215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1327 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1327  cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 		 209 aa  433  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1356  cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 		 211 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728005 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1412  cold-shock DNA-binding domain protein  40.7 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2865  hypothetical protein  40.91 
 
 		 196 aa  142  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00327413  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3336  hypothetical protein  38.28 
 
 		 238 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.928903  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2151  cold-shock domain-contain protein  37.44 
 
 		 225 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5254  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  40.39 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.737386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2628  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  35.19 
 
 		 237 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.326591  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1103  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  37.24 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.984456 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0148  cold shock DNA-binding domain-containing protein  34.33 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1832  cold-shock DNA-binding domain protein  35.68 
 
 		 204 aa  125  7e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2482  cold-shock DNA-binding domain protein  34.01 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2851  hypothetical protein  35.2 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2028  cold shock DNA-binding domain-containing protein  36.65 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3443  cold-shock protein, DNA-binding:protein of unknown function DUF1294  36.14 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0927  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  37.31 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0400  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  31.71 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.666449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2755  hypothetical protein  49.5 
 
 		 145 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3494  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  33.49 
 
 		 224 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0199101  normal  0.508028 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2966  hypothetical protein  32.52 
 
 		 214 aa  101  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2176  hypothetical protein  34.25 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979062  normal  0.0387048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2918  hypothetical protein  47.52 
 
 		 137 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2826  hypothetical protein  47.52 
 
 		 137 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2863  hypothetical protein  47.52 
 
 		 125 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2455  protein of unknown function DUF1294  34.52 
 
 		 204 aa  98.2  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2603  hypothetical protein  42.34 
 
 		 142 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3007  hypothetical protein  46.15 
 
 		 144 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.943547  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3140  hypothetical protein  41.74 
 
 		 156 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0149218  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39180  hypothetical protein  52.33 
 
 		 144 aa  92  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.287403 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1076  hypothetical protein  35.75 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.980272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3079  hypothetical protein  39.04 
 
 		 179 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.661385  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2883  hypothetical protein  41.6 
 
 		 167 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.384269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2800  hypothetical protein  42.62 
 
 		 157 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2979  hypothetical protein  44.76 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1202  hypothetical protein  38.79 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1288  protein of unknown function DUF1294  46.32 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.31647 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3231  hypothetical protein  45.26 
 
 		 116 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3088  hypothetical protein  45.26 
 
 		 116 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1395  membrane protein,putative  52.17 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2226  protein of unknown function DUF1294  47.06 
 
 		 120 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18219  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1894  hypothetical protein  41.28 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0090  hypothetical protein  44.3 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1030  cold shock DNA-binding domain-containing protein  47.14 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00724956  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3544  cold-shock DNA-binding protein family protein  40.22 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2743  protein of unknown function DUF1294  50.68 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4331  hypothetical protein  44.44 
 
 		 98 aa  71.2  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47535  predicted protein  47.89 
 
 		 155 aa  71.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3373  cold-shock DNA-binding protein family protein  40.86 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3103  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  38.98 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0104717 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3425  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  41 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0733  cold shock domain-contain protein  48.48 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1556  hypothetical protein  40 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.719633  hitchhiker  0.00000000539156 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3044  hypothetical protein  36.84 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3278  hypothetical protein  37.38 
 
 		 274 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0154434  hitchhiker  0.000533264 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0485  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  41.46 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0957  hypothetical protein  42.47 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.35989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0659  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  41.46 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2709  protein of unknown function DUF1294  43.75 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.746611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0580  cold-shock DNA-binding protein family protein  44.93 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0647  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  41.11 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3678  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  40.74 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0680  cold-shock DNA-binding domain protein  40.24 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3647  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0689  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  40.24 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1898  hypothetical protein  36.3 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.521707 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3697  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  40.24 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0545  cold-shock DNA-binding domain protein  36.79 
 
 		 168 aa  60.5  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.803384  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2154  hypothetical protein  43.3 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0190416 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4295  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.03 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1662  hypothetical protein  37.68 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580937  normal  0.652065 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0875  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  29.85 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0441  cold-shock protein, DNA-binding  35.8 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00249195  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3355  cold-shock DNA-binding protein family protein  32.41 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1811  cyanate transport  34.74 
 
 		 114 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2147  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  36.07 
 
 		 68 aa  52.8  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.135641  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4942  protein of unknown function DUF1294  36.14 
 
 		 124 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0537  cold-shock DNA-binding protein family protein  34.43 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120085  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0716  protein of unknown function DUF1294  33.33 
 
 		 92 aa  52.4  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1721  protein of unknown function DUF1294  38.1 
 
 		 103 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2791  protein of unknown function DUF1294  40 
 
 		 100 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0469638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1548  hypothetical protein  31.17 
 
 		 91 aa  50.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.399307  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1304  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.68 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.366521  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2681  cold-shock DNA-binding domain protein  40.62 
 
 		 68 aa  50.1  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.741556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2628  hypothetical protein  34.72 
 
 		 90 aa  49.7  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105894  normal  0.375374 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5491  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  40 
 
 		 69 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599855  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1709  cyanate transport  33.71 
 
 		 114 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  0.0124774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1810  cold-shock DNA-binding domain protein  41.54 
 
 		 69 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275955  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1525  cyanate transport  38.33 
 
 		 114 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0579567  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1142  hypothetical protein  39.39 
 
 		 135 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1751  cyanate transport  38.33 
 
 		 114 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.715256  normal  0.132365 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06258  integral membrane protein  37.93 
 
 		 60 aa  48.5  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0533489  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01099  integral membrane protein  37.93 
 
 		 60 aa  48.5  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0894512  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1748  cyanate transport  33.71 
 
 		 114 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.262334  normal  0.159952 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1798  cold-shock DNA-binding domain protein  38.46 
 
 		 69 aa  47.8  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2410  hypothetical protein  38.1 
 
 		 90 aa  47.8  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2278  protein of unknown function DUF1294  32 
 
 		 94 aa  47.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1893  cold-shock protein DNA-binding  61.76 
 
 		 69 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1752  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.1 
 
 		 68 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0932  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  36.23 
 
 		 68 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4677  cold-shock DNA-binding domain protein  47.5 
 
 		 69 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.403947  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>