263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0384 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0343  phosphoglyceromutase  92.66 
 
 		 504 aa  956    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0555548  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3023  phosphoglyceromutase  66.27 
 
 		 516 aa  675    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.634479  decreased coverage  0.00447978 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4623  phosphoglyceromutase  68 
 
 		 512 aa  671    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.947003  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0436  phosphoglyceromutase  94.64 
 
 		 504 aa  959    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0384  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 504 aa  1026    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0905  phosphoglyceromutase  66.14 
 
 		 505 aa  659    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.835251  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1234  phosphoglyceromutase  61.48 
 
 		 523 aa  598  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.774717  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0379  phosphoglyceromutase  60.44 
 
 		 504 aa  566  1e-160  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2981  phosphoglyceromutase  58.58 
 
 		 506 aa  548  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0726522 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2506  phosphoglyceromutase  57.48 
 
 		 507 aa  541  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0089  phosphoglyceromutase  58.78 
 
 		 505 aa  538  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0359859  normal  0.664593 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0934  phosphoglyceromutase  57.79 
 
 		 506 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2593  phosphoglyceromutase  57.99 
 
 		 506 aa  538  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.721523  normal  0.885019 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2757  phosphoglyceromutase  56.58 
 
 		 506 aa  533  1e-150  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  50.29 
 
 		 517 aa  514  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  51.68 
 
 		 511 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  51.66 
 
 		 513 aa  514  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  51.29 
 
 		 511 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0075  phosphoglyceromutase  50.88 
 
 		 515 aa  510  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4141  phosphoglyceromutase  50.68 
 
 		 515 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.793791  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0069  phosphoglyceromutase  50.68 
 
 		 515 aa  509  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  51.29 
 
 		 511 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  52.15 
 
 		 518 aa  505  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  51.28 
 
 		 508 aa  502  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  53.12 
 
 		 514 aa  503  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3698  phosphoglyceromutase  50.59 
 
 		 514 aa  504  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3166  phosphoglyceromutase  50.98 
 
 		 519 aa  502  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  50.49 
 
 		 515 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  50.69 
 
 		 511 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  49.14 
 
 		 525 aa  501  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  51.18 
 
 		 513 aa  498  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  52.05 
 
 		 512 aa  501  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03470  phosphoglyceromutase  49.9 
 
 		 514 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4985  phosphoglyceromutase  49.9 
 
 		 514 aa  496  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.676695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4116  phosphoglyceromutase  49.9 
 
 		 514 aa  496  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4040  phosphoglyceromutase  49.9 
 
 		 514 aa  496  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  50.1 
 
 		 514 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0096  phosphoglyceromutase  49.9 
 
 		 514 aa  496  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4470  phosphoglyceromutase  50.29 
 
 		 514 aa  497  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000756408 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4877  phosphoglyceromutase  49.71 
 
 		 514 aa  497  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2188  phosphoglyceromutase  51.96 
 
 		 517 aa  497  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3611  phosphoglyceromutase  50.1 
 
 		 511 aa  495  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03421  hypothetical protein  49.9 
 
 		 514 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4021  phosphoglyceromutase  49.51 
 
 		 513 aa  496  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3824  phosphoglyceromutase  49.9 
 
 		 514 aa  496  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  49.9 
 
 		 514 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  49.32 
 
 		 514 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  49.32 
 
 		 514 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0966  phosphoglyceromutase  51.06 
 
 		 542 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  49.71 
 
 		 514 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  49.9 
 
 		 514 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0123  phosphoglyceromutase  50.2 
 
 		 514 aa  493  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  49.9 
 
 		 514 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.549374 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  49.9 
 
 		 514 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  49.02 
 
 		 514 aa  494  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  49.32 
 
 		 514 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  50.49 
 
 		 515 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18341  phosphoglyceromutase  51.06 
 
 		 542 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  49.32 
 
 		 514 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2738  phosphoglyceromutase  52.63 
 
 		 510 aa  491  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000279445  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4391  phosphoglyceromutase  47.68 
 
 		 520 aa  489  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  49.31 
 
 		 509 aa  489  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0563  phosphoglyceromutase  47.54 
 
 		 514 aa  490  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0539  phosphoglyceromutase  47.35 
 
 		 514 aa  489  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04670  phosphoglyceromutase  50.5 
 
 		 511 aa  488  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4217  phosphoglyceromutase  50.39 
 
 		 514 aa  491  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3806  phosphoglyceromutase  50 
 
 		 514 aa  489  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0673  phosphoglyceromutase  49.42 
 
 		 552 aa  488  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  49.12 
 
 		 514 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0043  phosphoglyceromutase  48.73 
 
 		 514 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316902 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0040  phosphoglyceromutase  49.12 
 
 		 514 aa  490  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0051  phosphoglyceromutase  48.73 
 
 		 514 aa  489  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185111 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  51.95 
 
 		 510 aa  490  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  49.71 
 
 		 514 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0451  phosphoglyceromutase  48.63 
 
 		 519 aa  486  1e-136  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.688516  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0526  phosphoglyceromutase  50.49 
 
 		 509 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.594564  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  50.97 
 
 		 516 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0045  phosphoglyceromutase  48.73 
 
 		 514 aa  488  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150167 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0684  phosphoglyceromutase  50.49 
 
 		 509 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113328 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27440  phosphoglyceromutase  49.7 
 
 		 511 aa  488  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002247  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  50.78 
 
 		 510 aa  488  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0136338  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1720  phosphoglyceromutase  48.63 
 
 		 519 aa  486  1e-136  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  50.97 
 
 		 516 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  50.2 
 
 		 512 aa  484  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  49.31 
 
 		 529 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  50.2 
 
 		 510 aa  484  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  50.29 
 
 		 512 aa  483  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  50.97 
 
 		 516 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  52.35 
 
 		 513 aa  481  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  49.02 
 
 		 510 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  50 
 
 		 513 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  51.87 
 
 		 510 aa  481  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2164  phosphoglyceromutase  48.84 
 
 		 545 aa  479  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0638745  normal  0.146059 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00121  phosphoglyceromutase  50 
 
 		 510 aa  479  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  50.49 
 
 		 512 aa  481  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0046  phosphoglyceromutase  51.06 
 
 		 525 aa  479  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0868  phosphoglyceromutase  48.71 
 
 		 506 aa  477  1e-133  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  47.55 
 
 		 512 aa  476  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  50.97 
 
 		 516 aa  475  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  48.44 
 
 		 516 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>