157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0927 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0927  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 205 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2865  hypothetical protein  43.62 
 
 		 196 aa  152  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00327413  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3443  cold-shock protein, DNA-binding:protein of unknown function DUF1294  42.16 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2628  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  35.89 
 
 		 237 aa  143  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.326591  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1412  cold-shock DNA-binding domain protein  38.81 
 
 		 204 aa  141  8e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0148  cold shock DNA-binding domain-containing protein  38.1 
 
 		 201 aa  139  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1103  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.25 
 
 		 203 aa  135  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.984456 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3494  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  36.53 
 
 		 224 aa  131  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0199101  normal  0.508028 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5254  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  37.56 
 
 		 219 aa  131  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.737386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2028  cold shock DNA-binding domain-containing protein  40.1 
 
 		 203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1832  cold-shock DNA-binding domain protein  37.5 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2851  hypothetical protein  35.42 
 
 		 207 aa  124  6e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2482  cold-shock DNA-binding domain protein  37.82 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0400  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  35.47 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.666449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1327  cold-shock DNA-binding domain protein  36.08 
 
 		 209 aa  111  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1356  cold-shock DNA-binding domain protein  36.08 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728005 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3336  hypothetical protein  35.64 
 
 		 238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.928903  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2966  hypothetical protein  34.78 
 
 		 214 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2455  protein of unknown function DUF1294  32.09 
 
 		 204 aa  104  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2151  cold-shock domain-contain protein  37.06 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0090  hypothetical protein  49.48 
 
 		 107 aa  102  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0957  hypothetical protein  38.64 
 
 		 178 aa  101  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.35989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2800  hypothetical protein  46.9 
 
 		 157 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2883  hypothetical protein  45.54 
 
 		 167 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.384269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2979  hypothetical protein  38.71 
 
 		 172 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3079  hypothetical protein  38.56 
 
 		 179 aa  94.7  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.661385  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2176  hypothetical protein  31.9 
 
 		 240 aa  94  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979062  normal  0.0387048 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1202  hypothetical protein  48.42 
 
 		 142 aa  92.8  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1076  hypothetical protein  32.5 
 
 		 203 aa  91.3  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.980272  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1395  membrane protein,putative  55.41 
 
 		 116 aa  89.4  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1288  protein of unknown function DUF1294  47.12 
 
 		 116 aa  89  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.31647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3088  hypothetical protein  55.41 
 
 		 116 aa  89  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3231  hypothetical protein  55.41 
 
 		 116 aa  89  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1030  cold shock DNA-binding domain-containing protein  54.93 
 
 		 111 aa  85.1  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00724956  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2709  protein of unknown function DUF1294  48.84 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.746611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1894  hypothetical protein  36.8 
 
 		 134 aa  80.9  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4331  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2154  hypothetical protein  50.51 
 
 		 164 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0190416 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2226  protein of unknown function DUF1294  51.52 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18219  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47535  predicted protein  44.93 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39180  hypothetical protein  46.05 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.287403 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1556  hypothetical protein  51.47 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.719633  hitchhiker  0.00000000539156 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3044  hypothetical protein  54.55 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3007  hypothetical protein  46.67 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.943547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2603  hypothetical protein  43.94 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3140  hypothetical protein  47.83 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0149218  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2863  hypothetical protein  46.38 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2755  hypothetical protein  42.11 
 
 		 145 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2826  hypothetical protein  44.93 
 
 		 137 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2918  hypothetical protein  40 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1811  cyanate transport  35.35 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1020  hypothetical protein  43.21 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.967949  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1525  cyanate transport  46.77 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0579567  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1709  cyanate transport  41.25 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  0.0124774 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1751  cyanate transport  46.77 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.715256  normal  0.132365 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3425  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  37.78 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2743  protein of unknown function DUF1294  36.99 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1142  hypothetical protein  46.97 
 
 		 135 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1898  hypothetical protein  37.3 
 
 		 165 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.521707 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1748  cyanate transport  40 
 
 		 114 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.262334  normal  0.159952 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0875  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  41.54 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1662  hypothetical protein  39.51 
 
 		 115 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580937  normal  0.652065 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3544  cold-shock DNA-binding protein family protein  34.12 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3043  protein of unknown function DUF1294  41.89 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.816761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0690  cold shock DNA-binding domain-containing protein  43.02 
 
 		 117 aa  54.3  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1721  protein of unknown function DUF1294  44.29 
 
 		 103 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3678  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  33.68 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1304  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.94 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.366521  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3373  cold-shock DNA-binding protein family protein  32.56 
 
 		 185 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2948  protein of unknown function DUF1294  52.08 
 
 		 124 aa  52  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1275  protein of unknown function DUF1294  52.08 
 
 		 120 aa  52  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0733  cold shock domain-contain protein  36.78 
 
 		 203 aa  51.6  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0537  cold-shock DNA-binding protein family protein  36.51 
 
 		 195 aa  51.6  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120085  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0580  cold-shock DNA-binding protein family protein  33.72 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6292  cold-shock DNA-binding domain protein  39.71 
 
 		 67 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.392497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0647  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  37.97 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06258  integral membrane protein  40 
 
 		 60 aa  50.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0533489  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0441  cold-shock protein, DNA-binding  30.33 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00249195  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2410  hypothetical protein  37.66 
 
 		 90 aa  50.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0485  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  35.23 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01099  integral membrane protein  40 
 
 		 60 aa  50.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0894512  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5433  cold-shock DNA-binding domain protein  40.91 
 
 		 67 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0949203  hitchhiker  0.00613475 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5163  cold-shock DNA-binding domain protein  42.42 
 
 		 67 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160929  normal  0.551155 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2278  protein of unknown function DUF1294  38.46 
 
 		 94 aa  49.3  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0680  cold-shock DNA-binding domain protein  43.33 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3697  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.33 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0689  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.33 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3103  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  37.21 
 
 		 186 aa  48.5  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0104717 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2628  hypothetical protein  42.86 
 
 		 90 aa  48.5  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105894  normal  0.375374 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3355  cold-shock DNA-binding protein family protein  24.86 
 
 		 193 aa  48.5  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0716  protein of unknown function DUF1294  43.4 
 
 		 92 aa  48.5  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2874  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  37.68 
 
 		 68 aa  48.5  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0659  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 217 aa  48.1  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0848  cold-shock DNA-binding domain protein  38.6 
 
 		 127 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.433224  decreased coverage  0.00674689 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2147  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  31.34 
 
 		 68 aa  47.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.135641  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2873  cold-shock DNA-binding protein family protein  45 
 
 		 70 aa  47.4  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0554  hypothetical protein  35.82 
 
 		 70 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000831877  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0292  guanine-specific ribonuclease  27.46 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3086  cold shock protein  37.88 
 
 		 67 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4535  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  34.85 
 
 		 68 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>