More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2966 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2966  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  434  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1832  cold-shock DNA-binding domain protein  41.27 
 
 		 204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0148  cold shock DNA-binding domain-containing protein  36.55 
 
 		 201 aa  144  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2482  cold-shock DNA-binding domain protein  42.79 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1412  cold-shock DNA-binding domain protein  40.4 
 
 		 204 aa  142  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2628  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  35.27 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.326591  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2851  hypothetical protein  33.49 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2028  cold shock DNA-binding domain-containing protein  40.93 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3336  hypothetical protein  39.9 
 
 		 238 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.928903  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3443  cold-shock protein, DNA-binding:protein of unknown function DUF1294  37.56 
 
 		 206 aa  129  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2865  hypothetical protein  37.04 
 
 		 196 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00327413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5254  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  37.73 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.737386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2176  hypothetical protein  40.09 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979062  normal  0.0387048 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3494  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  37.67 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0199101  normal  0.508028 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1103  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  38.54 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.984456 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0927  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  34.78 
 
 		 205 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0400  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  30.88 
 
 		 223 aa  118  6e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.666449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1327  cold-shock DNA-binding domain protein  33 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1356  cold-shock DNA-binding domain protein  33 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728005 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2151  cold-shock domain-contain protein  35.03 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2455  protein of unknown function DUF1294  34.22 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3140  hypothetical protein  50 
 
 		 156 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0149218  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39180  hypothetical protein  55.56 
 
 		 144 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.287403 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3007  hypothetical protein  55.13 
 
 		 144 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.943547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1556  hypothetical protein  46.15 
 
 		 91 aa  83.6  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.719633  hitchhiker  0.00000000539156 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2603  hypothetical protein  48.48 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3079  hypothetical protein  34.01 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.661385  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1395  membrane protein,putative  42.57 
 
 		 116 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1076  hypothetical protein  32.86 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.980272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2883  hypothetical protein  46.34 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.384269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0957  hypothetical protein  41.05 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.35989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0090  hypothetical protein  54.79 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3231  hypothetical protein  45.88 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1030  cold shock DNA-binding domain-containing protein  38.38 
 
 		 111 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00724956  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2755  hypothetical protein  54.17 
 
 		 145 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3088  hypothetical protein  45.88 
 
 		 116 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1288  protein of unknown function DUF1294  45.88 
 
 		 116 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.31647 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2800  hypothetical protein  36.3 
 
 		 157 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1202  hypothetical protein  46.34 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2979  hypothetical protein  45.12 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2863  hypothetical protein  47.25 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2918  hypothetical protein  49.41 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2826  hypothetical protein  46.15 
 
 		 137 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4331  hypothetical protein  46.34 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3044  hypothetical protein  45.95 
 
 		 116 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1894  hypothetical protein  35.24 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1811  cyanate transport  46.38 
 
 		 114 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47535  predicted protein  52.46 
 
 		 155 aa  70.5  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2709  protein of unknown function DUF1294  42.86 
 
 		 96 aa  70.5  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.746611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2226  protein of unknown function DUF1294  48.44 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18219  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2743  protein of unknown function DUF1294  41.25 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1525  cyanate transport  52.54 
 
 		 114 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0579567  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1709  cyanate transport  50.85 
 
 		 114 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  0.0124774 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1751  cyanate transport  50.85 
 
 		 114 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.715256  normal  0.132365 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1748  cyanate transport  50.85 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.262334  normal  0.159952 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1662  hypothetical protein  44.16 
 
 		 115 aa  64.3  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580937  normal  0.652065 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2154  hypothetical protein  43.9 
 
 		 164 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0190416 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4942  protein of unknown function DUF1294  33.64 
 
 		 124 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1020  hypothetical protein  38.96 
 
 		 89 aa  60.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.967949  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0875  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  41.79 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0537  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.84 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120085  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1898  hypothetical protein  44.19 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.521707 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0679  cold-shock DNA-binding protein family protein  47.69 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.233328  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0545  cold-shock DNA-binding domain protein  38.38 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.803384  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0586  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  52.38 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2951  cold-shock DNA-binding protein family protein  50.91 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.15288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2852  protein of unknown function DUF1294  37.66 
 
 		 96 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000138701  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3156  cold shock protein  40.85 
 
 		 71 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06258  integral membrane protein  45.76 
 
 		 60 aa  54.3  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0533489  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6907  cold-shock DNA-binding domain protein  47.69 
 
 		 67 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240211  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01099  integral membrane protein  45.76 
 
 		 60 aa  54.3  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0894512  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2135  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.33 
 
 		 70 aa  54.3  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24851  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1514  cold-shock family protein  43.33 
 
 		 71 aa  53.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1388  cold-shock DNA-binding protein family protein  49.21 
 
 		 67 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000202704  normal  0.239262 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0716  protein of unknown function DUF1294  36.78 
 
 		 92 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4506  hypothetical protein  39.47 
 
 		 120 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1668  cold-shock DNA-binding protein family protein  47.69 
 
 		 67 aa  53.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000281076  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2873  cold-shock DNA-binding protein family protein  44.64 
 
 		 70 aa  53.9  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1112  cold shock transcription regulator protein  47.69 
 
 		 81 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000170415  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0761  cold-shock domain-contain protein  47.69 
 
 		 81 aa  53.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.00000000000025188  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1374  cold-shock DNA-binding domain protein  47.69 
 
 		 67 aa  53.1  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.287556  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1650  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.33 
 
 		 71 aa  52.8  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6292  cold-shock DNA-binding domain protein  45 
 
 		 67 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.392497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4151  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  49.12 
 
 		 67 aa  52.8  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19776  normal  0.285903 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4386  cold-shock DNA-binding domain protein  50 
 
 		 67 aa  52.4  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4276  cold-shock DNA-binding domain protein  50 
 
 		 67 aa  52.4  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6028  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.67 
 
 		 67 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2874  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.16 
 
 		 68 aa  52.4  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1304  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.366521  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6014  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.67 
 
 		 67 aa  52  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0958  cold shock protein  47.69 
 
 		 67 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.000000000000117939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2279  cold-shock domain-contain protein  47.69 
 
 		 67 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000000750079  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2156  cold-shock domain-contain protein  47.69 
 
 		 67 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000351487  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0567  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.97 
 
 		 68 aa  52  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000101913  hitchhiker  0.000143899 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0574  cold-shock domain-contain protein  47.69 
 
 		 67 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000358394  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1051  cold-shock domain-contain protein  47.69 
 
 		 67 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117316  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0775  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.69 
 
 		 67 aa  52  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150831  hitchhiker  0.000000000149768 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3544  cold-shock DNA-binding protein family protein  36.23 
 
 		 192 aa  52  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3167  cold-shock DNA-binding domain protein  47.62 
 
 		 68 aa  52  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493488  hitchhiker  0.00220171 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2438  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.69 
 
 		 67 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.00000000000180609  unclonable  0.0000000000176576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>