156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2151 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2151  cold-shock domain-contain protein  100 
 
 		 225 aa  456  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3336  hypothetical protein  37.66 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.928903  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1832  cold-shock DNA-binding domain protein  38.89 
 
 		 204 aa  128  8.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1327  cold-shock DNA-binding domain protein  35 
 
 		 209 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1356  cold-shock DNA-binding domain protein  35.15 
 
 		 211 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728005 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1412  cold-shock DNA-binding domain protein  38.66 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2865  hypothetical protein  38.5 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00327413  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2482  cold-shock DNA-binding domain protein  36.41 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2628  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  36.32 
 
 		 237 aa  115  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.326591  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2851  hypothetical protein  29.81 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0148  cold shock DNA-binding domain-containing protein  31.98 
 
 		 201 aa  111  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1103  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  36.79 
 
 		 203 aa  111  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.984456 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2028  cold shock DNA-binding domain-containing protein  36.46 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3443  cold-shock protein, DNA-binding:protein of unknown function DUF1294  37.31 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0927  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  37.06 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5254  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  35.58 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.737386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0400  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  29.44 
 
 		 223 aa  98.6  7e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.666449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2966  hypothetical protein  34.48 
 
 		 214 aa  98.2  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3494  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  34.12 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0199101  normal  0.508028 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2176  hypothetical protein  34.88 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979062  normal  0.0387048 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39180  hypothetical protein  54.88 
 
 		 144 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.287403 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2603  hypothetical protein  48 
 
 		 142 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2755  hypothetical protein  48.28 
 
 		 145 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2455  protein of unknown function DUF1294  31.61 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2863  hypothetical protein  51.28 
 
 		 125 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1076  hypothetical protein  31.22 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.980272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2826  hypothetical protein  48.72 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3007  hypothetical protein  41.84 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.943547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2918  hypothetical protein  43.68 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0647  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  57.35 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4331  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0733  cold shock domain-contain protein  46.88 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3140  hypothetical protein  46.07 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0149218  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1030  cold shock DNA-binding domain-containing protein  45.57 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00724956  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3103  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.24 
 
 		 186 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0104717 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3544  cold-shock DNA-binding protein family protein  53.73 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3079  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.661385  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1894  hypothetical protein  41.77 
 
 		 134 aa  71.2  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3373  cold-shock DNA-binding protein family protein  52.94 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0090  hypothetical protein  45.21 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3231  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1288  protein of unknown function DUF1294  50 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.31647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0659  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  52.94 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3088  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1395  membrane protein,putative  50 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2226  protein of unknown function DUF1294  50 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18219  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0485  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2709  protein of unknown function DUF1294  43.33 
 
 		 96 aa  68.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.746611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0680  cold-shock DNA-binding domain protein  46.75 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3647  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3697  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  51.47 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4295  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  49.3 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47535  predicted protein  43.96 
 
 		 155 aa  67  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0689  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.75 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1202  hypothetical protein  48.44 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0580  cold-shock DNA-binding protein family protein  49.3 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0957  hypothetical protein  39.13 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.35989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2883  hypothetical protein  45.31 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.384269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3425  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  41.86 
 
 		 276 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2800  hypothetical protein  45.31 
 
 		 157 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3678  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 		 188 aa  64.7  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2979  hypothetical protein  43.75 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1556  hypothetical protein  45.71 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.719633  hitchhiker  0.00000000539156 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3044  hypothetical protein  38.36 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3278  hypothetical protein  39.78 
 
 		 274 aa  61.6  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0154434  hitchhiker  0.000533264 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0441  cold-shock protein, DNA-binding  42.17 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00249195  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1142  hypothetical protein  45 
 
 		 135 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0545  cold-shock DNA-binding domain protein  48.15 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.803384  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1811  cyanate transport  35.62 
 
 		 114 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2743  protein of unknown function DUF1294  36.84 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1751  cyanate transport  39.68 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.715256  normal  0.132365 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1709  cyanate transport  37.84 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  0.0124774 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1525  cyanate transport  39.68 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0579567  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1748  cyanate transport  37.84 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.262334  normal  0.159952 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2948  protein of unknown function DUF1294  50.82 
 
 		 124 aa  54.7  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1898  hypothetical protein  43.42 
 
 		 165 aa  54.7  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.521707 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1662  hypothetical protein  35.11 
 
 		 115 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580937  normal  0.652065 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2410  hypothetical protein  42.86 
 
 		 90 aa  53.1  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1275  protein of unknown function DUF1294  50.85 
 
 		 120 aa  53.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01099  integral membrane protein  48.21 
 
 		 60 aa  52.4  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0894512  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1486  cold-shock protein  48.57 
 
 		 176 aa  52.4  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00940094  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06258  integral membrane protein  48.21 
 
 		 60 aa  52.4  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0533489  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0537  cold-shock DNA-binding protein family protein  32.56 
 
 		 195 aa  51.6  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120085  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2628  hypothetical protein  35.06 
 
 		 90 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105894  normal  0.375374 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2024  cold-shock DNA-binding protein family protein  41.82 
 
 		 68 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0735  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  41.82 
 
 		 68 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.976411  normal  0.373537 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0626  hypothetical protein  44.44 
 
 		 97 aa  50.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2154  hypothetical protein  41.86 
 
 		 164 aa  50.1  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0190416 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4942  protein of unknown function DUF1294  41.27 
 
 		 124 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3355  cold-shock DNA-binding protein family protein  31.78 
 
 		 193 aa  48.5  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3653  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.64 
 
 		 80 aa  48.5  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.820165  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1721  protein of unknown function DUF1294  44.12 
 
 		 103 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3620  cold-shock DNA-binding protein  41.67 
 
 		 68 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1548  hypothetical protein  31.4 
 
 		 91 aa  48.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.399307  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4329  hypothetical protein  40 
 
 		 68 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.208733 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3043  protein of unknown function DUF1294  37.5 
 
 		 92 aa  47.8  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.816761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3140  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  40.35 
 
 		 68 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.577228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4290  hypothetical protein  41.67 
 
 		 68 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1020  hypothetical protein  36.49 
 
 		 89 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.967949  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1893  cold-shock protein DNA-binding  41.51 
 
 		 69 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>