256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1815 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1815  phosphoglyceromutase  100 
 
 
507 aa  1042    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.638605  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1492  phosphoglyceromutase  100 
 
 
507 aa  1042    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.392134  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0120  phosphoglyceromutase  58.86 
 
 
513 aa  575  1.0000000000000001e-163  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0222  phosphoglyceromutase  58.05 
 
 
516 aa  552  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0133  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  54.92 
 
 
516 aa  541  1e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  49.02 
 
 
514 aa  485  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  48.13 
 
 
512 aa  479  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  48.54 
 
 
516 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  48.84 
 
 
516 aa  477  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  48.35 
 
 
516 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  49.22 
 
 
505 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  47.04 
 
 
511 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  47.96 
 
 
516 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  45.61 
 
 
512 aa  455  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  47.83 
 
 
514 aa  451  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  48.33 
 
 
513 aa  449  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1123  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  44.31 
 
 
513 aa  451  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000726536  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0309  phosphoglyceromutase  45.79 
 
 
514 aa  446  1.0000000000000001e-124  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0235931  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  43.96 
 
 
508 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1757  phosphoglyceromutase  47.44 
 
 
513 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000493891  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  46.03 
 
 
510 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  46.84 
 
 
521 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  45.72 
 
 
512 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  45.72 
 
 
512 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  46.76 
 
 
510 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  46 
 
 
512 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  46.41 
 
 
512 aa  443  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  44.69 
 
 
515 aa  445  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  47.64 
 
 
510 aa  443  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0343  phosphoglyceromutase  47.13 
 
 
504 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0555548  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  44.66 
 
 
511 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  48.23 
 
 
513 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  43.28 
 
 
510 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1838  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  44.76 
 
 
496 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000122266  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  43.56 
 
 
529 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  45.29 
 
 
517 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  45.97 
 
 
512 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2315  phosphoglyceromutase  46.59 
 
 
532 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.619962 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16361  phosphoglyceromutase  44.25 
 
 
540 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  45.81 
 
 
512 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2264  phosphoglyceromutase  46.59 
 
 
532 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  44.66 
 
 
511 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1837  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  46.34 
 
 
510 aa  436  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.906856  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  44.51 
 
 
525 aa  438  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  46.58 
 
 
512 aa  435  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1527  phosphoglyceromutase  44.44 
 
 
540 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0673  phosphoglyceromutase  44.89 
 
 
552 aa  436  1e-121  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  44.58 
 
 
515 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  44.66 
 
 
511 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2016  phosphoglyceromutase  45.17 
 
 
515 aa  436  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0100245  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16241  phosphoglyceromutase  44.05 
 
 
540 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  45.21 
 
 
516 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  44.81 
 
 
513 aa  432  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0723  phosphoglyceromutase  46.2 
 
 
533 aa  434  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191053  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0436  phosphoglyceromutase  47.13 
 
 
504 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4527  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  46.53 
 
 
515 aa  432  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904144  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0384  phosphoglyceromutase  46.93 
 
 
504 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1011  phosphoglyceromutase  45.86 
 
 
532 aa  433  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002247  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  43.5 
 
 
510 aa  435  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0136338  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04670  phosphoglyceromutase  44.86 
 
 
511 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0822  phosphoglyceromutase  46.32 
 
 
523 aa  428  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  44.99 
 
 
513 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00121  phosphoglyceromutase  42.91 
 
 
510 aa  430  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4040  phosphoglyceromutase  47.47 
 
 
532 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.010334 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2981  phosphoglyceromutase  48.34 
 
 
506 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0726522 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  43.47 
 
 
511 aa  428  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  43.97 
 
 
511 aa  425  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  44.62 
 
 
511 aa  427  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000025941  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  43.08 
 
 
509 aa  426  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0882  phosphoglyceromutase  43.45 
 
 
542 aa  427  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1614  phosphoglyceromutase  43.64 
 
 
491 aa  428  1e-118  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.108207  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2188  phosphoglyceromutase  44.05 
 
 
517 aa  427  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2546  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  46.83 
 
 
532 aa  427  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27440  phosphoglyceromutase  44.66 
 
 
511 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0275  phosphoglyceromutase  45.37 
 
 
515 aa  427  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.206526  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0905  phosphoglyceromutase  46.77 
 
 
505 aa  425  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.835251  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  44.69 
 
 
511 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  41.81 
 
 
514 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1141  phosphoglyceromutase  46.88 
 
 
524 aa  425  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000850131  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0656  phosphoglyceromutase  45.45 
 
 
524 aa  422  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2868  phosphoglyceromutase  45.22 
 
 
514 aa  423  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000729439  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0469  phosphoglyceromutase  47.09 
 
 
532 aa  422  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1431  phosphoglyceromutase  43.71 
 
 
530 aa  423  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  42.91 
 
 
512 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  41.81 
 
 
514 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4623  phosphoglyceromutase  46.93 
 
 
512 aa  422  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.947003  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  41.81 
 
 
514 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  44.73 
 
 
518 aa  422  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3166  phosphoglyceromutase  44.97 
 
 
519 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18341  phosphoglyceromutase  43.6 
 
 
542 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0140  phosphoglyceromutase  43.08 
 
 
511 aa  424  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  42.01 
 
 
514 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  44.05 
 
 
516 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03470  phosphoglyceromutase  42.21 
 
 
514 aa  420  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5285  phosphoglyceromutase  43.9 
 
 
509 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000133351  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00280  phosphoglycerate mutase, putative  42.88 
 
 
532 aa  421  1e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3679  phosphoglyceromutase  44.29 
 
 
509 aa  421  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000585088  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0379  phosphoglyceromutase  46.25 
 
 
504 aa  419  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0494  phosphoglyceromutase  42.6 
 
 
516 aa  419  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  41.62 
 
 
514 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.361835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>