48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1823 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1823  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 		 455 aa  932    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2427  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  94.07 
 
 		 455 aa  882    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1558  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  61.27 
 
 		 458 aa  592  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0983  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  57.93 
 
 		 459 aa  545  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7260  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  54.95 
 
 		 456 aa  535  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000104438  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2289  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  54.29 
 
 		 456 aa  535  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0787093 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0082  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  53.93 
 
 		 462 aa  518  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2469  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  56.26 
 
 		 467 aa  515  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00142832  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0426  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  53.51 
 
 		 450 aa  508  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2886  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  51.65 
 
 		 454 aa  506  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11140  uncharacterized AP superfamily protein  53.83 
 
 		 466 aa  478  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0415876 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2330  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  55.33 
 
 		 467 aa  472  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1148  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  52.85 
 
 		 461 aa  468  9.999999999999999e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0396  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  48.27 
 
 		 471 aa  412  1e-114  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0776  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  35.14 
 
 		 501 aa  238  1e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0713  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.7 
 
 		 496 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3720  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.7 
 
 		 434 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758068  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  20.92 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0732  hypothetical protein  24.14 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.368831  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.79 
 
 		 437 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350178  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0374  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.28 
 
 		 437 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.47 
 
 		 437 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.49 
 
 		 433 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0270594 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.15 
 
 		 437 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0459  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.15 
 
 		 437 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000352443  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.43 
 
 		 437 aa  53.9  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000974575  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3194  phosphonoacetate hydrolase  29.25 
 
 		 412 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  20.83 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0361814  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3077  phosphonoacetate hydrolase  28.7 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0898295 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0371  type I phosphodiesterase  20.83 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00015541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0394  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  20.83 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143254  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3134  phosphonoacetate hydrolase  27.98 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133169 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0368  type I phosphodiesterase  21.34 
 
 		 437 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000500368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1367  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  20.54 
 
 		 431 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0438  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.02 
 
 		 437 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.48 
 
 		 455 aa  50.1  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.34184  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2339  phosphonoacetate hydrolase  25.88 
 
 		 421 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.446144  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3158  phosphonoacetate hydrolase  29.05 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19589  normal  0.0309825 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4169  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.15 
 
 		 445 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  hitchhiker  0.00388008 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1625  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  20.16 
 
 		 431 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.018842  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3142  phosphonoacetate hydrolase  29.05 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2529  phosphonoacetate hydrolase  29.05 
 
 		 471 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3220  phosphonoacetate hydrolase  24.28 
 
 		 408 aa  47.4  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4258  phosphonoacetate hydrolase  24.86 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0400  Phosphodiesterase I  24.46 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1841  phosphodiesterase I  22.75 
 
 		 400 aa  43.9  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126105  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0170  hypothetical protein  26.07 
 
 		 402 aa  43.9  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305358  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1878  phosphodiesterase I  26.04 
 
 		 428 aa  43.5  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.872565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>