35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1169 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1169  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  180  7e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.129311  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0636  hypothetical protein  51.22 
 
 		 91 aa  67  0.00000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0272  hypothetical protein  47.3 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2278  protein of unknown function DUF1294  36.56 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2628  hypothetical protein  45.71 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105894  normal  0.375374 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1548  hypothetical protein  38.98 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.399307  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1811  cyanate transport  34.25 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1556  hypothetical protein  35.9 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.719633  hitchhiker  0.00000000539156 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1751  cyanate transport  41.67 
 
 		 114 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.715256  normal  0.132365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1525  cyanate transport  41.67 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0579567  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1709  cyanate transport  41.67 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  0.0124774 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3043  protein of unknown function DUF1294  44.12 
 
 		 92 aa  50.4  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.816761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0716  protein of unknown function DUF1294  40.62 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1662  hypothetical protein  36.76 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580937  normal  0.652065 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1832  cold-shock DNA-binding domain protein  34.07 
 
 		 204 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1748  cyanate transport  41.67 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.262334  normal  0.159952 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2410  hypothetical protein  40 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1476  protein of unknown function DUF1294  45.9 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0927  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  41.89 
 
 		 205 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2479  protein of unknown function DUF1294  37.31 
 
 		 88 aa  44.3  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2709  protein of unknown function DUF1294  37.84 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.746611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1721  protein of unknown function DUF1294  39.62 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2482  cold-shock DNA-binding domain protein  32.86 
 
 		 204 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0626  hypothetical protein  40.62 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1412  cold-shock DNA-binding domain protein  31.82 
 
 		 204 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2226  protein of unknown function DUF1294  31.94 
 
 		 120 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18219  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1020  hypothetical protein  32.14 
 
 		 89 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.967949  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2028  cold shock DNA-binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 203 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1740  hypothetical protein  43.48 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1894  hypothetical protein  34.15 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0148  cold shock DNA-binding domain-containing protein  34.94 
 
 		 201 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1412  hypothetical protein  35.06 
 
 		 88 aa  40.4  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2852  protein of unknown function DUF1294  34.29 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000138701  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2628  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  32.58 
 
 		 237 aa  40.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.326591  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2826  hypothetical protein  39.39 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>