More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4892 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4892  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  100 
 
 		 329 aa  664    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00104362  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0240  beta-lactamase  57.66 
 
 		 348 aa  366  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  28.75 
 
 		 347 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  23.45 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  29.08 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  27.84 
 
 		 412 aa  76.3  0.0000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  29.06 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  23.5 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  27.92 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0229  beta-lactamase  28.48 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  29.11 
 
 		 578 aa  72.8  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  23.86 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  30.56 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  27.69 
 
 		 582 aa  70.1  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1238  beta-lactamase  25.8 
 
 		 361 aa  69.3  0.00000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  25.65 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  28.12 
 
 		 460 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  25.53 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  27.3 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  27.33 
 
 		 966 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  28.47 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  25.66 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  25.62 
 
 		 793 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  25.83 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  28.46 
 
 		 483 aa  63.2  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  30.45 
 
 		 416 aa  62.8  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  28.05 
 
 		 510 aa  63.2  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  29.87 
 
 		 354 aa  62.8  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  27.27 
 
 		 428 aa  62.4  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  27.27 
 
 		 452 aa  62.8  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  28.84 
 
 		 395 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0093  beta-lactamase, putative  24.22 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  26.51 
 
 		 366 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  29.28 
 
 		 369 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  22.92 
 
 		 380 aa  62  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3287  beta-lactamase  28.57 
 
 		 463 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0209216 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4863  beta-lactamase  28.4 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.625101  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  23.22 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  37.93 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  28.46 
 
 		 459 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.23 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  29.64 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  25.13 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  25.49 
 
 		 435 aa  59.7  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  28.42 
 
 		 423 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  27.93 
 
 		 451 aa  59.7  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  28.33 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  22.09 
 
 		 487 aa  59.7  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  29.58 
 
 		 369 aa  59.3  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0035  putative beta-lactamase  26.55 
 
 		 397 aa  59.3  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.32 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.18 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  23.77 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0050  beta-lactamase  25.14 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  28.62 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  26.52 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  27.78 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  28.11 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1031  beta-lactamase  25.99 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0402  beta-lactamase  24.56 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00394756  normal  0.302831 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  23.65 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0301  beta-lactamase  27.21 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  22.61 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3144  beta-lactamase  31.06 
 
 		 590 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  34.55 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  27.99 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.26 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  22.64 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12285  hypothetical protein  27.86 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  26.98 
 
 		 496 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  25.72 
 
 		 379 aa  57  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  23.7 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1086  beta-lactamase  22.27 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  24.73 
 
 		 438 aa  56.6  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1266  beta-lactamase  26.91 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  29.69 
 
 		 381 aa  56.2  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2768  beta-lactamase  22.09 
 
 		 483 aa  56.2  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  22.22 
 
 		 378 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  24.65 
 
 		 407 aa  55.8  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  34.34 
 
 		 525 aa  55.8  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3187  beta-lactamase  26.67 
 
 		 454 aa  55.8  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000216369  hitchhiker  0.000000000911992 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  22.8 
 
 		 395 aa  55.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  23.56 
 
 		 353 aa  55.8  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5107  beta-lactamase  27.73 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434559  normal  0.256673 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  23.1 
 
 		 422 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4110  beta-lactamase  21.9 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  26.38 
 
 		 464 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1072  Beta-lactamase  30.05 
 
 		 412 aa  55.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7012  beta-lactamase  28.72 
 
 		 467 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.858592 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  27.49 
 
 		 848 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.7 
 
 		 378 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  31.01 
 
 		 440 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  26.39 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2230  beta-lactamase  26.63 
 
 		 380 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  25.91 
 
 		 388 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  25.57 
 
 		 388 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1998  beta-lactamase  28.86 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1251  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  28.78 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000135632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5550  beta-lactamase  32.74 
 
 		 364 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.432624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4591  beta-lactamase  24.81 
 
 		 675 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434255  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>