258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2981 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0934  phosphoglyceromutase  90.32 
 
 		 506 aa  914    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0089  phosphoglyceromutase  75 
 
 		 505 aa  728    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0359859  normal  0.664593 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0379  phosphoglyceromutase  68.66 
 
 		 504 aa  685    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2981  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 506 aa  1028    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0726522 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2757  phosphoglyceromutase  68.71 
 
 		 506 aa  702    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2506  phosphoglyceromutase  72.22 
 
 		 507 aa  734    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2593  phosphoglyceromutase  89.92 
 
 		 506 aa  909    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.721523  normal  0.885019 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0905  phosphoglyceromutase  61.23 
 
 		 505 aa  591  1e-167  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.835251  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0343  phosphoglyceromutase  58.19 
 
 		 504 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0555548  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4623  phosphoglyceromutase  57.23 
 
 		 512 aa  555  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.947003  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1234  phosphoglyceromutase  58.17 
 
 		 523 aa  554  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.774717  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0436  phosphoglyceromutase  58.58 
 
 		 504 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0384  phosphoglyceromutase  58.58 
 
 		 504 aa  551  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3023  phosphoglyceromutase  55.69 
 
 		 516 aa  533  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.634479  decreased coverage  0.00447978 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  52.61 
 
 		 516 aa  498  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  52.91 
 
 		 516 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0561  phosphoglyceromutase  52.27 
 
 		 521 aa  496  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00179134  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1757  phosphoglyceromutase  51.79 
 
 		 513 aa  497  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000493891  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  52.91 
 
 		 516 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 		 513 aa  488  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  51.87 
 
 		 513 aa  490  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  48.73 
 
 		 512 aa  485  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  51.98 
 
 		 505 aa  486  1e-136  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  53.8 
 
 		 513 aa  483  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  52.65 
 
 		 514 aa  483  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  53.14 
 
 		 512 aa  483  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  52.71 
 
 		 516 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  51.18 
 
 		 512 aa  478  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  50 
 
 		 513 aa  478  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  48.82 
 
 		 514 aa  476  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  47.51 
 
 		 525 aa  475  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2188  phosphoglyceromutase  50.1 
 
 		 517 aa  475  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  49.02 
 
 		 512 aa  476  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  48.83 
 
 		 512 aa  476  1e-133  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0140  phosphoglyceromutase  49.41 
 
 		 511 aa  475  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0526  phosphoglyceromutase  49.31 
 
 		 509 aa  475  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.594564  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  50.19 
 
 		 509 aa  472  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0684  phosphoglyceromutase  49.31 
 
 		 509 aa  475  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113328 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  47.55 
 
 		 516 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3166  phosphoglyceromutase  50.98 
 
 		 519 aa  474  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  49.12 
 
 		 511 aa  471  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0069  phosphoglyceromutase  48.44 
 
 		 515 aa  471  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  49.41 
 
 		 508 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4141  phosphoglyceromutase  48.44 
 
 		 515 aa  471  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.793791  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  48.13 
 
 		 514 aa  471  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  48.73 
 
 		 512 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  48.33 
 
 		 512 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  51.08 
 
 		 521 aa  470  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0075  phosphoglyceromutase  48.05 
 
 		 515 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 		 512 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  48.93 
 
 		 511 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  49.51 
 
 		 512 aa  464  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  48.23 
 
 		 511 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  47.75 
 
 		 514 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  48.44 
 
 		 517 aa  462  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  50.1 
 
 		 510 aa  464  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  47.75 
 
 		 514 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  47.75 
 
 		 514 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 		 510 aa  463  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  48.63 
 
 		 518 aa  462  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  47.75 
 
 		 514 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0882  phosphoglyceromutase  48.89 
 
 		 542 aa  462  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  48.23 
 
 		 511 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  48.74 
 
 		 515 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2016  phosphoglyceromutase  46.89 
 
 		 515 aa  460  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0100245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  47.55 
 
 		 514 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  48.03 
 
 		 511 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  49.32 
 
 		 512 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3806  phosphoglyceromutase  49.02 
 
 		 514 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.823885 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  47.37 
 
 		 514 aa  455  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4217  phosphoglyceromutase  48.25 
 
 		 514 aa  457  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  47.85 
 
 		 514 aa  456  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  48.05 
 
 		 514 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4470  phosphoglyceromutase  48.15 
 
 		 514 aa  456  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000756408 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1956  phosphoglyceromutase  46.67 
 
 		 521 aa  458  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.029965  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00121  phosphoglyceromutase  47.96 
 
 		 510 aa  456  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  48.03 
 
 		 511 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0451  phosphoglyceromutase  47.84 
 
 		 519 aa  456  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.688516  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002247  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  48.16 
 
 		 510 aa  457  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0136338  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1720  phosphoglyceromutase  47.84 
 
 		 519 aa  456  1e-127  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0275  phosphoglyceromutase  47.55 
 
 		 515 aa  455  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.206526  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  48.74 
 
 		 515 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0123  phosphoglyceromutase  47.75 
 
 		 514 aa  458  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04670  phosphoglyceromutase  49.9 
 
 		 511 aa  455  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  47.85 
 
 		 514 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  47.85 
 
 		 514 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2315  phosphoglyceromutase  48.06 
 
 		 532 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.619962 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03470  phosphoglyceromutase  47.46 
 
 		 514 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4040  phosphoglyceromutase  47.46 
 
 		 514 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  47.55 
 
 		 514 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.549374 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  47.06 
 
 		 510 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2264  phosphoglyceromutase  48.06 
 
 		 532 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3824  phosphoglyceromutase  47.46 
 
 		 514 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4985  phosphoglyceromutase  47.46 
 
 		 514 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.676695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0822  phosphoglyceromutase  49.43 
 
 		 523 aa  455  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1073  phosphoglyceromutase  47.83 
 
 		 538 aa  455  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0159057 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0051  phosphoglyceromutase  47.27 
 
 		 514 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185111 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  50.49 
 
 		 510 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4116  phosphoglyceromutase  47.46 
 
 		 514 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03421  hypothetical protein  47.46 
 
 		 514 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>