77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2755 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2755  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  290  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2826  hypothetical protein  73.1 
 
 		 137 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2918  hypothetical protein  71.03 
 
 		 137 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486235  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2863  hypothetical protein  77.6 
 
 		 125 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2603  hypothetical protein  52.86 
 
 		 142 aa  151  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3140  hypothetical protein  52.17 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0149218  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3336  hypothetical protein  61.76 
 
 		 238 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.928903  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39180  hypothetical protein  61.54 
 
 		 144 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.287403 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3007  hypothetical protein  50.72 
 
 		 144 aa  114  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.943547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1356  cold-shock DNA-binding domain protein  50 
 
 		 211 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728005 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1327  cold-shock DNA-binding domain protein  50 
 
 		 209 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47535  predicted protein  40.8 
 
 		 155 aa  94  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2151  cold-shock domain-contain protein  46.32 
 
 		 225 aa  88.6  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5254  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  52.38 
 
 		 219 aa  86.7  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.737386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2176  hypothetical protein  65 
 
 		 240 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979062  normal  0.0387048 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1832  cold-shock DNA-binding domain protein  49.32 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3494  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  54.05 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0199101  normal  0.508028 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3443  cold-shock protein, DNA-binding:protein of unknown function DUF1294  50.67 
 
 		 206 aa  80.9  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2966  hypothetical protein  54.17 
 
 		 214 aa  80.9  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2455  protein of unknown function DUF1294  41.73 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2800  hypothetical protein  37.8 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1202  hypothetical protein  35.2 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0148  cold shock DNA-binding domain-containing protein  36.94 
 
 		 201 aa  77.8  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2979  hypothetical protein  39.02 
 
 		 172 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2883  hypothetical protein  38.52 
 
 		 167 aa  77  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.384269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2865  hypothetical protein  47.37 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00327413  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0090  hypothetical protein  53.42 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1412  cold-shock DNA-binding domain protein  55.56 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3079  hypothetical protein  38.76 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.661385  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3231  hypothetical protein  45 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1395  membrane protein,putative  45 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3088  hypothetical protein  45 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2482  cold-shock DNA-binding domain protein  52.31 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2628  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  34.4 
 
 		 237 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.326591  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1894  hypothetical protein  35.65 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1288  protein of unknown function DUF1294  44 
 
 		 116 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.31647 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1076  hypothetical protein  55.41 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.980272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3044  hypothetical protein  42.5 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0400  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  33.06 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.666449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2226  protein of unknown function DUF1294  55 
 
 		 120 aa  70.1  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18219  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2709  protein of unknown function DUF1294  51.56 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.746611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2851  hypothetical protein  29.92 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1898  hypothetical protein  51.19 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.521707 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2743  protein of unknown function DUF1294  49.25 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4331  hypothetical protein  48.48 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1103  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.07 
 
 		 203 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.984456 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0927  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  32 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0957  hypothetical protein  44.29 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.35989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1556  hypothetical protein  39.19 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.719633  hitchhiker  0.00000000539156 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2028  cold shock DNA-binding domain-containing protein  48.61 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1030  cold shock DNA-binding domain-containing protein  43.06 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00724956  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1020  hypothetical protein  39.29 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.967949  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2410  hypothetical protein  39.47 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1811  cyanate transport  40 
 
 		 114 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1709  cyanate transport  42.37 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  0.0124774 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1525  cyanate transport  42.37 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0579567  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1751  cyanate transport  42.37 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.715256  normal  0.132365 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1721  protein of unknown function DUF1294  45.71 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1748  cyanate transport  42.37 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.262334  normal  0.159952 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0626  hypothetical protein  43.28 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1662  hypothetical protein  42.65 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580937  normal  0.652065 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2154  hypothetical protein  47.37 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0190416 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4942  protein of unknown function DUF1294  43.94 
 
 		 124 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0716  protein of unknown function DUF1294  37.68 
 
 		 92 aa  50.1  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1142  hypothetical protein  46.88 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2791  protein of unknown function DUF1294  35.37 
 
 		 100 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0469638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2852  protein of unknown function DUF1294  38.98 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000138701  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4506  hypothetical protein  33.85 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1740  hypothetical protein  36.21 
 
 		 93 aa  47  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1275  protein of unknown function DUF1294  45.65 
 
 		 120 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2278  protein of unknown function DUF1294  32.69 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2948  protein of unknown function DUF1294  51.28 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0204  hypothetical protein  30.65 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0554  hypothetical protein  31.25 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000831877  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1476  protein of unknown function DUF1294  33.33 
 
 		 80 aa  42  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2628  hypothetical protein  33.8 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105894  normal  0.375374 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1548  hypothetical protein  25.33 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.399307  normal  0.190355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>