91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2278 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2278  protein of unknown function DUF1294  100 
 
 
94 aa  186  7e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1412  hypothetical protein  44.58 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0554  hypothetical protein  61.67 
 
 
70 aa  77  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000831877  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2479  protein of unknown function DUF1294  53.85 
 
 
88 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0517  hypothetical protein  48.78 
 
 
87 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0801  protein of unknown function DUF1294  41.56 
 
 
83 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1740  hypothetical protein  44.78 
 
 
93 aa  70.1  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0531  hypothetical protein  47.56 
 
 
87 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2852  protein of unknown function DUF1294  38.55 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000138701  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1556  hypothetical protein  40.7 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.719633  hitchhiker  0.00000000539156 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2657  protein of unknown function DUF1294  45.68 
 
 
85 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511085  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1142  hypothetical protein  33.75 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3318  hypothetical protein  48.65 
 
 
82 aa  58.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3568  hypothetical protein  48.65 
 
 
82 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.641066 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3585  hypothetical protein  47.3 
 
 
82 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0716  protein of unknown function DUF1294  37.66 
 
 
92 aa  57.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2628  hypothetical protein  37.66 
 
 
90 aa  57.4  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105894  normal  0.375374 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3443  cold-shock protein, DNA-binding:protein of unknown function DUF1294  41.27 
 
 
206 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1832  cold-shock DNA-binding domain protein  36.92 
 
 
204 aa  57  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1412  cold-shock DNA-binding domain protein  40 
 
 
204 aa  57  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1649  hypothetical protein  47.3 
 
 
82 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0204  hypothetical protein  45.76 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1020  hypothetical protein  43.42 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.967949  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3268  hypothetical protein  47.3 
 
 
82 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0756935  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3575  hypothetical protein  45.95 
 
 
82 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0148  cold shock DNA-binding domain-containing protein  38.46 
 
 
201 aa  55.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3354  hypothetical protein  47.3 
 
 
82 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.175891  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3668  hypothetical protein  45.95 
 
 
82 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3263  hypothetical protein  44.87 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.446998  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1811  cyanate transport  36.25 
 
 
114 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4331  hypothetical protein  36.92 
 
 
98 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2226  protein of unknown function DUF1294  51.02 
 
 
120 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18219  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3044  hypothetical protein  48.28 
 
 
116 aa  54.3  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1030  cold shock DNA-binding domain-containing protein  40.62 
 
 
111 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00724956  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2709  protein of unknown function DUF1294  41.27 
 
 
96 aa  53.9  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.746611  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1525  cyanate transport  37.7 
 
 
114 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0579567  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1751  cyanate transport  37.7 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.715256  normal  0.132365 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1721  protein of unknown function DUF1294  39.73 
 
 
103 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1395  membrane protein,putative  44.07 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4506  hypothetical protein  34.72 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1709  cyanate transport  37.7 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  0.0124774 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1103  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.11 
 
 
203 aa  52  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.984456 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3043  protein of unknown function DUF1294  44.26 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.816761  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2883  hypothetical protein  33.75 
 
 
167 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.384269  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2800  hypothetical protein  38.16 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2628  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  40 
 
 
237 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.326591  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1202  hypothetical protein  42.19 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1169  hypothetical protein  38.57 
 
 
93 aa  52.8  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.129311  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0577  hypothetical protein  38.16 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.773854  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1338  hypothetical protein  50 
 
 
91 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00413019  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1288  protein of unknown function DUF1294  42.37 
 
 
116 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.31647 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3231  hypothetical protein  42.37 
 
 
116 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3088  hypothetical protein  42.37 
 
 
116 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1748  cyanate transport  37.7 
 
 
114 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.262334  normal  0.159952 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3079  hypothetical protein  42.37 
 
 
179 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.661385  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2410  hypothetical protein  35.9 
 
 
90 aa  51.6  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3615  hypothetical protein  53.33 
 
 
66 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.516703  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0957  hypothetical protein  37.7 
 
 
178 aa  50.8  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.35989  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2979  hypothetical protein  39.66 
 
 
172 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4942  protein of unknown function DUF1294  38.98 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2603  hypothetical protein  33.96 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2826  hypothetical protein  36.54 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0927  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  38.46 
 
 
205 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1894  hypothetical protein  34.38 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3494  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  37.5 
 
 
224 aa  48.9  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0199101  normal  0.508028 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2851  hypothetical protein  37.68 
 
 
207 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2863  hypothetical protein  36.54 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1327  cold-shock DNA-binding domain protein  32 
 
 
209 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1356  cold-shock DNA-binding domain protein  32 
 
 
211 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000728005 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1662  hypothetical protein  30.77 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580937  normal  0.652065 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1476  protein of unknown function DUF1294  50 
 
 
80 aa  47.4  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2865  hypothetical protein  36.92 
 
 
196 aa  47  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00327413  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2482  cold-shock DNA-binding domain protein  45.65 
 
 
204 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2918  hypothetical protein  34.62 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486235  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2028  cold shock DNA-binding domain-containing protein  29.51 
 
 
203 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344773  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0400  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  30.43 
 
 
223 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.666449  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2755  hypothetical protein  32.69 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0626  hypothetical protein  41.18 
 
 
97 aa  45.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0090  hypothetical protein  35.85 
 
 
107 aa  44.7  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2743  protein of unknown function DUF1294  33.85 
 
 
182 aa  44.3  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5254  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.59 
 
 
219 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.737386  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3336  hypothetical protein  33.9 
 
 
238 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.928903  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0272  hypothetical protein  44.64 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0690  cold shock DNA-binding domain-containing protein  48.89 
 
 
117 aa  41.6  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3140  hypothetical protein  32.26 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0149218  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47535  predicted protein  30.51 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0699  protein of unknown function DUF1294  39.24 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1548  hypothetical protein  34.33 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.399307  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39180  hypothetical protein  33.9 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.287403 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2176  hypothetical protein  40.91 
 
 
240 aa  40.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979062  normal  0.0387048 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2151  cold-shock domain-contain protein  31.58 
 
 
225 aa  40.4  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>