More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0240 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0240  beta-lactamase  100 
 
 
348 aa  695    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4892  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  57.66 
 
 
329 aa  354  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00104362  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  28.88 
 
 
347 aa  97.4  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  27.76 
 
 
428 aa  78.2  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  26.42 
 
 
452 aa  78.2  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  26.89 
 
 
395 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  29.54 
 
 
408 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0035  putative beta-lactamase  26.87 
 
 
397 aa  74.3  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  28.07 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  23.63 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1266  beta-lactamase  26.06 
 
 
364 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  24.45 
 
 
395 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  28.03 
 
 
582 aa  70.9  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0229  beta-lactamase  28.62 
 
 
354 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  23.92 
 
 
966 aa  69.7  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  25.55 
 
 
402 aa  69.3  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1238  beta-lactamase  24.92 
 
 
361 aa  68.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  26.47 
 
 
436 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  27.92 
 
 
423 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  22.63 
 
 
395 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  26.04 
 
 
370 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  26.27 
 
 
414 aa  67  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  25.74 
 
 
395 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  23.68 
 
 
483 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  23.78 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  27.63 
 
 
530 aa  66.6  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  28.67 
 
 
416 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  25.49 
 
 
395 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  25.35 
 
 
435 aa  65.5  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  27.36 
 
 
784 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  33.05 
 
 
409 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  22.55 
 
 
379 aa  65.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  28.26 
 
 
416 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  25.83 
 
 
574 aa  63.5  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  27.97 
 
 
483 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  24.92 
 
 
430 aa  63.2  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  24.72 
 
 
360 aa  63.2  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  26.79 
 
 
440 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  28.36 
 
 
413 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  26.37 
 
 
388 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  28.26 
 
 
421 aa  62.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  28.26 
 
 
421 aa  62.8  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  28.26 
 
 
412 aa  62.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  28.26 
 
 
412 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  22.73 
 
 
793 aa  62.8  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  27.4 
 
 
578 aa  62.8  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  24.69 
 
 
395 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  26.37 
 
 
388 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  27.41 
 
 
464 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2881  beta-lactamase  25.84 
 
 
338 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.74645  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  32.35 
 
 
440 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  26.44 
 
 
412 aa  62.4  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  27.54 
 
 
413 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  27.24 
 
 
717 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  27.27 
 
 
415 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2728  beta-lactamase  24.93 
 
 
387 aa  61.2  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.144324 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  24.31 
 
 
476 aa  61.6  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  34.88 
 
 
407 aa  60.8  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  25.89 
 
 
388 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  23.74 
 
 
342 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  21.97 
 
 
496 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  30.71 
 
 
453 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  28.11 
 
 
531 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  26.58 
 
 
388 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  25.89 
 
 
388 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  27.54 
 
 
422 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  22.86 
 
 
438 aa  60.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  24.85 
 
 
390 aa  60.5  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3764  beta-lactamase  27.91 
 
 
274 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.551657 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  29.41 
 
 
487 aa  60.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  28.67 
 
 
404 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  26.69 
 
 
416 aa  60.1  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  26.23 
 
 
430 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  25.9 
 
 
459 aa  60.1  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  26.62 
 
 
417 aa  60.1  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  22.78 
 
 
483 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  23.72 
 
 
481 aa  59.3  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3034  beta-lactamase  31.18 
 
 
413 aa  59.3  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396527  normal  0.941046 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  23.72 
 
 
481 aa  59.3  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  28.1 
 
 
434 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  26.01 
 
 
391 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37770  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  27.76 
 
 
366 aa  58.9  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.269534  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  27.52 
 
 
437 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  27.58 
 
 
369 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  25.68 
 
 
388 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  31.21 
 
 
396 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  28.08 
 
 
422 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.96 
 
 
389 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  25.68 
 
 
389 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  25.94 
 
 
357 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.27 
 
 
388 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  22.18 
 
 
490 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  33.78 
 
 
478 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  25.68 
 
 
388 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0888  beta-lactamase  28.53 
 
 
353 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0244137 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  25.68 
 
 
388 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  27.09 
 
 
461 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  28.64 
 
 
496 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  22.99 
 
 
463 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2923  beta-lactamase  42.15 
 
 
394 aa  58.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>