54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0845 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0845  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 		 346 aa  708    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0227  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.83 
 
 		 389 aa  162  6e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0636  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.72 
 
 		 363 aa  153  4e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.288673 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0326  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.43 
 
 		 347 aa  115  8.999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0247  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.67 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1244  hypothetical protein  23.84 
 
 		 381 aa  86.3  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1211  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.84 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193412  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1517  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.15 
 
 		 369 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0964  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.4 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0778  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.8 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.289183  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0592  hypothetical protein  27.32 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0170  hypothetical protein  29.3 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305358  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1624  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.17 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000105277 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1468  hypothetical protein  24.93 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0700  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.58 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1418  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.17 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1198  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.15 
 
 		 374 aa  59.3  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.109872  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1630  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.12 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0338908  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1696  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.54 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0118567  normal  0.384277 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1930  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.07 
 
 		 409 aa  57  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13160  uncharacterized AP superfamily protein  27.57 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4133  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.35 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0770784  hitchhiker  0.0000385329 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3008  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.64 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2780  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.24 
 
 		 386 aa  55.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2142  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.92 
 
 		 386 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216003  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2032  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.37 
 
 		 395 aa  53.5  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683986  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15860  uncharacterized AP superfamily protein  26.84 
 
 		 419 aa  53.5  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.070607  normal  0.0727207 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3187  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.52 
 
 		 289 aa  53.1  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.280318  normal  0.0143084 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2238  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.72 
 
 		 403 aa  52.8  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.321997  normal  0.249982 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1550  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.11 
 
 		 385 aa  52  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0842703  normal  0.0911762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7065  hypothetical protein  25.22 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2388  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.16 
 
 		 470 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266658  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2126  hypothetical protein  25.43 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4923  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.47 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894226  normal  0.019895 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29340  uncharacterized AP superfamily protein  23.58 
 
 		 379 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03452  putative type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase protein  23.28 
 
 		 447 aa  51.2  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1630  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.67 
 
 		 372 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00347347  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0593  hypothetical protein  31.08 
 
 		 128 aa  50.1  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1775  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.01 
 
 		 396 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1117  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.95 
 
 		 387 aa  49.7  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704778  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.17 
 
 		 312 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2382  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.27 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.173924 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2945  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.45 
 
 		 372 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14460  uncharacterized AP superfamily protein  27.67 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.290718  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3271  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.89 
 
 		 377 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1155  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.45 
 
 		 397 aa  46.6  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266632  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3282  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.85 
 
 		 414 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.405873  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2990  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.56 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0333  metalloenzyme domain protein  25.53 
 
 		 515 aa  43.9  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.134718  normal  0.059537 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0304  hypothetical protein  21.9 
 
 		 415 aa  43.9  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0921268  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3237  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.24 
 
 		 412 aa  43.5  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340996  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0400  Phosphodiesterase I  24.62 
 
 		 422 aa  43.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1931  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.17 
 
 		 382 aa  43.1  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0734403  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3463  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.31 
 
 		 412 aa  43.1  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0116181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>