  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0136338  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  56.97 
 
 		 511 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  56.58 
 
 		 510 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  56.78 
 
 		 511 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00121  phosphoglyceromutase  57.09 
 
 		 510 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  57.17 
 
 		 511 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2738  phosphoglyceromutase  58.1 
 
 		 510 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000279445  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  55.6 
 
 		 529 aa  568  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0451  phosphoglyceromutase  54.49 
 
 		 519 aa  566  1e-160  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.688516  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0046  phosphoglyceromutase  57.17 
 
 		 525 aa  565  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1720  phosphoglyceromutase  54.49 
 
 		 519 aa  566  1e-160  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1956  phosphoglyceromutase  55.27 
 
 		 521 aa  559  1e-158  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.029965  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3211  phosphoglyceromutase  54.71 
 
 		 509 aa  559  1e-158  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3050  phosphoglyceromutase  55.12 
 
 		 516 aa  555  1e-157  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.583924  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1431  phosphoglyceromutase  54.98 
 
 		 530 aa  550  1e-155  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  50.67 
 
 		 525 aa  546  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0673  phosphoglyceromutase  53.93 
 
 		 552 aa  546  1e-154  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  51.48 
 
 		 512 aa  545  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  51.27 
 
 		 512 aa  543  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  52.16 
 
 		 518 aa  540  9.999999999999999e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  54.04 
 
 		 511 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  50.69 
 
 		 514 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0563  phosphoglyceromutase  51.39 
 
 		 514 aa  535  1e-151  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  53.45 
 
 		 512 aa  537  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0539  phosphoglyceromutase  51.19 
 
 		 514 aa  533  1e-150  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  51.27 
 
 		 517 aa  535  1e-150  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  53.94 
 
 		 512 aa  528  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0701  phosphoglyceromutase  53.93 
 
 		 552 aa  528  1e-148  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5285  phosphoglyceromutase  51.77 
 
 		 509 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000133351  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  54.13 
 
 		 509 aa  525  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  52.43 
 
 		 516 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  50.2 
 
 		 518 aa  526  1e-148  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5239  phosphoglyceromutase  51.57 
 
 		 509 aa  523  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.372289  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4986  phosphoglyceromutase  51.57 
 
 		 509 aa  523  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4815  phosphoglyceromutase  51.57 
 
 		 509 aa  524  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4825  phosphoglyceromutase  51.57 
 
 		 509 aa  524  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5221  phosphoglyceromutase  51.38 
 
 		 509 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5365  phosphoglyceromutase  51.57 
 
 		 509 aa  523  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00214518  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5250  phosphoglyceromutase  51.57 
 
 		 509 aa  524  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  53.11 
 
 		 516 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  51.95 
 
 		 516 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  53.15 
 
 		 512 aa  518  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  51.96 
 
 		 512 aa  521  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  52.92 
 
 		 516 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5702  phosphoglyceromutase  51.38 
 
 		 509 aa  520  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000339151  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  53.15 
 
 		 512 aa  519  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  51.58 
 
 		 505 aa  518  1e-146  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4928  phosphoglyceromutase  51.57 
 
 		 509 aa  520  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.237588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>