88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1756 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1756  sulfatase  100 
 
 		 474 aa  954    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.242329 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  25.86 
 
 		 502 aa  76.3  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0154  sulfatase  23.18 
 
 		 454 aa  71.2  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000668791 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  26.38 
 
 		 516 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  26.38 
 
 		 516 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  26.38 
 
 		 516 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3133  sulfatase  22.54 
 
 		 504 aa  63.5  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  27.48 
 
 		 511 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2247  sulfatase  24.03 
 
 		 501 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  27.23 
 
 		 511 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0496  sulfatase  24.11 
 
 		 501 aa  60.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261478  normal  0.387641 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  27.23 
 
 		 511 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  38.55 
 
 		 512 aa  59.7  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  26.38 
 
 		 516 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0594  putative choline sulfatase  24.03 
 
 		 501 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2286  sulfatase  40.7 
 
 		 498 aa  58.9  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0637  sulfatase  24.66 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  24.73 
 
 		 512 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4926  sulfatase  32.56 
 
 		 534 aa  57.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  24.93 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1150  choline sulfatase  22.98 
 
 		 496 aa  56.6  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3253  sulfatase  27.99 
 
 		 1065 aa  56.6  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189767  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  26.72 
 
 		 522 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  26.72 
 
 		 522 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  34.82 
 
 		 493 aa  54.7  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  26.72 
 
 		 522 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  26.72 
 
 		 522 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  26.72 
 
 		 522 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2284  sulfatase  35.45 
 
 		 784 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  23.09 
 
 		 526 aa  53.9  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3900  sulfatase  25.5 
 
 		 489 aa  53.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  25.69 
 
 		 520 aa  53.1  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2507  sulfatase  43.06 
 
 		 873 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0936334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3036  sulfatase  30.49 
 
 		 611 aa  52.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  25.2 
 
 		 517 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  27.23 
 
 		 517 aa  52.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5790  choline-sulfatase  23.06 
 
 		 504 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  30.58 
 
 		 453 aa  50.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3641  sulfatase  24.43 
 
 		 486 aa  50.8  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013502 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2014  sulfatase  45.59 
 
 		 596 aa  50.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0440  sulfatase  48.98 
 
 		 431 aa  50.4  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1567  sulfatase  36.61 
 
 		 523 aa  50.1  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0183451  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  25.2 
 
 		 518 aa  49.7  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  29.87 
 
 		 473 aa  49.7  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3376  sulfatase  32 
 
 		 509 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2100  sulfatase  31.71 
 
 		 480 aa  48.5  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  24.12 
 
 		 513 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2292  sulfatase  22.97 
 
 		 489 aa  48.5  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28180  arylsulfatase A family protein  33.03 
 
 		 480 aa  47.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2400  sulfatase  32.28 
 
 		 589 aa  47.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0292447  hitchhiker  0.00582616 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1453  sulfatase  27.65 
 
 		 450 aa  48.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  22.95 
 
 		 457 aa  48.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  40.22 
 
 		 490 aa  47.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0306  arylsulfatase  34.17 
 
 		 1041 aa  47.4  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  35.29 
 
 		 481 aa  47.4  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1352  sulfatase  32.53 
 
 		 548 aa  47  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  23.44 
 
 		 452 aa  46.6  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.87 
 
 		 478 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  31.11 
 
 		 474 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1986  sulfatase  28.39 
 
 		 555 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.737695 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0538  sulfatase  39.47 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4036  sulfatase  46 
 
 		 459 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188862  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6693  choline-sulfatase  23.39 
 
 		 502 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17144  normal  0.223575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4168  sulfatase  25.92 
 
 		 790 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.214843  normal  0.547823 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2375  sulfatase family protein  26.61 
 
 		 502 aa  45.8  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0813491  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1708  sulfatase  24.31 
 
 		 449 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1101  sulfatase family protein  19.66 
 
 		 487 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00123552  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4597  sulfatase  33.33 
 
 		 614 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  20.86 
 
 		 491 aa  45.8  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1723  putative sulfatase  35.48 
 
 		 624 aa  45.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010962  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07660  putative alkaline phosphatase  24.37 
 
 		 556 aa  44.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0307929  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  29.6 
 
 		 489 aa  44.3  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  20.75 
 
 		 559 aa  44.7  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0192  sulfatase  33.33 
 
 		 630 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.30718 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1843  sulfatase  38.16 
 
 		 826 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.10365 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  24.85 
 
 		 482 aa  44.3  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2156  sulfatase  36.62 
 
 		 487 aa  44.3  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  36.84 
 
 		 517 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5561  sulfatase  23.68 
 
 		 797 aa  43.9  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  24.79 
 
 		 494 aa  43.9  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9183  hypothetical protein  24.68 
 
 		 350 aa  43.9  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  32.93 
 
 		 496 aa  43.5  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04770  arylsulfatase A family protein  38.61 
 
 		 478 aa  43.9  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3489  sulfatase  31.03 
 
 		 535 aa  43.9  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10303  sulfatase  27.95 
 
 		 465 aa  43.5  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000455468  normal  0.448256 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  31.33 
 
 		 486 aa  43.5  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1363  sulfatase  35.62 
 
 		 469 aa  43.5  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0156455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  28.15 
 
 		 535 aa  43.1  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>