40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0653 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0653  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 
303 aa  625  1e-178  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00732097  normal  0.177226 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.91 
 
 
312 aa  60.1  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1314  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.35 
 
 
336 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.342243  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1644  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.61 
 
 
519 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  25.31 
 
 
437 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350178  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  25.31 
 
 
437 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4617  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.51 
 
 
422 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3216  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.53 
 
 
629 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0459  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.9 
 
 
437 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000352443  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0394  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.9 
 
 
437 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0371  type I phosphodiesterase  24.9 
 
 
437 aa  50.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00015541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.9 
 
 
437 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0361814  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.95 
 
 
262 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6789  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.33 
 
 
415 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0417562 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2080  phosphodiesterase I  23.83 
 
 
433 aa  47.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.48 
 
 
437 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0438  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.48 
 
 
437 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0400  Phosphodiesterase I  22.08 
 
 
422 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0368  type I phosphodiesterase  24.48 
 
 
437 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000500368  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.11 
 
 
433 aa  46.6  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0270594 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2169  phosphodiesterase I  23.44 
 
 
433 aa  46.6  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4286  hypothetical protein  22.29 
 
 
678 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.119503  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1142  sulfatase  35.37 
 
 
555 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  24.9 
 
 
417 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.73 
 
 
437 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000974575  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1685  hypothetical protein  26.39 
 
 
268 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385005  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2111  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  29.87 
 
 
553 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.770055  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3858  sulfatase  32.61 
 
 
519 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0969664  normal  0.154261 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0412  type I phosphodiesterase / nucleotide pyrophosphatase  29.87 
 
 
553 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490012  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1138  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  29.87 
 
 
553 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0848  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  29.87 
 
 
553 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0542454  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1760  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  29.87 
 
 
553 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.281504  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1843  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  29.87 
 
 
553 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.169875  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4646  sulfatase  29.79 
 
 
461 aa  43.1  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1625  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  23.53 
 
 
431 aa  42.7  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.018842  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0661  hypothetical protein  24.11 
 
 
695 aa  42.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.639772 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1024  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.99 
 
 
557 aa  42.7  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.414334 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1630  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.39 
 
 
372 aa  42.7  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00347347  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3879  hypothetical protein  22.86 
 
 
287 aa  42.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0323  type I phosphodiesterase / nucleotide pyrophosphatase  29.87 
 
 
553 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>